| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,644,991 | C→T | 8.1% | intergenic (‑43/+23) | PP_3211 ← / ← PP_3212 | ABC transporter ATP‑binding protein/Rieske 2Fe‑2S family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,644,991 | 0 | C | T | 8.1% | 304.7 / 12.3 | 109 | intergenic (‑43/+23) | PP_3211/PP_3212 | ABC transporter ATP‑binding protein/Rieske 2Fe‑2S family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/50); new base T (5/4); total (55/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.02e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TGTAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGACACAG > NC_002947/3644843‑3645140 | tGTAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGgcg > 2:1846906/1‑150 (MQ=255) tAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCa > 1:2401687/1‑150 (MQ=255) tAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCa > 1:2016043/1‑150 (MQ=255) ttttttCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGCATGCCCCGGTGCGCCgg > 2:1635691/1‑150 (MQ=255) ttttttCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGGCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCgg < 1:122548/150‑1 (MQ=255) tttttCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCggg < 2:2016043/150‑1 (MQ=255) ttCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCg > 2:2306967/1‑150 (MQ=255) ccACCTGATTGGCGAACAACGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGTGCGCCGGGGcata < 1:713455/150‑4 (MQ=255) ccACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGTGCGCCGGGGcata < 1:1635691/150‑4 (MQ=255) ccACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGtt < 2:1458184/150‑1 (MQ=255) cACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTg < 1:1733802/150‑1 (MQ=255) aCCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTgg < 2:2165268/150‑1 (MQ=255) ccTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGTGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTggg > 2:2094674/1‑150 (MQ=255) ccTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGTGCGCCGGGGca < 1:1502951/145‑2 (MQ=255) ccTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGTGCGCCGGGGca > 2:1502951/1‑144 (MQ=255) ccTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGACCCGGCGCAGCGGGGCGTTggg > 1:896623/1‑150 (MQ=255) cTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGc > 2:2224003/1‑150 (MQ=255) ttGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAgt < 2:620503/150‑1 (MQ=255) gCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGAGTTGGGCAAgtgtg > 1:1216759/1‑149 (MQ=255) gCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGATCAACGCCCGGGATGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCCCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTc > 2:810041/1‑150 (MQ=255) gAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAg > 1:1268023/1‑150 (MQ=255) gAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAg > 1:91987/1‑150 (MQ=255) aaaGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGc < 1:1676931/150‑1 (MQ=255) gggTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGTCAGGGGCTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAg < 1:1879736/150‑1 (MQ=255) ggTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAgg > 2:676606/1‑150 (MQ=255) tCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGTGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAaca < 1:2094674/150‑1 (MQ=255) tCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGTGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAaca < 1:2094174/150‑1 (MQ=255) tCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAaca < 2:2084361/150‑1 (MQ=255) cacaCCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCACGTGTCAGTGGCTGAGGAACACt > 2:609175/1‑150 (MQ=255) cacaCCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTAAGACCTAGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGGTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACt > 1:1133970/1‑150 (MQ=255) acacCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGACCACtt > 2:490519/1‑150 (MQ=255) acCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCg > 2:2186658/1‑150 (MQ=255) cGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGct > 2:253624/1‑150 (MQ=255) tGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCactc < 2:91987/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCg > 2:1929574/1‑150 (MQ=255) gtTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCa > 2:1631749/1‑150 (MQ=255) ttCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCAt > 1:223929/1‑150 (MQ=255) ttCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCCCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCGGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCAt < 2:950324/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGc < 1:2186658/150‑1 (MQ=255) aGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCgg < 2:386634/97‑1 (MQ=255) aGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCgg > 1:386634/1‑97 (MQ=255) gCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCaa < 1:1944597/150‑1 (MQ=255) gcTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAg < 2:201192/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAg < 2:2401687/150‑1 (MQ=255) ggCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGc < 1:325876/139‑1 (MQ=255) ggCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGc > 2:325876/1‑139 (MQ=255) gCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAAAACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGAcc > 1:1756814/1‑150 (MQ=255) cTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGAccc < 1:676606/150‑1 (MQ=255) gACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCagt > 1:1768674/1‑150 (MQ=255) aCGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAAGATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCGGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTCTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGATCTCGCCATTGGCTTCAAGCATACCCatta > 1:500770/1‑150 (MQ=255) aCGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCagta < 2:1268023/150‑1 (MQ=255) aCGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCagta < 1:175083/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCAGCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCagtagt > 1:154960/1‑150 (MQ=255) ccTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCg > 1:1769218/1‑150 (MQ=255) gATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGa > 1:2128734/1‑150 (MQ=255) gggTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGGCGGAGaac < 1:810041/150‑1 (MQ=255) gTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg < 2:2381746/112‑1 (MQ=255) gTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg > 1:2381746/1‑112 (MQ=255) gCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAAccc > 2:1268185/1‑150 (MQ=255) cATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAAAACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCg < 2:1756814/150‑1 (MQ=255) aTCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTg < 2:2398987/65‑1 (MQ=255) aTCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTg > 1:2398987/1‑65 (MQ=255) cAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGc < 2:1907364/150‑1 (MQ=255) cAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGc < 2:888310/150‑1 (MQ=255) aaCATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCt > 1:2195486/1‑150 (MQ=255) aTAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGtt < 1:611779/123‑1 (MQ=255) tAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAg > 2:503720/1‑108 (MQ=255) tAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAg < 1:503720/108‑1 (MQ=255) tAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTc < 1:2035908/150‑1 (MQ=255) cgcTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCag > 2:1909841/1‑114 (MQ=255) gcTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGAt < 2:2128734/150‑1 (MQ=255) gcTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGAt > 2:1613023/1‑150 (MQ=255) ctctCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCTGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATg < 1:921451/150‑1 (MQ=255) tctcCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATaacc < 1:1284998/130‑1 (MQ=255) tctcCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATaacc > 2:1284998/1‑130 (MQ=255) tcCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCa > 2:1640461/1‑150 (MQ=255) tcCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCa > 1:2261502/1‑150 (MQ=255) ccGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGAAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGGCCCAGTAGTTGCCGGCGGATAACCAACCCGGGGTTGTCCGATGGCAtgt > 1:88994/1‑150 (MQ=255) gggTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg < 1:1385031/84‑1 (MQ=255) gggTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg > 2:1385031/1‑84 (MQ=255) gggTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAg < 1:1846906/150‑1 (MQ=255) ggTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGt > 1:851240/1‑150 (MQ=255) gTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGtt < 2:255484/150‑1 (MQ=255) aTGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGc < 1:1985656/125‑1 (MQ=255) aTGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGc > 2:1985656/1‑125 (MQ=255) tGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCAc < 2:2195486/150‑1 (MQ=255) tGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCAc < 2:1768674/150‑1 (MQ=255) tGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCAc < 2:851240/150‑1 (MQ=255) ccaacgCCCCGGTGCGCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGcggcgg < 2:1457751/145‑1 (MQ=255) ccaacgCCCCGGTGCGCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGcggcgg > 2:1343530/6‑150 (MQ=255) ccaacgCCCCGGTGCGCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGcggcgg > 1:1457751/6‑150 (MQ=255) ccaacgCCCCGGTGCGCCGGGGCATTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGcggcgg > 2:2151656/6‑150 (MQ=255) tATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGgt < 1:224929/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGCACAATTCGTGCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACGAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGa > 1:2275260/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg > 2:74138/1‑61 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg > 2:74242/1‑61 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg < 1:74138/61‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg < 1:74242/61‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGa > 2:2069108/1‑150 (MQ=255) cgcACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGACACAg < 1:1268185/150‑1 (MQ=255) | TGTAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGACACAG > NC_002947/3644843‑3645140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |