| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,519,505 | T→G | 5.8% | K20T (AAG→ACG) | clpA ← | ATP‑dependent serine protease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,519,505 | 0 | T | G | 5.8% | 219.6 / 4.0 | 78 | K20T (AAG→ACG) | clpA | ATP‑dependent serine protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/40); new base G (3/2); total (36/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
AACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGCGTATTGGTT > NC_002947/4519361‑4519653 | aaCGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGCTTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGaa > 1:888289/1‑150 (MQ=255)aaCGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGaa > 2:493549/1‑150 (MQ=255) gAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTg < 1:1372010/150‑1 (MQ=255) gAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGAGTGGCGCCACCGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGCCGCTTCGAACGGGCCTCCTTg > 2:398956/1‑150 (MQ=255) gTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGaa > 1:296594/1‑150 (MQ=255) gTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGaa < 2:1440648/150‑1 (MQ=255) gTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGaa < 2:1283299/150‑1 (MQ=255) gTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCACCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAAATCACTGCGCTTCGAACGGGCCTCCTTGaa < 1:324202/150‑1 (MQ=255) tCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAg < 2:1086838/150‑1 (MQ=255) tCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAg < 1:899313/150‑1 (MQ=255) gcGATGAACTCTTCCAGGTCATGCTTGCGCTTGTCGAGTCTGTGAAGTGATTTGCGTAGAACTGTCGCGGCAGCCTCATGGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAg < 2:1843045/149‑1 (MQ=255) gATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGc > 1:1788371/1‑150 (MQ=255) gATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGc > 1:2030418/1‑150 (MQ=255) gATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGGGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGc > 2:1038540/1‑150 (MQ=255) tGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCaa < 2:1738797/150‑1 (MQ=255) tctTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGTCaccctca > 2:2131110/1‑144 (MQ=255) tctTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTg > 1:1445554/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAg < 1:493549/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTACCAGCAGCAGATGCTCGCCGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAg < 1:53927/150‑1 (MQ=255) ggTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCGTGAAGGCAAGATTGAGGGTGa < 2:619138/150‑1 (MQ=255) gTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGAc > 2:2394474/1‑150 (MQ=255) aTGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGAtt > 1:1792194/1‑138 (MQ=255) aTGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGAtt < 2:1792194/138‑1 (MQ=255) gCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGa > 1:1018599/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAg > 1:372005/1‑150 (MQ=255) cTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGCCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTcgcg < 2:678556/150‑1 (MQ=255) ttGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCgg > 2:2076167/1‑150 (MQ=255) gTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGtt > 1:1660658/1‑150 (MQ=255) tCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGt < 2:1985956/131‑1 (MQ=255) tCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGt > 1:1985956/1‑131 (MQ=255) gagaTTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTaa > 2:1161164/1‑150 (MQ=255) tGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAg < 2:1788371/150‑1 (MQ=255) cacaGGCGCGCAGAACGGGCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCAc < 2:573339/150‑1 (MQ=255) caGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACggg < 2:282025/91‑1 (MQ=255) caGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACggg > 1:282025/1‑91 (MQ=255) aGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTc > 2:384993/1‑150 (MQ=255) gcgcgcAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCAt > 1:75793/1‑150 (MQ=255) gcAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATAccc > 2:1001806/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCg > 1:1021833/1‑150 (MQ=255) ggCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGa < 2:888289/150‑1 (MQ=255) gCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTaa < 2:1018599/150‑1 (MQ=255) gCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATACTACACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGCCGGCGATTaa < 1:1440738/150‑1 (MQ=255) ccTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCtt < 1:2152275/120‑1 (MQ=255) ccTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCtt > 2:2152275/1‑120 (MQ=255) ccTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGa > 1:2228669/1‑145 (MQ=255) ccTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGa < 2:2228669/145‑1 (MQ=255) tCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCg > 1:868709/1‑150 (MQ=255) tGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCt < 2:2030418/150‑1 (MQ=255) aaGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTtctc < 1:516895/150‑1 (MQ=255) agATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGc < 1:823286/150‑1 (MQ=255) agATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGc < 1:1065290/150‑1 (MQ=255) agATGCGCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGc < 1:822401/150‑1 (MQ=255) gATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCg > 2:100219/1‑150 (MQ=255) tCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGc > 2:281525/1‑150 (MQ=255) gaagcgTCATGAGTTCATGAC‑CGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTg < 1:2374186/145‑1 (MQ=255) gaagcgTCATGAGTTCATGAC‑CGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTg < 1:2374343/145‑1 (MQ=255) gaagcgTCATGAGTTCATGAC‑CGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTg > 2:2374343/6‑150 (MQ=255) gaagcgTCATGAGTTCATGAC‑CGTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTg > 2:2374186/6‑150 (MQ=255) gcgTCATGAGTTCATGACGCTTCGAACGGCCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTTACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGGTGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGc > 2:909995/3‑150 (MQ=255) cgTCATGAGTTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCt > 2:2392419/2‑150 (MQ=255) tCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTc > 2:1653922/1‑101 (MQ=255) tCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTc < 1:1653922/101‑1 (MQ=255) gAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCt > 2:2155684/1‑150 (MQ=255) aCTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTgg < 1:1038540/150‑1 (MQ=255) cTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGc < 1:531532/150‑1 (MQ=255) cTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGc < 1:281525/150‑1 (MQ=255) cTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGc < 2:1531483/150‑1 (MQ=255) cTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGc < 1:1161164/150‑1 (MQ=255) cTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACAGCCGGGCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGc < 1:1001806/150‑1 (MQ=255) tCATGACGCTTCGAACCGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGAATCACCGTCCTACTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGCg > 2:1970201/1‑150 (MQ=255) aTGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGCGTa < 1:384993/150‑1 (MQ=255) gACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCCTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGCGTAtt < 2:868709/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACCGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGCGTATTg < 1:2076167/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGCGTATTg > 2:299421/1‑150 (MQ=255) gCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACaga < 2:2393295/117‑1 (MQ=255) gCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACaga > 1:2393295/1‑117 (MQ=255) gCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGCGTATTGGt < 2:1021833/150‑1 (MQ=255) cTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTCACGCACCATCTCAATTTCACATATTACCTGATGCTGGCTTTCCCTGGCGTATTGGtt < 1:299421/150‑1 (MQ=255) | AACGGCGTGGTGGAGTCGATGAACTCTTGCAGGTCATGCTTGAGCTTGTCGAGATTGGCGCCACAGGCGCGCAGAACGGTCGCGGCAGCCTCATTGTCAAGGAGTGCCAGCAGCAGATGCTCGACGGTCATGAACTCATGACGCTTCGAACGGGCCTCCTTGAAGGCAAGATTGAGGGTGACTTCGAGCTCGCGGTTTAACATAGCTTCACCTCATACCCAAGTGGTCGGCGATTAACCGTCCTTCTCGATTTCACAGAGTAGCGGATGCTGGCTTTCCCTGGCGTATTGGTT > NC_002947/4519361‑4519653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |