| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GCTGCAGGCGCTGCACGCCAACGGCTGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTGCAACGCGTGCTGGACAGCGC > NC_002947/4429192‑4429488 | gctgcaggcgctgcaCGCCAACGGCTGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAAtgc > 1:1524079/1‑150 (MQ=255) ctaggCGCTGCACGCCAACGGCTGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCtgc > 1:2331295‑M2/3‑147 (MQ=255) gcgcTGCACGCCAACGGCTGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCtgcgcag > 2:756707‑M2/1‑143 (MQ=255) tgcaCGCCAACGGCTGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATc < 1:1037989/150‑1 (MQ=255) tgcaCGCCAACGGCTGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATc > 2:2176834/1‑150 (MQ=255) cAACGGCTGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGa < 2:1727240/150‑1 (MQ=255) cAACGGCTGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGa < 1:606909/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAg < 1:1631166/150‑1 (MQ=255) 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tGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCtt < 1:1180816/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTg < 2:801319/150‑1 (MQ=255) ccTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTg > 1:2127524/1‑106 (MQ=255) ccTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTGCa > 2:2163993/1‑150 (MQ=255) ccTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTGCa > 1:1203205/1‑150 (MQ=255) catGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATg > 2:1273832/3‑64 (MQ=255) cTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCa > 1:1981799/1‑68 (MQ=255) cTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGa < 1:1281757/86‑1 (MQ=255) cTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTGCaa > 1:1301677/1‑150 (MQ=255) tGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTGCAAc < 2:1673647/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTGCAACGCGTGc < 2:1861869/150‑1 (MQ=255) ctgcGCAATGCtgcgcagcacatgcagggcatcggctcttccggcagcaggtcgggcaacagggcgcggatcaccccgtcggcatcgaactcattgaa < 1:603661‑M2/98‑88 (MQ=255) ctgcGCAATGCtgcgcagcacatgcagggcatcggctcttccggcagcaggtcgggcaacagggcgcggatcaccccgtcggcatcgaactcattgaa > 2:603661‑M2/1‑11 (MQ=255) ctgcGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTACAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTGCAACGCGTGCTg > 2:1350239/1‑150 (MQ=255) tgcGCAATGCtgcgcagcacatgcagggcatcgggctcttcc < 2:1935048‑M2/42‑33 (MQ=255) tgcGCAATGCtgcgcagcacatgcagggcatcgggctcttcc > 1:1935048‑M2/1‑10 (MQ=255) tgcGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAAt < 2:1812921/89‑1 (MQ=255) tgcGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAAt > 1:1812921/1‑89 (MQ=255) tgcGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAggggg < 2:1998498/133‑1 (MQ=255) tgcGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAggggg > 1:1998498/1‑133 (MQ=255) aaTGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTGCAACGCGTGCTGGACAgc < 2:838115/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCATCGCAGCGCGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTGCAAGGGGGCTTGCAACGCGTGCTGGACAgcgc > 1:1209061/1‑150 (MQ=255) ctgcGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTgg < 2:734460/95‑1 (MQ=255) ctgcGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTgg > 1:734460/1‑95 (MQ=255) | GCTGCAGGCGCTGCACGCCAACGGCTGCCCGGTGCCGGCGGTTGAGACCGACGCCGCATTCAATGAGTTCGATGCCGACGGGGTGATCCGCGCCCTGTTGCCCGACCTGCTGCCGGAAGAGCCCGATGCCCTGCATGTGCTGCGCAATGCTGCGCAGCATCGCAGCGAGTTTCAGCGCCTGTTCGCGTTGATGGTGCAGCGCTGGCACGATGGCGAGCATGCCGATAATGGCCTGGAAACCTGGCATTCGTTTACGTCACGCGTACAAGGGGGCTTGCAACGCGTGCTGGACAGCGC > NC_002947/4429192‑4429488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |