| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5277534 | 99 (1.060) | 8 (0.090) | 8/246 | NT | 7.5% | coding (447/1221 nt) | PP_4652 | membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 5277572 | 101 (1.100) | coding (485/1221 nt) | PP_4652 | membrane protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGAATCGCTGCTGGCT > NC_002947/5277423‑5277717 | ggCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTggg > 1:1669431/1‑150 (MQ=255) ccTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGcg > 2:1185467‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCgg > 1:50147/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTc < 1:1195745/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCCAGCGGCTCATTCGAAATGCCTGCAACCCAGGTGCTGTTGTCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGCCTGCGACCATCGTGGCTCCCGC‑‑GTGTGGCTGATTCCt < 2:2334309/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCt > 1:837980/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCt < 2:1060380/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTg > 1:555187/1‑150 (MQ=255) cGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTa < 2:1525106/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTa < 2:1669431/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTa < 1:275398/150‑1 (MQ=255) gcCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGcc < 2:1047088/150‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGCCCCCTGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCt > 2:2400684/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCttt < 1:1130949/150‑1 (MQ=255) ccGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTgg > 2:250676/1‑150 (MQ=255) gCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGgca < 1:566431/150‑1 (MQ=255) gCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGgca > 1:2152392/1‑150 (MQ=255) tCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGgcagc > 2:417330/1‑150 (MQ=255) 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aaTGCCGGCAATGCAGGCGCGGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGAGGACCGAGACTTCTAGGGCCTCGGACACCCAGTCGGCGCCAATAGTGGCGACGGA‑‑GGTGCGGTGATTCCTTTATGCCTTTGGCAGCATGTGGgt < 1:1750837/150‑1 (MQ=255) aaTGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGTCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGgt < 1:178095/150‑1 (MQ=255) aaTGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGgt < 2:1550976/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGgtgt < 2:837980/150‑1 (MQ=255) gCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTa < 2:1846987/150‑1 (MQ=255) cGGCAACCCCGGGGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACg < 2:269725/150‑1 (MQ=255) gCAACCCACGCGCTGAGGCCCTGCGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGCCGGCCCCGGCCACCCACTCGGCGACCATCCTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTACGCCATTTGCAGCATGGGCGGGTACGGc > 2:1335146/1‑150 (MQ=255) cAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGcc < 1:611606/150‑1 (MQ=255) aaCCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGccc > 2:709407/1‑150 (MQ=255) cccAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATTCCTTTGGCAGCATGTGGGGGTACGGCCCgg > 1:423753/1‑149 (MQ=255) 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cggcgTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCAtt > 2:844225/1‑116 (MQ=255) cggcgTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCAtt < 1:844225/116‑1 (MQ=255) cggcgTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGcgcgcg < 1:1355006/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcat < 2:38984‑M2/126‑79 (MQ=255) gTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcat > 1:38984‑M2/1‑48 (MQ=255) cctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGc > 2:1928589/1‑109 (MQ=255) cctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGc < 1:1928589/109‑1 (MQ=255) cctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCg > 1:777978/1‑150 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccacgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaa < 2:1986430‑M2/150‑109 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGc > 2:826755/1‑150 (MQ=255) cggccACCCAGTCGGCGACAATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGccc > 2:1040715/1‑150 (MQ=255) ggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaaatc < 2:698296‑M2/150‑112 (MQ=255) ggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCa > 1:1462333/1‑150 (MQ=255) aCCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaaggccaga > 1:1627601‑M2/1‑35 (MQ=255) cAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCggg > 1:2350743/1‑150 (MQ=255) cAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGACTGGGTGGCcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggct > 1:628555‑M2/1‑34 (MQ=255) cAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGACTGGGTGGCcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggct < 2:628555‑M2/127‑94 (MQ=255) ggCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGgcgcgc > 2:1029798/1‑150 (MQ=255) gACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAg > 1:1548858/1‑150 (MQ=255) gACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGAGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAg > 1:828032/1‑150 (MQ=255) ccATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCtt > 1:116693/1‑76 (MQ=255) cATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCttt > 2:1518851/1‑40 (MQ=255) cATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCttt < 1:1518851/40‑1 (MQ=255) gTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGaa < 2:2321614/150‑1 (MQ=255) gTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCATGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGaa < 1:1004/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGAATc < 2:50147/150‑1 (MQ=255) cggc‑‑ggTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGAATCgctgc > 2:845881/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGAATCGCTgctggct < 1:888832/150‑1 (MQ=255) | GGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGC‑‑GGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCAGCGCGGGCGCGCCAGCATCGAATCGCTGCTGGCT > NC_002947/5277423‑5277717 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |