New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4071847 | 87 (0.930) | 5 (0.050) | 5/244 | NT | 5.5% | coding (356/3099 nt) | mdtB | multidrug transporter membrane protein |
? | NC_002947 | = 4071885 | 88 (0.970) | coding (318/3099 nt) | mdtB | multidrug transporter membrane protein |
TCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACGGCGCTGGTCATCAC > NC_002947/4071736‑4072031 | tCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGt < 2:406529/150‑1 (MQ=255) tCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGt < 2:1226846/150‑1 (MQ=255) gAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTc < 1:740876/150‑1 (MQ=255) 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tGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGa < 1:1955799/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGa < 1:1926470/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGa < 2:780208/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAg < 2:2169314/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAg < 2:2446503/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTA‑ACATATCGTCTGGATTTTTTCACTGGCCAGCAGGTTCCTGGAGGCGATAATAGCGGCTTCCA‑CCTGGTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAg < 1:1125015/150‑1 (MQ=255) tGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTc < 2:1135395/145‑1 (MQ=255) tGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTc > 1:1135395/1‑145 (MQ=255) tGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGt > 1:1628088/1‑150 (MQ=255) tGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGt > 2:703507/1‑150 (MQ=255) 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gCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCTCGGCATCTGGc > 2:1015538/1‑134 (MQ=255) gCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCTCGGCATCTGGc < 1:1015538/134‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGTTGGTCGCGGCCTGCAACCTGCtgcccagtgacctgccggcaccgccggtgtacaacaaggtcaacccggccgacaccccggtgctgaccctggccatctccagcaagaccatgccgctgcccaagctcaaagacatggtc < 1:1696255‑M2/150‑120 (MQ=255) tGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAgcg < 2:1712621/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAgcg > 2:2280045/1‑150 (MQ=255) ggcgCTGATCGCGGACTGCA‑CCTGTGGCTCGGGAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGCTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGTGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAATTGGCGTTCCAgcggcgc < 2:639999/150‑1 (MQ=255) gTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAgcggtgcggt < 1:826529/150‑1 (MQ=255) ttGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGcggtgcggtg > 1:2338162/1‑150 (MQ=255) ttGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGcggtgcggtg > 1:2412407/1‑150 (MQ=255) gATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCGGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGAc > 1:1088258/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCCTGCA‑CCTGTtgcccagtgacctgccggcaccgccggtgtacaacaaggtcaacccggccgacaccccggtgctgaccctggccatctccagcaagaccatgccgctgcccaagctcaacgacctggtcgatacccgcgtggc > 2:945466‑M2/1‑17 (MQ=255) tCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACgg > 1:1915309/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACgg > 2:1768123/1‑150 (MQ=255) cgGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACGgcgc > 1:1201785/1‑150 (MQ=255) gCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACGGCGCTg < 2:1684047/150‑1 (MQ=255) gCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACGGCGCTg < 2:1762450/150‑1 (MQ=255) ccTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACGGCGCTgg > 1:1578122/1‑150 (MQ=255) cTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACGGCGCTGGt > 1:172370/1‑150 (MQ=255) tGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAAc > 1:2001768/1‑76 (MQ=255) tGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAAc < 2:2001768/76‑1 (MQ=255) a‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACGGCGCTGGtcatc > 2:2380120/1‑150 (MQ=255) ccTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGATGGCGCTGGtcatca < 1:1156126/150‑1 (MQ=255) cTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCAGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACGGCGCTGGTCATCAc > 1:451834/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAgcggtgcggt > 2:1303464/1‑129 (MQ=255) ttGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAgcggtgcggt < 1:1303464/129‑1 (MQ=255) | TCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCA‑CCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGGCGTTCCAGCGGTGCGGTGACGGCGCTGGTCATCAC > NC_002947/4071736‑4072031 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |