New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4583538 | 70 (0.750) | 6 (0.080) | 6/210 | NT | 8.6% | intergenic (‑67/+104) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | NC_002947 | = 4583599 | 69 (0.880) | intergenic (‑128/+43) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
GGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGT > NC_002947/4583452‑4583748 | gggcgggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAta < 2:641445‑M2/150‑3 (MQ=255) gcgggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaa > 1:545212‑M2/1‑146 (MQ=255) gAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccg < 1:467656‑M2/150‑9 (MQ=255) gAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccg < 1:1858700‑M2/150‑9 (MQ=255) aaCGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgc < 1:554268‑M2/150‑10 (MQ=255) gCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcc > 1:641445‑M2/1‑138 (MQ=255) ttGGCCATGTGCGACTCCTTTCAGTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgcaccta < 2:1184872‑M2/150‑15 (MQ=255) gCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgg < 1:1180447‑M2/150‑18 (MQ=255) cATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggg > 1:73768‑M2/1‑131 (MQ=255) gtgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑ggggggg < 1:975035/150‑1 (MQ=255) gtgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑ggggggg < 1:934025/150‑1 (MQ=255) tgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑gggggggg > 1:1326552/1‑150 (MQ=255) gACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑ggggggggggg > 2:891222/1‑150 (MQ=255) tCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑gggggggggggggc > 2:2383720/1‑147 (MQ=255) tCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑cac > 2:415696/1‑150 (MQ=255) tCCTTTCAATTGCAGCCACAGACCTCCGAGCTTGCTCGACCCCCCGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGATGACCCCGCGGGGCCGGGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAACCCCGC‑TCCT‑AC‑ggggggggggggca < 1:1184872/150‑4 (MQ=38) cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑‑GGGGGGGGGG‑CACAGt > 2:859098/1‑150 (MQ=255) ttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGACCCCCCGTGGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGATGACCCCGGGGTGCGGGGGTGCATGCCACGGAATATCCCGTTGTTCGCGGATAACCCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTc < 1:1636376/150‑1 (MQ=255) 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cacaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAAccagatcg > 1:176370/1‑144 (MQ=255) acaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTaa > 1:287283/1‑150 (MQ=255) acaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTAGCCGGTGTTCGCGGATCAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGCGGGG‑CAGAGTCTGAACCTTGTTaa > 2:1181202/1‑150 (MQ=255) gACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACgg > 1:1890378/1‑150 (MQ=255) cccGGGCTTGCCCGACCCCCGGTAGGGGGGGGTTTCCCCGCGAAGATGACACCGGGGGGCCGGGGTGCAGGGCACGGGCTTCGCGGGTGTCGGCGGATAACCCCGC‑TCCT‑AG‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCtt < 2:1535732/149‑1 (MQ=255) gatcTTGCTCCATCCCCTGAGGGGGTGGTTTTCCCGGCAAAGATGCCCGCGGGGTGCGGGGGGGCCGGGATCGGGCGTTGTGGGTGTTTCCGGAAACCCCCCC‑TCCT‑AG‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCttttt < 2:2299780/147‑1 (MQ=255) gAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑ACGGGGGGGGGGGG‑CGCAGGCTGAACCTTGTTAACGGGCtttt > 1:312768/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGt > 2:1323032/1‑134 (MQ=255) cTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGt < 1:1323032/134‑1 (MQ=255) ttGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGGCCCCAGCCTGAACCTTTTTAACCGGCtttttttt > 2:1167809/1‑147 (MQ=38) ttGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCAAGGACCGGGCTTGGCGGGTGTTGGCGGCT‑ATCCCGCGTCCA‑CA‑GGGGGCTTGCT‑CACAGTCTTAACCTTCTTAACTTGCTTTTTCGAt < 2:24727/150‑1 (MQ=255) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑ACGGGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCtttttttttttt > 2:2405007/1‑143 (MQ=255) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTTGATgcgc > 1:1698256/1‑150 (MQ=255) cGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑GC‑‑GGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCa < 2:1834121/150‑1 (MQ=255) cGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑‑GGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCa < 2:1832734/150‑1 (MQ=255) 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1:1949821/1‑150 (MQ=255) agggCGCCGGCTTCGCCGGGGTTCGGGGATAACCCCGC‑TCCT‑CG‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTAc < 2:467656/148‑1 (MQ=255) cACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATgc < 2:2248502/123‑1 (MQ=255) cACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATgc > 1:2248502/1‑123 (MQ=255) aCCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGa > 1:1056726/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGAc > 2:1942616/1‑150 (MQ=255) cGCCGGTGTTCGCGGATACCCCCGC‑CCCT‑AG‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGt < 1:128033/150‑1 (MQ=255) cGCCGGTGTTCGCGGATAACCCCGC‑CCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGt < 1:127262/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGATCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGc < 1:1762398/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGGCGAAAAACCCCCC‑TCCT‑CG‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTggtc < 1:1664771/150‑3 (MQ=255) ggTGTTCGCGGATAACCCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGcc < 1:1942616/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑ACGGGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGTTGGc < 1:2059710/150‑1 (MQ=255) gcgGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑‑GGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTtcatca > 1:638961/1‑150 (MQ=255) gcgGAAAACCCCCC‑CCTT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCAGAACGGCAGGTGCCAGGGCTTGGTCTAGAGCCATTAGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTtcatc < 1:415696/150‑1 (MQ=255) cgGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTtcatca < 2:781540/150‑1 (MQ=255) cgGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑‑GGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAg < 2:638961/150‑1 (MQ=255) aTAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGt < 1:891222/150‑1 (MQ=255) | GGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGC‑TCCT‑AC‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGT > NC_002947/4583452‑4583748 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |