New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 6146976 | 157 (1.680) | 3 (0.030) | 3/238 | NT | 1.9% | coding (431/1023 nt) | PP_5392 | WD40/YVTN repeat‑containing protein |
? | NC_002947 | = 6147014 | 154 (1.730) | coding (393/1023 nt) | PP_5392 | WD40/YVTN repeat‑containing protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
ATAAGCGATACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCACCGGGCTTTTCACCACTCGAATGCC > NC_002947/6146865‑6147162 | aTAAGCGATACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCg < 1:212999/150‑1 (MQ=255) aTAAGCGATACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCg > 1:2285710/1‑150 (MQ=255) gCGATACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGgaat < 1:2259449‑M2/150‑5 (MQ=255) gCGATACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGgaat < 1:1123173‑M2/150‑5 (MQ=255) gCGATACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGgaat > 1:39758‑M2/1‑146 (MQ=255) cGATACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGgaatc > 2:1049457‑M2/1‑145 (MQ=255) aTACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCgg > 2:798735/1‑150 (MQ=255) aTACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCgg < 2:466274/150‑1 (MQ=255) aTACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCgg < 2:650489/150‑1 (MQ=255) cGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCa < 2:2285710/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCg < 2:1404927/139‑1 (MQ=255) gTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGaa > 2:495630/1‑150 (MQ=255) gCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCGCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGc > 1:2367315/1‑150 (MQ=255) tctTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTc > 1:1119787/1‑150 (MQ=255) ttCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGc > 2:734346/1‑150 (MQ=255) aTGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGc < 2:206526/150‑1 (MQ=255) aTGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGc > 2:1436128/1‑150 (MQ=255) ttCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCg < 1:1748879/150‑1 (MQ=255) 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1:1435584‑M2/127‑86 (MQ=255) ttCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTc < 2:2031197/130‑1 (MQ=255) ttCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTc > 1:685453/1‑130 (MQ=255) gctgctCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCa < 2:2167798/150‑1 (MQ=255) ctgctCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACANCAg < 2:1510979/150‑1 (MQ=255) aaGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGGATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTg > 2:1350172/1‑150 (MQ=255) 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tCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCa > 2:1067946/1‑150 (MQ=255) aaaTATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACggtg > 1:1293591/1‑107 (MQ=255) aaaTATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACggtg < 2:1293591/107‑1 (MQ=255) aaaTATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCAcc > 2:1866056/1‑150 (MQ=255) ttCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCACCGGGCt > 1:2173899/1‑150 (MQ=255) gTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGATCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCACCGGGAtttt > 2:1186990/1‑150 (MQ=255) 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ttGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCACCGGGCTTTTCACCACTc < 1:2199193/150‑1 (MQ=255) aGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCACCGGGCtttt > 1:1174591/1‑137 (MQ=255) aGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCACCGGGCTTTTCACCACTCGAATg < 1:816822/150‑1 (MQ=255) cGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCACCGGGCTTTTCACCACTCGAATGcc < 1:2048656/150‑1 (MQ=255) | ATAAGCGATACGCTGTCGCTCTTCATGTTCGCGATATAGAGCGTCCGGCCATCAGGGCTCAAGCGCAGCCCATGGGGATAACGCCCAGTTGGAATACCGGGCAACTCGATTCGCTGCTCAAGGTCAAATATTCGTACCCGGTTGGCAGCGGAATCGGTCACGAAAGCTCGCAGCCCGGTGACGTCGGTGATCACATGAGCCGGGTGATCGCCTGCCGGGAAGCTGAACGGTGGTCTGTCCAGCGCGCTGGTACTGAACACCAGCAACTGCCCACCGGGCTTTTCACCACTCGAATGCC > NC_002947/6146865‑6147162 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |