| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 359,684 | G→A | 5.1% | intergenic (+41/+79) | gbdR → / ← PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 359,684 | 0 | G | A | 5.1% | 464.1 / 8.0 | 155 | intergenic (+41/+79) | gbdR/PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (66/81); new base A (6/2); total (72/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
CATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCA > NC_002947/359538‑359833 | cATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCa > 2:248840/1‑150 (MQ=255)cATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGATCa > 1:111819/1‑150 (MQ=255) gCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCt > 2:1127353/1‑150 (MQ=255) ccGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTg > 1:1633249/1‑150 (MQ=255) cGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGa > 2:2438181/1‑150 (MQ=255) cGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGa < 2:1965918/150‑1 (MQ=255) aTTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGc < 2:933231/150‑1 (MQ=255) gtcAGGCCATGACCTTGTCGCCGCACAGCGGGCCGAGGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACTCCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGa < 1:351402/148‑1 (MQ=255) gCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAg < 1:2250687/150‑1 (MQ=255) gacgatcctgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACGGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCa < 2:1759952‑M1/29‑1 (MQ=255) cATGACCCTGTTGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCGCTCGGGCG‑GATATCCGCGGACTTATGCT‑CTGACACCTTGCCGGCATCTTCGCGGGCACGCTCGCTTCCACATGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCg < 1:544462/150‑1 (MQ=255) aCCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCACTGAGCTTGAGCCAGCGGTGa > 1:856561/1‑150 (MQ=255) cctgccggcagtacgcccggccaacgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTg > 2:1133202‑M1/116‑150 (MQ=255) ccTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATc > 1:1653078/1‑150 (MQ=255) tgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTg > 2:1385219‑M1/114‑148 (MQ=255) tgccggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTg < 1:1385219‑M1/35‑1 (MQ=255) cTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCATTCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTTCGCCG‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCt < 1:1002073/150‑1 (MQ=39) cTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑AAGT‑TATCACTGCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCt < 1:1002148/150‑1 (MQ=38) tGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtg > 2:2289886/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtgtg < 1:1619755/150‑1 (MQ=255) ccggccgtaggccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtg > 2:1995906‑M1/111‑150 (MQ=255) cggcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggcctcttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtgt > 2:885355‑M1/110‑150 (MQ=255) cgccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTgg < 2:1557523/150‑1 (MQ=255) cgccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCCACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTgg < 1:1106093/150‑1 (MQ=255) gcagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACGGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCtgtg > 1:1759952‑M1/109‑150 (MQ=255) cagtacgccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGATCACC‑GCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTggg > 1:1801172‑M1/108‑150 (MQ=255) gcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCt < 2:834888/120‑1 (MQ=255) gcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGgggc > 1:591112/1‑150 (MQ=255) cacaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGgggcg > 1:2046354/1‑150 (MQ=255) acaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGgggcgg > 2:986359/1‑150 (MQ=255) acaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGgggcgg < 1:1083011/150‑1 (MQ=255) gccaggccatcgacaagcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcggaacaagcccgccCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTggg > 2:1166306‑M1/102‑145 (MQ=255) gCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGCTCTGTGGGGGCGGCCt < 2:636037/150‑1 (MQ=255) ccGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAg < 2:236461/123‑1 (MQ=255) ccGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAg > 1:236461/1‑123 (MQ=255) ccGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTc > 1:2280058‑M2/1‑149 (MQ=255) aTGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGCTCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgc < 1:347054‑M2/150‑5 (MQ=255) gcggcCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCGCAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaa > 2:1483085‑M2/1‑143 (MQ=255) gcggcCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaa > 1:918999‑M2/1‑143 (MQ=255) gcaactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggcctcttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAggg > 1:275264‑M1/85‑150 (MQ=255) ccTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGc < 2:1055899/150‑1 (MQ=255) caactgttgccagcgttggcgcagttcaacaaacgcgcgtaatccatttacccaggaccggccccttcgcgggcacgcccgctCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGaa > 1:2341981‑M1/84‑146 (MQ=255) cTGAGCCAGGCCCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGcc < 1:1564374/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTcc > 2:1072788/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCt < 1:1932690/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg < 1:1127353/150‑1 (MQ=255) gcgcAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTa > 1:1272158/1‑150 (MQ=255) gTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCCCCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTa < 2:1074354/150‑1 (MQ=255) 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1:1421845/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTg < 1:985649/150‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaaggggccggcgcggtgtcagagc < 1:1490849‑M2/98‑30 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGAt > 2:2280213/1‑150 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGAt < 1:2280213/150‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGGGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGAt < 1:1072788/150‑1 (MQ=255) cGCCCGATCGCACTTGGCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCt < 2:1995516/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaa > 1:427866‑M2/1‑62 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaa < 2:427866‑M2/69‑8 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGc > 2:1652832/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGAGCGGGCGTGCcgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgt < 1:541402‑M2/150‑90 (MQ=255) CCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTCAGTTGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACt < 1:748692‑M1/150‑1 (MQ=255) CACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGt < 2:2317994‑M1/77‑1 (MQ=255) CACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGt > 1:2317994‑M1/1‑77 (MQ=255) CACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGc < 2:1005220‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCg > 2:161998‑M1/1‑150 (MQ=255) aGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctca < 2:742147‑M2/120‑70 (MQ=255) aGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctca > 1:742147‑M2/1‑51 (MQ=255) aGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagcct < 2:1644107‑M2/82‑32 (MQ=255) aGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagcct > 1:1643789‑M2/1‑51 (MQ=255) gTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCa > 2:1309520/1‑150 (MQ=255) gTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCa > 2:1063376/1‑150 (MQ=255) gTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCa < 2:1733132/150‑1 (MQ=255) gTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGAGCGGGCGTGCcgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctgg > 1:1985739‑M2/1‑49 (MQ=255) | CATGATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGC‑CAGTGTAAGGCT‑CTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCGCTGAGCTTGAGCCAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCA > NC_002947/359538‑359833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |