New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4864454 | 87 (0.930) | 8 (0.090) | 7/226 | NT | 9.1% | coding (1464/3489 nt) | smc | chromosome partition protein Smc |
? | NC_002947 | = 4864479 | 82 (0.970) | coding (1439/3489 nt) | smc | chromosome partition protein Smc |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCCTTCGGCCAGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATCCTGCGGGTCGCT > NC_002947/4864331‑4864627 | gCCTTCGGCCAGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTC‑AGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgc < 1:686345‑M2/150‑3 (MQ=255) cTTCGGCCAGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTC‑AGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgc > 2:686345‑M2/1‑146 (MQ=255) cGGCCAGCCGCGGCTGTTGCTCCCGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCCGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgcct > 2:76193‑M2/1‑144 (MQ=255) cGGCCAGCCGCGGCTGTTGCCCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCCCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGTAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgcct > 1:702673‑M2/1‑144 (MQ=255) ggCCAGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgcctg > 1:1658497‑M2/1‑143 (MQ=255) gCCAGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgcctgg > 1:2084830‑M2/1‑142 (MQ=255) gCCAGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgcctgg > 1:1596920‑M2/1‑142 (MQ=255) ccAGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgcctggg > 2:373053‑M2/1‑141 (MQ=255) aGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgcctgggtg > 2:1769895‑M2/1‑139 (MQ=255) aGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgcctgggtg > 1:1701307‑M2/1‑139 (MQ=255) gCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCctgct < 2:1613925/150‑1 (MQ=255) tGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCtgctg‑c > 1:1081890/1‑150 (MQ=255) tGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGt < 1:1539560/150‑1 (MQ=255) tGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGt < 2:2235716/150‑1 (MQ=255) gCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGtt > 1:30390/1‑150 (MQ=255) agcagcgaaatgctgctggaagaactgcagctctgcgaagagcaggtgatcgagcgcctggaaagcgcgcgcgagcaactgcagcaggCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGt > 1:2089483‑M1/89‑135 (MQ=255) agcagcgaaatgctgctggaagaactgcagctctgcgaagagcaggtgatcgagcgcctggaaagcgcgcgcgagcaactgcagcaggCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGt < 2:2089483‑M1/47‑1 (MQ=255) tCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTgcgcctggg > 2:1601718‑M2/1‑124 (MQ=255) tCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGc > 2:2377451/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTcgcgc > 2:1565377/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTcgcgcgcg > 1:27977/1‑150 (MQ=255) gCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCtttgct < 2:1173253/150‑4 (MQ=255) cAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAg < 1:850167/150‑1 (MQ=255) acgCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAg < 2:366201/148‑1 (MQ=255) aGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAgg > 1:1823339/1‑150 (MQ=255) ttGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTc < 2:561608/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGATGAACCCCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGa < 1:1946842/150‑1 (MQ=255) gcagcaCCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACTCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTTCTGTGGCGCTTTGGTGGTCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATc < 2:460815/150‑1 (MQ=255) gcagcaCCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGAt > 1:987139/1‑149 (MQ=255) gcagcaCCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATc > 1:1642703/1‑150 (MQ=255) cagcaCCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCa > 1:193485/1‑150 (MQ=255) agcaCCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCAc < 2:1674846/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGctc > 1:1499078/1‑150 (MQ=255) 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1:1197229‑M1/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTc < 1:2038986/89‑1 (MQ=255) cAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAg < 2:1810076/45‑1 (MQ=255) ggTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCNTgg < 2:1499078/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATgg < 2:1385574/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATgg < 1:1019198/150‑1 (MQ=255) gTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATggc > 2:2216748/1‑150 (MQ=255) gCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGc < 2:1738945/43‑1 (MQ=255) gCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGc > 1:1738945/1‑43 (MQ=255) cccTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTGTCATATG‑ACGCGCGCGCGTGCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCa < 1:2377451/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCAt > 1:749567/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGTCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATc < 1:1046544/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATc > 2:1413991/1‑62 (MQ=255) ccTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATc < 1:1413991/62‑1 (MQ=255) ctgctgTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCAtt < 2:1934397/100‑1 (MQ=255) ctgctgTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCAtt > 1:1934397/1‑100 (MQ=255) tgctgTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCa > 2:1402948/1‑112 (MQ=255) tgctgTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCa < 1:1402948/112‑1 (MQ=255) gctgTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATCCTGCGGGt > 1:806153/1‑150 (MQ=255) ctgTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAg < 1:556042/48‑1 (MQ=255) ctgTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAg > 2:556042/1‑48 (MQ=255) ctgTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATCCTGCGGGTc > 1:1174005/1‑150 (MQ=255) tgTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTCGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATCCTGCGGGTCg > 1:2416228/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATCCTGCGGGTCGc < 2:976065/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATCCTGCgg < 2:1680942/144‑1 (MQ=255) ttGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATCCTGCgg > 1:1680942/1‑144 (MQ=255) ttGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATCCTGCGGGTCGCt > 2:1925176/1‑150 (MQ=255) | GCCTTCGGCCAGCCGCGGCTGTTGCTCCAGCCCTTGGCCGTGCAGCCATTGCGCAGCACCTGCGCCCGGCTCCAGGGCGGCCTGCTGCAAGGCTTCCAGCGAGGCCAGGCGCCCACCCAGGCGCTGCAGGTCGCCCTGTGCCTGCTGTTGCGCCTGGGTGGCCTGCTG‑CAGTTGCTCGCGCGCGCTTTCCAGGCGCTCGATCACCTGCTCTTCGCAGAGCTGCAGTTCTTCCAGCAGCATTTCGCTGCTGGCCAGTTGCTCGGCCAGTTCGAGCATGGCGGCATCCTGCGGGTCGCT > NC_002947/4864331‑4864627 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |