Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,141,212 | T→A | 6.9% | L44Q (CTG→CAG) | PP_3645 → | L‑proline amide hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,141,212 | 0 | T | A | 6.9% | 253.8 / 7.3 | 84 | L44Q (CTG→CAG) | PP_3645 | L‑proline amide hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/39); new base A (4/2); total (43/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 |
TTCAAGGAGCGCCCTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCACAAGCCACCGTGATCGGCT > NC_002947/4141065‑4141361 | ttCAAGGAGCGCCCTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTtggcctgg > 1:2241836/1‑150 (MQ=255) tCAAGGAGCGCCCTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTtggcctggc < 1:1619948/150‑1 (MQ=255) ggAGCGCCCTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAAc < 2:649363/150‑1 (MQ=255) aGCGGCCTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑a < 2:1182880/150‑1 (MQ=255) gcgcCCTCCATGATTCAGCCTGTCACTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACCGCGTGGACCAGAAATACAAAATAGGAGGTGATCAGGTCGTTGGCCAGGCCAACG‑aa < 2:1207091/150‑2 (MQ=255) cgcCCTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACt < 1:2143287/150‑1 (MQ=255) cccTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑Ac > 2:2094885/1‑150 (MQ=255) cccTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑Ac < 1:1317044/150‑1 (MQ=255) ccTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑Acc < 1:1443497/150‑1 (MQ=255) tCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACcgc > 1:2015103/1‑150 (MQ=255) gATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCAt > 1:361056/1‑150 (MQ=255) tCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGc < 2:1045418/150‑1 (MQ=255) aGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCt > 1:2195085/1‑150 (MQ=255) ccTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAGTCTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTAc < 1:1996174/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTAc > 2:2084107/1‑150 (MQ=255) ccTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTAc < 2:1821666/150‑1 (MQ=255) tGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGGGTTGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTGCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGa > 1:1345773/1‑150 (MQ=255) cGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACAt < 1:1573228/150‑1 (MQ=255) gatctcacaCCTGCTGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTc < 2:46933/145‑1 (MQ=255) gAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTc < 1:418229/150‑1 (MQ=255) aCGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCgg < 1:330246/150‑1 (MQ=255) cGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGc < 1:1435545/150‑1 (MQ=255) gCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑Ac < 1:1711242/122‑1 (MQ=255) gCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑Ac > 2:1711242/1‑122 (MQ=255) acacCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCCGGGCTGCTCGGTGCNGTTTCTCCACGGCGGGGGCCTGAACCAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTTGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCTGCATCGCCTACGACATGCTCgagatc > 1:46933/1‑145 (MQ=255) cTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCATGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTc > 1:942959/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGTGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCACGTCATCGCCTACGACATCCCCGGCCACGGTc > 2:22783/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑a < 1:1991031/112‑1 (MQ=255) cTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑a > 2:1991031/1‑112 (MQ=255) cTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTc > 2:389144/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCa > 2:1607766/1‑150 (MQ=255) ggCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGGACAAGGAAATGTGGGGCAGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGGCACGGTCAAAGc > 2:1326526/1‑150 (MQ=255) gCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGcc > 2:633264/1‑150 (MQ=255) aCCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCcgc < 2:2195085/150‑1 (MQ=255) ccAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCaa < 1:660410/100‑1 (MQ=255) ccAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCaa > 2:660410/1‑100 (MQ=255) ccAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCcgcg > 1:1141657/1‑150 (MQ=255) cTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTAcc < 1:2084107/150‑1 (MQ=255) ggATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGgccgc > 1:411587/1‑150 (MQ=255) gATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGgccgcc < 1:546661/150‑1 (MQ=255) tGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGa < 2:694844/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGGTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGGCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGGCGACCGGCCGCCGACACAcc > 1:1306051/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCAGGCCAACG‑aa < 1:237204/84‑2 (MQ=255) cAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCAGGCCAACG‑aa > 2:237204/1‑83 (MQ=255) aGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCGTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCCGCTGCCGGCACACCGc > 2:548204/1‑150 (MQ=255) gggCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGTGCCTGCCCAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCt < 1:22783/150‑1 (MQ=255) gggCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCt > 1:515334/1‑150 (MQ=255) gCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGcc < 2:2096887/95‑1 (MQ=255) gCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGcc > 1:2096887/1‑95 (MQ=255) ccAACCCGTGGTGCTGATCGACGCGGTGGGCCTGAACAAGGAAATGGGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGa > 1:655186/1‑150 (MQ=255) ccAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACACGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGa > 2:882548/1‑150 (MQ=255) cAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAAc > 2:1103851/1‑75 (MQ=255) cAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAAc < 1:1103851/75‑1 (MQ=255) cAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGaa < 1:155498/150‑1 (MQ=255) gggtgCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATg < 1:2066692/149‑1 (MQ=255) tgCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCaaa < 1:2145192/108‑1 (MQ=255) tgCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCaaa > 2:2145192/1‑108 (MQ=255) cTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGAc < 1:1625705/150‑1 (MQ=255) cACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGa < 1:2151645/143‑1 (MQ=255) cACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGa > 2:2151645/1‑143 (MQ=255) cGGCGTGGGCCGGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGc < 2:428600/150‑1 (MQ=255) gggCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACt < 1:2094885/150‑1 (MQ=255) gCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCcgc < 2:1652475/95‑1 (MQ=255) gCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCcgc > 1:1652475/1‑95 (MQ=255) gCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTAAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGc < 1:1705000/150‑1 (MQ=255) cTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCtt > 1:2092024/1‑150 (MQ=255) 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tCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCATAAGCCACCg < 1:334595/150‑1 (MQ=255) tCGTTGGCCAGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCACAAGCCACCg > 2:859300/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCACAAGCCACCGTg > 2:1610239/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCAGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCACAAGCCACCGTg > 2:59972/1‑150 (MQ=255) ggcctggccAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCACAAGCCACCGTGATc < 1:389144/150‑1 (MQ=255) ggcctggccAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCACAAGCCAACGTGATc < 2:2241836/150‑1 (MQ=255) gcctggccAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCACAAGCCACCGTGATCg > 1:1687490/1‑150 (MQ=255) tggccAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCACAAGCCACCGTGATCGGCt > 1:317660/1‑150 (MQ=255) | TTCAAGGAGCGCCCTCCATGATTCAGCCTGTCGCTGAACGCACACCTGCCGGCACCAGCTATCTGGATGTCGGCCAGGGCCAACCCGTGGTGCTGATCCACGGCGTGGGCCTGAACAAGGAAATGTGGGGCGGTCAGTTCGTTGGCCTGGCCAACG‑ACT‑ACCGCGTCATCGCCTACGACATGCTCGGCCACGGTCAAAGCCGCGTACCGGCCGCCGACACACCGCTGGAAGGCTATGCCGACCAGCTCGCCGAACTGCTTGACCACCTGCAAATTGCACAAGCCACCGTGATCGGCT > NC_002947/4141065‑4141361 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |