Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,599,342 | C→A | 6.6% | Q171H (CAG→CAT) ‡ | PP_4071 ← | membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,599,342 | 0 | C | A | 6.6% | 359.7 / 7.7 | 114 | Q171H (CAG→CAT) ‡ | PP_4071 | membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (54/52); new base A (5/3); total (59/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.18e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GCTTGGGTTCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCG > NC_002947/4599193‑4599489 | gCTTGGGTTCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGcc > 2:2214298/1‑150 (MQ=255) cTTGGGTTCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCt > 2:2325835/1‑150 (MQ=255) ggTTCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTgcgc < 1:2361651/150‑1 (MQ=255) ggTTCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTgcgc > 2:1642883/1‑150 (MQ=255) ttCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTg > 2:916404/1‑150 (MQ=255) cAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTggcc < 2:425464/150‑1 (MQ=255) gTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGcccc < 1:2108557‑M2/150‑5 (MQ=255) tACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGccccg < 2:423024‑M2/150‑6 (MQ=255) aCCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGccccgt > 1:486939‑M2/1‑144 (MQ=255) cGAAGAATAAACATCAGGGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGc < 2:1320084/150‑1 (MQ=255) gAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggg > 1:1435954‑M2/1‑141 (MQ=255) cTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTgcgc < 1:2214298/150‑1 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 1:2096000/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:126132/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:1493075/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:1827326/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:379182/1‑150 (MQ=255) aaCGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCtt < 1:107759/150‑1 (MQ=255) gTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTc > 2:2241515/1‑150 (MQ=255) cAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGa < 1:1674951/150‑1 (MQ=255) aGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGAt > 1:1929404/1‑150 (MQ=255) aGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggtggatcagca > 1:774961‑M2/1‑127 (MQ=255) aGTGGAGTCACAGCTCAGAGAATTTACGGGGACGATCAGACTGTGAAAGGCACCGGGATGGGCGATGATCAGCGCATCATTGCTGATCTACCACTCCACGTGGTAGGCGCGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGAt > 2:628795/1‑150 (MQ=255) tGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTTCCTGCGCCTTGTCGATGc < 1:2267753/150‑1 (MQ=255) gAGTCACTGCCCAGCGACTCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg < 1:2031828/150‑1 (MQ=255) gAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg < 1:1493075/150‑1 (MQ=255) tCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTc > 1:1046006/1‑150 (MQ=255) tCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTc < 2:1046006/150‑1 (MQ=255) gcTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCaa < 2:503383/149‑1 (MQ=255) aCTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGTCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCaa > 1:301089/1‑150 (MQ=255) cTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg < 1:1903366/144‑1 (MQ=255) gCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACga > 2:872516/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACga < 1:1875991/150‑1 (MQ=255) 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gatgatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGgc < 1:1827326/150‑1 (MQ=255) atgatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTCGCCTAccccgtggggtggt < 1:1293019‑M2/77‑15 (MQ=255) atgatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTCGCCTAccccgtggggtggt > 2:1293019‑M2/1‑63 (MQ=255) gatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGgcctgcct < 1:2168767/144‑1 (MQ=255) gatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGgcctgcct > 2:2168767/1‑144 (MQ=255) gatCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGcc < 1:872516/150‑1 (MQ=255) tCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCa > 1:485790/1‑150 (MQ=255) tCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCa < 2:2376885/150‑1 (MQ=255) aCCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGc > 1:1765217/1‑150 (MQ=255) ccGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGTCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCa > 1:653373/1‑150 (MQ=255) ccGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCa < 1:1102091/150‑1 (MQ=255) gCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATc < 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catcatTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGa < 2:267444/150‑1 (MQ=255) atcatTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg > 2:564633/1‑79 (MQ=255) atcatTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg < 1:564633/79‑1 (MQ=255) atTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGt > 2:917027/1‑78 (MQ=255) atTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGt < 1:917027/78‑1 (MQ=255) ttGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTAc > 1:2314229/1‑150 (MQ=255) cTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCTACTAGAAACTTTGATCCGTGCACTCACTAATTCATCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCAc > 1:2377561/1‑150 (MQ=255) tGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACg < 1:1129138/150‑1 (MQ=255) tGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACg < 2:485790/150‑1 (MQ=255) tGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACg > 2:1630442/1‑150 (MQ=255) tGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGCCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACg > 2:71678/1‑150 (MQ=255) tCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAAc < 1:748704/81‑1 (MQ=255) tCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAAc > 2:748704/1‑81 (MQ=255) caccacCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAAt < 1:126132/150‑1 (MQ=255) accCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGt > 1:1502988/1‑150 (MQ=255) accCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGt > 2:1044397/1‑150 (MQ=255) ccccACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTa < 1:1630442/150‑1 (MQ=255) cccACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTAc > 2:262209/1‑150 (MQ=255) ccACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGccccgtggggtggtggatcagcaatgatgcggtgatcatcgacccgcccggtgcctttatca > 2:650812‑M2/1‑32 (MQ=255) ggTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAgcgcgc > 1:1364135/1‑150 (MQ=255) gcCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCg < 1:28118/150‑1 (MQ=255) | GCTTGGGTTCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCG > NC_002947/4599193‑4599489 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |