| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_002947 | 3,644,994 | 0 | A | G | 8.0% | 303.7 / 11.2 | 109 | intergenic (‑46/+20) | PP_3211/PP_3212 | ABC transporter ATP‑binding protein/Rieske 2Fe‑2S family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/52); new base G (5/4); total (53/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.85e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
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ttttttCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGGCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCgg < 1:122548/150‑1 (MQ=255) tttttCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCggg < 2:2016043/150‑1 (MQ=255) ttCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCg > 2:2306967/1‑150 (MQ=255) ccACCTGATTGGCGAACAACGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGTGCGCCGGGGcata < 1:713455/150‑4 (MQ=255) ccACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGTGCGCCGGGGcata < 1:1635691/150‑4 (MQ=255) 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2:1768674/150‑1 (MQ=255) tGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCAc < 2:851240/150‑1 (MQ=255) ccaacgCCCCGGTGCGCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGcggcgg > 2:1343530/6‑150 (MQ=255) ccaacgCCCCGGTGCGCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGcggcgg > 1:1457751/6‑150 (MQ=255) ccaacgCCCCGGTGCGCCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGcggcgg < 2:1457751/145‑1 (MQ=255) ccaacgCCCCGGTGCGCCGGGGCATTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGcggcgg > 2:2151656/6‑150 (MQ=255) tATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGgt < 1:224929/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGCACAATTCGTGCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACGAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGa > 1:2275260/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg < 1:74242/61‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg > 2:74138/1‑61 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg > 2:74242/1‑61 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATg < 1:74138/61‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGa > 2:2069108/1‑150 (MQ=255) cgcACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGACACAg < 1:1268185/150‑1 (MQ=255) cACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCGGACGGATAACCAACCCGGGCGTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGACACAGGc < 2:889593/150‑1 (MQ=255) | TAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGATGGCATGTGCAGTTCCACCCTGCGGCGGGTGTCGACACAGGC > NC_002947/3644845‑3645142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |