New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3487390 = | 98 (1.050) | 5 (0.060) | 5/238 | NT | 5.7% | coding (664/1344 nt) | PP_3093 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3487454 = | 73 (0.820) | coding (600/1344 nt) | PP_3093 | hypothetical protein |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACCAGCAGTACGACGTTC > NC_002947/3487307‑3487601 | ggCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAAt < 2:1758393/150‑1 (MQ=255) gCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATg > 2:818228/1‑150 (MQ=255) gCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATg > 2:818217/1‑150 (MQ=255) gCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCAGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATg > 2:1326945/1‑150 (MQ=255) gCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGAGGGCCATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCCTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATg > 1:1774121/1‑150 (MQ=255) cACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATgg > 2:1187434/1‑150 (MQ=255) aCCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTgg > 2:2075364/1‑150 (MQ=255) ccGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGc > 2:383370/1‑150 (MQ=255) gtgtTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTg < 1:35996/150‑1 (MQ=255) tgtTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGTGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGc > 1:1273170/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGccc < 1:2028294/150‑1 (MQ=255) gcagcCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGt < 1:923865/150‑1 (MQ=255) gcagcCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCCTAG‑CTTCCGCATGCGCGATCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCGCGTGGCTGCCCAGGt < 2:1165605/150‑1 (MQ=255) agcCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGc > 2:820138/1‑150 (MQ=255) gAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGACGGGCGC‑CGAGCAGGCGTGTACTGAGACCTGCAAGGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggt < 2:24941/150‑1 (MQ=255) aaCAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCg > 2:2399057/1‑129 (MQ=255) cAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggtggg < 1:2115926/150‑1 (MQ=255) gggTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggtggggt < 1:963413/150‑1 (MQ=255) 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gTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACca > 1:342276/1‑150 (MQ=255) gTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGCCACCGTCTACca > 1:110206/1‑150 (MQ=255) tttGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCgtgt > 1:276323/1‑96 (MQ=255) tttGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCgtgt > 1:276100/1‑96 (MQ=255) tttGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCgtgt < 2:276323/96‑1 (MQ=255) tttGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCgtgt < 2:276100/96‑1 (MQ=255) gCCGATGCCGGCAATGTTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGCTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACcagcag > 2:2312400/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTCGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACcagcag > 2:1375115/1‑150 (MQ=255) cGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACCAGCAGTa < 1:506723/150‑1 (MQ=255) cGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGCTAGACCTTGGTGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACCAGCAGTa < 2:1774121/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACCAGCAGTacg > 1:508972/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACCAGCAGTacga < 1:383370/150‑1 (MQ=255) ggcAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACCAGCAGTACGACGtt > 1:787134‑M2/4‑150 (MQ=255) ggcAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACCAGCAGTACGACGtt > 2:799557‑M2/4‑150 (MQ=255) gcAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACCAGCAGTACGACGTTc > 1:1227397‑M2/3‑150 (MQ=255) | GGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGCCGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGTGTCAGCTTGGCCAGAGGGCAGTGGCTGTAACCGTCGAGGCTGTCACCGTCGACCAGCAGTACGACGTTC > NC_002947/3487307‑3487601 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |