New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 5665825 | 83 (0.890) | 6 (0.070) | 6/230 | NT | 7.1% | intergenic (‑70/‑213) | PP_4973/nhaP | membrane protein/NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
? | NC_002947 | = 5665884 | 81 (0.940) | intergenic (‑129/‑154) | PP_4973/nhaP | membrane protein/NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
CAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACTGTTATAG > NC_002947/5665738‑5666029 | cAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgcc < 2:2223876‑M2/150‑4 (MQ=255) agagATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgccc < 1:255456‑M2/150‑5 (MQ=255) gagaTGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATATCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgccc > 1:1676115‑M2/1‑145 (MQ=255) gagaTGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATATCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgccc < 2:1676115‑M2/149‑5 (MQ=255) gCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 1:1412103/1‑150 (MQ=255) aaCACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCGCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATTGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAggg > 1:509827/1‑150 (MQ=255) aaCACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAggg > 2:1801581/1‑150 (MQ=255) acGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAg > 2:796358/1‑150 (MQ=255) cGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGc < 1:176936/150‑1 (MQ=255) gCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCAGGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGTCCGGGCCGACAGGGTAGcc > 2:2395073/1‑150 (MQ=38) ccTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCa < 2:1175813/150‑1 (MQ=255) cttGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGGATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGc < 2:635015/150‑1 (MQ=255) ttGTCCGTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCCCAGCTGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCa < 1:323611/150‑1 (MQ=38) 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1:2030026/1‑150 (MQ=255) tATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCg < 2:422998/150‑1 (MQ=255) tGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCggg > 2:2056734/1‑150 (MQ=255) gCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTa > 2:1536537/1‑150 (MQ=255) cACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTaa > 2:203917/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTc < 1:1067990/142‑1 (MQ=255) ccGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTc > 2:1067990/1‑142 (MQ=255) ccGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACg > 1:2051211/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGa < 1:2031645/150‑1 (MQ=255) ggCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGAc < 2:1269410/150‑1 (MQ=255) gCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGAttt < 2:2439905/70‑1 (MQ=255) gCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGAttt > 1:2439905/1‑70 (MQ=255) tttGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTg < 2:1444298/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCACCGCACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGaa > 1:626285/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTACCCGGTACCGCCGGAATTGATAACGATGTGTACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGACCCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGaa < 1:535176/150‑1 (MQ=255) gtTCGCGGGCCGGCCCCCTCCCACATGTTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACt < 2:1321258/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACTGtt < 1:796358/150‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCATACCGGCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGGGTCGCTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACTGTtata < 2:1631482/150‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACTGTtata < 1:1640873/150‑1 (MQ=255) ggCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACTGTTATAg < 2:1066013/150‑1 (MQ=255) ggCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACTGTTATAg < 2:861618/150‑1 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACTGTtata < 2:2133622/145‑1 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACTGTtata > 1:2133622/1‑145 (MQ=255) | CAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCAGGTCATCAAAGAACTGCCCGAGTCACTCGGGTAACGACTTGGAAGCCACTGTTATAG > NC_002947/5665738‑5666029 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |