New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4575566 = | 83 (0.890) | 5 (0.060) | 5/230 | NT | 5.7% | intergenic (+40/‑82) | glgX/ybhP‑II | glycogen debranching enzyme/phosphohydrolase |
? | NC_002947 | 4575613 = | 88 (1.030) | intergenic (+87/‑35) | glgX/ybhP‑II | glycogen debranching enzyme/phosphohydrolase |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
AGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCACCGCCTTCAACCGGC > NC_002947/4575464‑4575762 | aGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTggcgg < 1:1649287/150‑1 (MQ=255) gTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTggcggc < 1:151597/150‑1 (MQ=255) tACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGgcggcg > 1:679591/1‑150 (MQ=255) 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gctgctGATGGTGTTGCAGTGCGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCaggag < 2:1246933/150‑1 (MQ=255) tgctgATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCagg > 1:769868/1‑146 (MQ=255) tgctgATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCagg < 2:769868/146‑1 (MQ=255) tgctgATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCCggagga > 2:2195033/1‑150 (MQ=255) tgATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATc < 1:597330/150‑1 (MQ=255) 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gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCagga < 2:1676412/124‑1 (MQ=255) gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGa > 2:2269769/1‑134 (MQ=255) gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGa < 1:2269769/134‑1 (MQ=255) gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGCGCCTAGCACCCGGGAg > 2:1357226/1‑150 (MQ=255) ggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTa > 1:1481133/1‑150 (MQ=255) gagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCTAAATTAGCTGTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGCAGCCGGCAGTaa > 1:146961/1‑150 (MQ=255) aaCGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCg > 2:1447037/1‑138 (MQ=255) aaCGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGtt > 1:897681/1‑150 (MQ=255) gTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGc > 1:2112247/1‑150 (MQ=255) tAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGc > 2:36020/1‑150 (MQ=255) caggcag‑gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAg < 1:36020/150‑1 (MQ=255) 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ggA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCa < 1:1687782/112‑1 (MQ=255) ggTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATAcc < 1:2351715/150‑1 (MQ=255) gtgtACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATAccc > 1:1711562/1‑150 (MQ=255) tACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCcaca > 1:1864615/1‑150 (MQ=255) tACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCcaca > 1:913119/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAg > 2:1122998/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTAAGCCAGGCCCCGGCAGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAg > 2:1144277/1‑150 (MQ=255) cGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCGGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAgg < 1:1157538/150‑1 (MQ=255) ggCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAgga < 2:1269662/150‑2 (MQ=255) gCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGTCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGc < 1:2126385/150‑1 (MQ=255) cccACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGGAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTc > 1:1355609/1‑150 (MQ=255) ccACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCa < 1:654572/150‑1 (MQ=255) cacaGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCAc > 2:1928079/1‑150 (MQ=255) cacaGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCAc > 2:1885427/1‑150 (MQ=255) ggtttggcgGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCACCGCCt < 2:1711562‑M2/141‑1 (MQ=255) tggcgGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTGTGCGATGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATCACCATCAGGGCTTCACCGCCTTCaa > 1:1731659‑M2/6‑150 (MQ=255) gcgGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACgg > 2:253224‑M2/4‑117 (MQ=255) gcgGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACgg < 1:253224‑M2/114‑1 (MQ=255) cgGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCACCGCCTTCAACCg > 1:1810611‑M2/3‑150 (MQ=255) gGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCACCGCCTTCAACCgg < 1:1338876‑M2/149‑1 (MQ=255) gcgACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCACCGCCTTCAACCGgc > 1:1617782/1‑150 (MQ=255) | AGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGA‑ACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCACCGCCTTCAACCGGC > NC_002947/4575464‑4575762 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |