New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4599330 | 98 (1.050) | 11 (0.120) | 13/236 | NT | 10.9% | coding (525/3627 nt) | PP_4071 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 4599354 | 87 (0.990) | coding (501/3627 nt) | PP_4071 | membrane protein |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCATTGTCCAG > NC_002947/4599209‑4599500 | gTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGcccc < 1:2108557‑M2/150‑5 (MQ=255) tACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGccccg < 2:423024‑M2/150‑6 (MQ=255) aCCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGccccgt > 1:486939‑M2/1‑144 (MQ=255) cGAAGAATAAACATCAGGGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGc < 2:1320084/150‑1 (MQ=255) gAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggg > 1:1435954‑M2/1‑141 (MQ=255) cTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTgcgc < 1:2214298/150‑1 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:379182/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:1827326/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:126132/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 1:2096000/1‑150 (MQ=255) aaCGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCtt < 1:107759/150‑1 (MQ=255) gTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTc > 2:2241515/1‑150 (MQ=255) gTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggtggatca < 1:2219249‑M2/150‑21 (MQ=255) cAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGa < 1:1674951/150‑1 (MQ=255) aGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGAt > 1:1929404/1‑150 (MQ=255) aGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggtggatcagca > 1:774961‑M2/1‑127 (MQ=255) aGTGGAGTCACAGCTCAGAGAATTTACGGGGACGATCAGACTGTGAAAGGCACCGGGATGGGCGATGATCAGCGCATCATTGCTGATCTACCACTCCACGTGGTAGGCGCGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGAt > 2:628795/1‑150 (MQ=255) gTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggtggatcagcaa > 2:2219249‑M2/1‑126 (MQ=255) 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gcTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCaa < 2:503383/149‑1 (MQ=255) aCTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGTCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCaa > 1:301089/1‑150 (MQ=255) cTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg > 2:1903366/1‑144 (MQ=255) gCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACga < 1:1875991/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACga > 2:872516/1‑150 (MQ=255) cccAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGcc < 2:291400/123‑1 (MQ=255) cccAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGcc > 1:291400/1‑123 (MQ=255) cccAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggt > 2:2449355‑M2/1‑114 (MQ=255) cccAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggt < 1:2449355‑M2/128‑15 (MQ=255) cccAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGACCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGcc < 2:2096178/123‑1 (MQ=255) cAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGaa > 2:348279/1‑150 (MQ=255) aGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGaaa > 2:203141/1‑150 (MQ=255) aGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGaaa > 1:475371/1‑150 (MQ=255) aGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGaaa > 2:562308/1‑150 (MQ=255) aGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtgg < 2:86921‑M2/119‑9 (MQ=255) aaTCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCTCCCCGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACttt < 1:1880536/150‑1 (MQ=255) 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atgatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTCGCCTAccccgtggggtggt > 2:1293019‑M2/1‑63 (MQ=255) gatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGgcctgcct < 1:2168767/144‑1 (MQ=255) gatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGgcctgcct > 2:2168767/1‑144 (MQ=255) gatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGcc < 1:872516/150‑1 (MQ=255) atCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGccc > 2:1238083/1‑150 (MQ=255) tCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCa < 2:2376885/150‑1 (MQ=255) 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tGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACg > 2:1630442/1‑150 (MQ=255) tcaaccaccCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCa > 1:1816648/4‑150 (MQ=255) tCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAAc > 2:748704/1‑81 (MQ=255) tCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAAc < 1:748704/81‑1 (MQ=255) caccacCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAAt < 1:126132/150‑1 (MQ=255) accCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGt > 2:1044397/1‑150 (MQ=255) accCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGt > 1:1502988/1‑150 (MQ=255) ccccACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGAGCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTa > 2:482979/1‑150 (MQ=255) cccACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTAc > 2:262209/1‑150 (MQ=255) ccACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGccccgtggggtggtggatcagcaatgatgcggtgatcatcgacccgcccggtgcctttatca > 2:650812‑M2/1‑32 (MQ=255) ggTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAgcgcgc > 1:1364135/1‑150 (MQ=255) gcCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCg < 1:28118/150‑1 (MQ=255) gcTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCAtt < 1:225404/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGTCCAACGGCATTGTc > 2:2037451/1‑150 (MQ=255) gccggccCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCATTGTCCa < 2:1415702/150‑1 (MQ=255) gccggccCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCATTGTCCa < 1:2285757/150‑1 (MQ=255) ccggccCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCCATGTCCAg > 2:967974/1‑150 (MQ=255) ccggccCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCATTGTCCa < 2:216107/149‑1 (MQ=255) ccggccCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCATTGTCCa > 1:216107/1‑149 (MQ=255) ccggccCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCATTGTCCAg < 1:1044397/150‑1 (MQ=255) | GTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCATTGTCCAG > NC_002947/4599209‑4599500 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |