| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,853,822 | A→G | 9.3% | intergenic (+61/+21) | PP_3401 → / ← PP_3402 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,853,822 | 0 | A | G | 9.3% | 333.7 / 18.1 | 118 | intergenic (+61/+21) | PP_3401/PP_3402 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/60); new base G (6/5); total (53/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TCTGGGATGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAGGGTCACGCCTTGGTC > NC_002947/3853673‑3853971 | tCTGGGATGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTTGTGGAA‑CTGCAATCAGAAGAACAGTTTGCAG‑GGGGGCCACGCGCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGa > 1:535199/1‑150 (MQ=255)tCTGGGATGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGa > 1:1190308/1‑150 (MQ=255) gggATGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGTCAGCCCAGGCTGGCCg < 1:1914227/150‑1 (MQ=255) ggATGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGTCAGCCCAGGCTGGCCgg < 2:171140/150‑1 (MQ=255) ggATGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCgg < 2:15358/150‑1 (MQ=255) gATGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCggg < 1:1033268/150‑1 (MQ=255) aTGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGGAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGTCAGCCCAGGCTGGCCgg > 2:925179/1‑148 (MQ=255) aTGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGGAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGTCAGCCCAGGCTGGCCgg < 1:925179/148‑1 (MQ=255) aTGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCgggg < 1:1952128/150‑1 (MQ=255) ttATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGgc < 2:1992450/150‑1 (MQ=255) ttATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGACTG‑GCCTACCGCCATAACCATTATTAACCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGgc < 1:2112750/150‑1 (MQ=255) tCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGgcgcg > 2:950099/1‑150 (MQ=255) tCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGgcgcg > 2:2370033/1‑150 (MQ=255) ggCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCa < 2:1986692/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCa < 1:86679/150‑1 (MQ=255) cGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAgg < 1:1425777/150‑1 (MQ=255) gTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAAt < 1:689701/150‑1 (MQ=255) cgcgAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGc < 2:2008307/150‑1 (MQ=255) cgcgAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGc < 1:1053880/150‑1 (MQ=255) cgcgAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGc > 2:912016/1‑150 (MQ=255) gcgAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGcc > 2:533178/1‑150 (MQ=255) gcgAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGcc > 1:1865405/1‑150 (MQ=255) agaAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTg > 1:115723/1‑150 (MQ=255) gaAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAATCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGa > 2:805477/1‑150 (MQ=255) gggAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCACTCGCCTTGAGTg > 2:1316154/1‑150 (MQ=255) gggAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTg < 1:1202652/150‑1 (MQ=255) gAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGgc > 1:1154200/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGACGCTGGCCTGATCCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATCAGCCGATCAG‑CGGAGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGAGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCgg < 1:925938/150‑1 (MQ=255) gcgACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTgg < 2:1865405/150‑1 (MQ=255) gACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATACGCCCATCAG‑CGTCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCt < 1:1344923/150‑1 (MQ=255) aCGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTa < 1:153905/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAATCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCa < 1:805477/150‑1 (MQ=255) ggAACCTCCTGCTGGAC‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGCGCTCCACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCacgcaac < 2:1633286/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCAt > 1:1035682/1‑150 (MQ=255) ctgctgctgGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATg < 1:2445331/150‑1 (MQ=255) ctgctgctgGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGAACCGCTACTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATg > 1:1616423/1‑150 (MQ=255) tgctgctgGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGc > 1:170796/1‑150 (MQ=255) ctgctgGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑g < 2:1146478/150‑1 (MQ=255) cTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTccac > 2:1701281/1‑150 (MQ=255) cTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTccac < 1:1974703/150‑1 (MQ=255) tGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCCGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGTCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTccacc > 2:268465/1‑150 (MQ=255) tGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTccacc > 1:1662382/1‑150 (MQ=255) aaTAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAgg < 2:1235590/150‑1 (MQ=255) aTAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGt > 1:572877/1‑150 (MQ=255) aTAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGt < 2:572877/150‑1 (MQ=255) gCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGAc < 2:1616423/150‑1 (MQ=255) cGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCa > 2:1827784/1‑150 (MQ=255) cGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGATCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCa > 1:300239/1‑150 (MQ=255) gATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAg > 1:171667/1‑150 (MQ=255) aG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCa < 1:2426242/150‑1 (MQ=255) g‑cggcgGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAg > 1:968268/1‑67 (MQ=255) g‑cggcgGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCAc < 1:1627751/150‑1 (MQ=255) ggcggcCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGa < 2:1662382/150‑1 (MQ=255) ggcggcCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGa < 1:950099/150‑1 (MQ=255) ccGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACt > 2:2227531/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTg < 1:1710370/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTg < 1:1711406/150‑1 (MQ=255) tGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGtt < 2:1035682/150‑1 (MQ=255) tGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGtt < 2:1190308/150‑1 (MQ=255) gCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGa < 2:300239/150‑1 (MQ=255) ccACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAg < 1:21642/150‑1 (MQ=255) cACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTTAGTCGCGATGGGTGGCTGCTAGCGATCGCTTTCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGGTGAgg > 1:1475313/1‑150 (MQ=255) cACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAgg > 1:2317998/1‑150 (MQ=255) gCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAgg < 2:1400855/120‑1 (MQ=255) gCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAgg > 1:1394572/1‑120 (MQ=255) gCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAgg > 1:1400761/1‑120 (MQ=255) gCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAgg < 2:1400761/120‑1 (MQ=255) gCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAgg < 2:1394572/120‑1 (MQ=255) cTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCtt > 2:1405809/1‑150 (MQ=255) tCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTg < 1:1827784/150‑1 (MQ=255) cGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGc < 1:209749/150‑1 (MQ=255) ctgctTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAgcgc > 1:1388002/1‑150 (MQ=255) tataCCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGAccc > 1:2240438/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATc > 1:1051075/1‑50 (MQ=255) aCCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATc < 2:1051075/50‑1 (MQ=255) aCCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACaa > 2:381448/1‑122 (MQ=255) aCCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACaa < 1:381448/122‑1 (MQ=255) cccGGTCAGCCCAGGCTGGCCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑gctgc > 2:2037636/1‑94 (MQ=38) cccGGTCAGCCCAGGCTGGCCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑gctgc < 1:2037636/94‑1 (MQ=38) cccGGTCAGCCCAGGCTGGCCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGa < 1:2420855/128‑1 (MQ=255) cccGGTCAGCCCAGGCTGGCCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGtt > 2:647320/1‑150 (MQ=255) ccGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTccacca > 2:2277462/1‑100 (MQ=255) ccGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTccacca < 1:2277462/100‑1 (MQ=255) ccGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGt > 1:1496555/1‑112 (MQ=255) ccGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGt < 2:1496555/112‑1 (MQ=255) ccGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTg > 2:161348/1‑150 (MQ=255) ccGGCCAGCCTGGGCTGACCGGAGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTg > 2:2187600/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTTGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAg < 1:751048/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAg < 2:2437638/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACCACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAgg > 2:1163761/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCa > 1:2073352/1‑104 (MQ=255) cccaggCTGGCCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAGGGTCAc > 1:315420/5‑150 (MQ=255) tGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGTGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGt < 1:1864612/102‑1 (MQ=255) tGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGt > 2:1864612/1‑102 (MQ=255) cTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAGGGTCACGCCTTg < 2:1154200/150‑1 (MQ=255) tGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAGGGTCACGCCTTgg > 2:1941575/1‑150 (MQ=255) aCCGGGGCACGACGGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACaa > 2:576120/1‑103 (MQ=255) aCCGGGGCACGACGGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACaa < 1:576120/103‑1 (MQ=255) aCCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCGCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAGGGTCACGCCTTGGTc < 1:1482054/150‑1 (MQ=255) aCCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGAACTCGAAATGAGTGTGTTTGTGGGGCTATCACGCAACGCATGCAGGCTG‑TCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAGGGTCACGCCTTGGTc < 1:533178/150‑1 (MQ=255) | TCTGGGATGGGCGGAGTTATCACGGCGTGGTTCGCGAGAAGGGAAAGTGCGGCGACGGTGGCCTGAACCTGCTGCTGGAA‑CTGCAATAAGCCGATCAG‑CGGCGGCCGTGGCCACGCTCGTGGCTGCTTATACCCGGCCAGCCTGGGCTGACCGGGGCACGACAGGCGCGCTCAGGCAATCGCCTTGAGTGGCGCCGGGTGGCTATCACGCAACGCATGCA‑GCTGCTCCACCAGGTTGACCAGGTCACGACAACTGTTGAGGTCTTGCAGCGCGACCCCGTTGAGGGTCACGCCTTGGTC > NC_002947/3853673‑3853971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |