| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,479,221 | G→C | 6.7% | W176C (TGG→TGC) | ybdR → | Zn‑dependent oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,479,221 | 0 | G | C | 6.7% | 377.7 / 15.0 | 120 | W176C (TGG→TGC) | ybdR | Zn‑dependent oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (58/53); new base C (5/3); total (63/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.64e-01 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TTCGGATACAGCCATCTGTATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCGGCTGGCCTA > NC_002947/4479072‑4479370 | ttCGGATACAGCCATCTGTATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTgg > 2:2261832/1‑150 (MQ=255) tACAGCCGTCTGTATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCg < 2:614509/150‑1 (MQ=255) aGCCATCTGTATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGtc > 1:225688/1‑150 (MQ=255) aGCCATCTGTATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTAATATCAGATATCCGTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGtc > 2:300519/1‑150 (MQ=255) aTCTGTATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGtcatc < 1:1545450/149‑1 (MQ=255) cTGTATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAAt < 2:2011327/150‑1 (MQ=255) tATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGcc > 1:580976/1‑150 (MQ=255) tATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGcc > 2:1568484/1‑150 (MQ=255) tGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTGCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGGCATCAATGCCga < 2:1164478/150‑1 (MQ=255) ggAGGGATCCCTGGATGCCAAGCTGATTACGTTACTTTGCCCAGAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCgag > 1:2300838/1‑150 (MQ=255) gAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAGAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCgaga < 2:173360/150‑1 (MQ=255) aTCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGc < 1:1025234/150‑1 (MQ=255) cTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAg > 2:1847903/1‑150 (MQ=255) ttgAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAgg > 2:283166/3‑150 (MQ=255) gCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCAt < 1:928881/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTGCGGAGGTTCAGAAGCTTAAGGACCCTCGCGGATGTCAATTTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCg > 1:414336/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGGCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACAGCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCTAAGGCTCAGCg > 2:240187/1‑150 (MQ=255) aaGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCgg > 2:2266882/1‑150 (MQ=255) aaGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCgg > 2:1371572/1‑150 (MQ=255) gCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTa > 2:387257/1‑150 (MQ=255) aTTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGa > 1:979058/1‑150 (MQ=255) gTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCCACACC‑ATTGTCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTAt < 2:1401631/150‑1 (MQ=255) gTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTAt > 2:387121/1‑150 (MQ=255) gTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTAt > 2:1757587/1‑150 (MQ=255) ttAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATg < 2:1586144/150‑1 (MQ=255) ggTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGgcgc < 2:1697335/150‑1 (MQ=255) tGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGtggga > 2:2244512/1‑100 (MQ=255) ccAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGc > 2:1683360/1‑150 (MQ=255) cAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGCCAAGCGGtgggaa < 1:69576/101‑6 (MQ=255) cAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGCCAAGCGGtgggaa > 2:69576/1‑96 (MQ=255) ggCCATGTCGGGCCATTCAAGGTCCCGACGACCCTCGCGGATCACAACGCTCTTTCGCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTg < 2:65191/150‑1 (MQ=255) ggCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTg < 1:2266882/150‑1 (MQ=255) gCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTgg < 1:1568484/150‑1 (MQ=255) cAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTggg < 1:2261832/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTg < 1:283166/150‑1 (MQ=255) ggCCATTCAAAGTCCCGACGACACTAGCGGACGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGa > 2:272293/1‑150 (MQ=255) ccATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGt < 1:104357/150‑1 (MQ=255) ccATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGt < 2:2166146/150‑1 (MQ=255) ccATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGt < 1:1371572/150‑1 (MQ=255) cATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGaa < 2:887174/101‑1 (MQ=255) ttCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGc < 1:203131/96‑1 (MQ=255) ttCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGc > 2:203131/1‑96 (MQ=255) cAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTgccgc < 2:979058/150‑1 (MQ=255) aaaGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTgccgcc > 2:2123747/1‑150 (MQ=255) tCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTgcg > 1:1027808/1‑150 (MQ=255) tCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTgcg > 2:1560202/1‑150 (MQ=255) cgacgaCCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTg > 1:1345608/1‑125 (MQ=255) cgacgaCCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCAc > 1:1738272/1‑150 (MQ=255) gacCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGAt > 1:1396328/1‑150 (MQ=255) gacCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGAt < 1:387257/150‑1 (MQ=255) cccTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGc < 2:1396328/150‑1 (MQ=255) tCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCGAGGGATCGTAAAGAACCTCTTTTGCCAACGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTgg < 1:543125/150‑1 (MQ=255) tCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTgg > 1:1163546/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATAAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTgg < 1:326032/150‑1 (MQ=255) gcgGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGgc > 2:1026617/1‑150 (MQ=255) ggATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGgcgc < 1:1757587/150‑1 (MQ=255) gATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGgcgcg > 1:1129352/1‑150 (MQ=255) cTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTa > 2:131097/1‑75 (MQ=255) cTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTa < 1:131097/75‑1 (MQ=255) tGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCa > 1:463268/1‑150 (MQ=255) tGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGAGGTCATCAATGAGGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCa > 1:1004597/1‑150 (MQ=255) ttCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtg > 2:17310/1‑150 (MQ=255) ttCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtg > 1:2443180/1‑150 (MQ=255) tCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtgg < 1:387121/150‑1 (MQ=255) ccTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtggt < 1:1157178/150‑1 (MQ=255) cTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtggtg > 1:125513/1‑150 (MQ=255) cTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtggtg < 1:150464/150‑1 (MQ=255) cTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGAGATCTGTGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTTTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtggtg < 1:2123747/150‑1 (MQ=255) tCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGAt < 2:1435956/150‑1 (MQ=255) cGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAt < 1:395294/141‑1 (MQ=255) cGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAt > 2:395294/1‑141 (MQ=255) aTCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAAc > 2:1546447/1‑150 (MQ=255) aTCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAAc < 2:414336/150‑1 (MQ=255) aTCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAAc < 2:619875/150‑1 (MQ=255) aTCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAAc > 2:2027285/1‑150 (MQ=255) aTCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAAc < 1:1683360/150‑1 (MQ=255) aTCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAAc < 2:1129352/150‑1 (MQ=255) ccTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTg < 2:488513/95‑1 (MQ=255) cTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGAc > 1:249126/1‑150 (MQ=255) attgatgaCCGCTTGCCAAGCGGCCACCAATGCCGAGGTTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATGTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGa > 1:193420/8‑150 (MQ=255) ttCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACt > 2:2027339/1‑150 (MQ=255) c‑cACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTAcc < 2:1027808/150‑1 (MQ=255) atgaCCGCTTGCCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtggt > 1:2025783/4‑134 (MQ=255) atgaCCGCTTGCCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAt > 1:1165774/4‑131 (MQ=255) atgaCCGCTTGCCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAt < 2:1165774/128‑1 (MQ=255) cACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCACAGGGTCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCg < 2:2300838/150‑1 (MQ=255) aCCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCgg > 2:1129258/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCgg > 2:1641736/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTGCCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCgg > 2:117038/1‑150 (MQ=255) cGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACTGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGTATGACAACGACTACCGGCt > 1:2180691/1‑150 (MQ=255) cGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTAc < 1:838305/145‑1 (MQ=255) cGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCGGCt < 1:2027339/150‑1 (MQ=255) gCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGgc < 1:923405/108‑1 (MQ=255) gCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGgc > 2:923405/1‑108 (MQ=255) gCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtggt < 1:974171/128‑1 (MQ=255) gCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCAtggt > 2:974171/1‑128 (MQ=255) ttGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCGGCTGGc > 1:117672/1‑150 (MQ=255) ttGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCGGCTGGc < 1:17310/150‑1 (MQ=255) gCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCGGCTGGCCTa > 2:1125270/1‑150 (MQ=255) gCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCGGCTGGCCTa > 2:1993471/1‑150 (MQ=255) | TTCGGATACAGCCATCTGTATGGAGGGATCCCTGGAGGCCAAGCTGATTACGTTAGGGTGCCCAAAGGCAATGTCGGGCCATTCAAAGTCCCGACGACCCTCGCGGATGACAAAGTGCTGTTCCTATCCGACATCCTTCC‑CACCGCTTGGCAAGCGGTCATCAATGCCGAGATTGGCGAAGGCTCATCGGTAGCGATCTATGGCGCGGGGCCAGTGGGGCTGTTGAGTGCCGCCTGCGCACGGATGCTGGGCGCGCACACCGTCTTCATGGTGGATGACAACGACTACCGGCTGGCCTA > NC_002947/4479072‑4479370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |