| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,797,549 | A→T | 7.0% | L163Q (CTG→CAG) | vdh ← | vanillin dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,797,549 | 0 | A | T | 7.0% | 368.4 / 11.8 | 123 | L163Q (CTG→CAG) | vdh | vanillin dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (60/52); new base T (6/3); total (67/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CGACGATGGCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCTGCGTGGTCATG > NC_002947/3797400‑3797698 | cgacgaTGGCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCa < 2:901859/150‑1 (MQ=255) gacgaTGGCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAg > 2:2248133/1‑150 (MQ=255) cgaTGGCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCg < 1:550039/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCa < 1:1771883/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGATCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCa < 2:1902564/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCTGGCCTGCGGCaa < 1:66612/150‑2 (MQ=255) ggCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCat < 2:35369/150‑1 (MQ=255) gCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCatg < 2:1866927/150‑1 (MQ=255) cGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCatgg < 1:1035523/150‑1 (MQ=255) cGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCatgg < 2:1803408/150‑1 (MQ=255) aTCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACACCGACCACGTTAACCGCGTCGTGCAGCACCTGGCCTATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCatggcaatggc > 1:46359/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCatggcaatggcc > 1:933118/1‑149 (MQ=255) tCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCatggcaatggca > 2:1845408/1‑150 (MQ=255) cTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCAcg > 2:2047664/1‑150 (MQ=255) cATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCa > 1:2021280/1‑150 (MQ=255) ttGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGt > 1:304128/1‑150 (MQ=255) aCATTGACCACGCCGTCGCCGATGTCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCggg < 2:282643/150‑1 (MQ=255) aTTNACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTTGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGc > 2:1498117/1‑150 (MQ=255) aTTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGc > 1:2425049/1‑150 (MQ=255) ttGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCTGGCCTGCGGCaacac < 2:977973/119‑5 (MQ=255) ttGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCTGGCCTGCGGCaacac > 1:976506/1‑115 (MQ=255) ttGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCTGGCCTGCGGCaacac < 2:976506/119‑5 (MQ=255) tGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGAACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGt < 1:1689579/150‑1 (MQ=255) gACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCgtggaacg > 1:562805/1‑146 (MQ=255) cACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCa > 1:1851451/1‑150 (MQ=255) aCGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCCGCGGAAGTCCTGTGGCCCGCCCGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCAc > 1:625224/1‑150 (MQ=255) aCGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCAACACGGTGTTGCGAGCA‑GCGTCGATCTGGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCAc > 1:1742389/1‑150 (MQ=255) tCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCg > 1:872406/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑TGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGAt < 1:1227714/150‑1 (MQ=255) gATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGcc < 1:2142402/150‑1 (MQ=255) aTGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGccc < 1:1845408/150‑1 (MQ=255) gCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCaa < 2:534193/150‑1 (MQ=255) cTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAaca > 2:171830/1‑150 (MQ=255) tGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAacac > 1:2391009/1‑150 (MQ=255) tGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAacac > 2:2189057/1‑150 (MQ=255) gCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGACAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAAcacc > 2:184730/1‑150 (MQ=255) cGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCCGGCCCGCGGCATGGCAATGGCACGCGTAGCCAGTATCACCTGAGCGTTCCACTGGGCGATGGCCAACACCAcgc < 2:25072/150‑1 (MQ=255) gcagcaCCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCg > 1:332148/1‑81 (MQ=255) gcaCCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAgg < 2:2021280/150‑1 (MQ=255) gcaCCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGAGTGTGCAGTAGCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAgg > 2:666013/1‑150 (MQ=255) caCCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAggg > 1:2291952/1‑150 (MQ=255) caCCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAggg > 1:2283361/1‑150 (MQ=255) tGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGgcgcg > 1:985672/1‑150 (MQ=255) gCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCg < 2:1129415/71‑1 (MQ=255) gCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCg > 1:1129415/1‑71 (MQ=255) gCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCAc < 1:2154758/115‑1 (MQ=255) gATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAg < 2:2095253/150‑1 (MQ=255) tCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAggg < 2:11029/150‑1 (MQ=255) cAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGc < 1:343232/150‑1 (MQ=255) aGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGcc < 1:171830/150‑1 (MQ=255) cGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCgg < 2:2298599/95‑1 (MQ=255) cGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCgg > 1:2298599/1‑95 (MQ=255) aTGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACTGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAgga > 1:1377321/1‑84 (MQ=255) aTGGACCGCCGGGCTCACCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTa < 2:1377321/86‑1 (MQ=255) ggACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGa < 2:304128/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCa < 1:445014/125‑1 (MQ=255) aCCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCa > 2:445014/1‑125 (MQ=255) cgccgGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCt > 2:1399365/1‑150 (MQ=255) cgccgGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCt < 1:2248133/150‑1 (MQ=255) gccgGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGGGTGGCCAGTATCAGCGGGGCGGGCCCCGGTGCGATGCGCAACACCACGCCGCAGCGCGCGCGGAGGTCCATGGCgcacatg > 2:501110/1‑144 (MQ=255) ccgGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGc < 2:681329/150‑1 (MQ=255) ggCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCgg < 2:879027/150‑1 (MQ=255) tCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCCGGACTGCGGCATGGCAACGTCACGCGTGGCCAGTAACACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGaa > 1:1003956/1‑150 (MQ=255) tCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGaa < 2:1851451/150‑1 (MQ=255) tCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGaa > 2:1713725/1‑150 (MQ=255) tCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGCCGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGACGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGAGCGCAGGGGCATTGCCAAGCTGCCGGGaa > 2:610088/1‑150 (MQ=255) aGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGTACg > 2:37213/1‑150 (MQ=255) cTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTc > 2:953334/1‑150 (MQ=255) cGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCg > 1:843354/1‑149 (MQ=255) cGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCg < 2:843354/149‑1 (MQ=255) cGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGa > 2:2232781/1‑150 (MQ=255) cGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGACAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGa < 1:184730/150‑1 (MQ=255) gAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAg < 1:1564612/150‑1 (MQ=255) gAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAg > 1:243575/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAgg < 1:1006806/150‑1 (MQ=255) gCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACAAAGCCGATGGGCGCGCGCGTGGCTCTGGGTATGCTTCCGGGAACGTCCGAgggg > 2:1204613/1‑150 (MQ=255) ccTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACAGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGa < 2:380124/150‑1 (MQ=255) ttGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATc < 1:953334/150‑1 (MQ=255) accacGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTcc > 2:1459839/1‑149 (MQ=255) cacGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCaa > 1:150032/1‑81 (MQ=255) cacGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCaa < 2:150032/81‑1 (MQ=255) cacGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAgg < 2:1014524/95‑1 (MQ=255) cacGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAgg > 1:1014524/1‑95 (MQ=255) cacGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCAcc > 2:1175917/1‑150 (MQ=255) cacGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGAGTAACACTTCAcc > 2:662792/1‑150 (MQ=255) acGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGAATCTCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCg < 1:1204613/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCGCCGGGGCGTTCCGCGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGACCGAGCGGAGCACTTCACCgg > 2:1322222/1‑150 (MQ=255) gtgtTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTg < 1:2189057/150‑1 (MQ=255) atGC‑CGCTGGCCTGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATc > 1:686570/2‑150 (MQ=255) atGC‑CGCTGGCCTGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATc > 2:779883/2‑150 (MQ=255) tGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCt < 1:1175917/150‑1 (MQ=255) c‑cGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCTGc > 2:546444/1‑150 (MQ=255) cGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCAtt > 2:528265/1‑101 (MQ=255) cGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCAtt < 1:528265/101‑1 (MQ=255) gCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCTGCGt > 2:1561369/1‑150 (MQ=255) aGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCTGCGTgg < 2:1281450/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCTGCGTGGTCa < 2:1742389/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCTGCGTGGTCAt < 1:986751/150‑1 (MQ=255) aGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCTGCGTGGTCATg > 1:1469306/1‑150 (MQ=255) aGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCTGCGTGGTCATg < 1:1713725/150‑1 (MQ=255) | CGACGATGGCGGGGGCATCCTGCGGCGCATTGCTGATGACATTGACCACGCCGTCGCCGATGCCTGCATCGTGCAGCACCTGGCCGATCAGCCGATGGACCGCCGGGCTCAGCTCCGAGGCCTTGAGCACCACGGTGTTGC‑CGCAGGCCAGCGGCATGGCAATGGCACGCGTGGCCAGTATCACCGGGGCGTTCCACGGTGCGATGCCCAACACCACGCCGCAGGGCGCGCGCAGGGCCATTGCGAAGCTGCCGGGAACGTCCGAGGGGATCACTTCACCGGTGATCTGCGTGGTCATG > NC_002947/3797400‑3797698 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |