| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,599,349 | G→C | 8.9% | P169R (CCA→CGA) | PP_4071 ← | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,599,349 | 0 | G | C | 8.9% | 340.0 / 19.7 | 111 | P169R (CCA→CGA) | PP_4071 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/49); new base C (6/4); total (58/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.09e-01 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TTCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCATTGTC > NC_002947/4599200‑4599497 | ttCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTg > 2:916404/1‑150 (MQ=255) cAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTggcc < 2:425464/150‑1 (MQ=255) gTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGcccc < 1:2108557‑M2/150‑5 (MQ=255) aCCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGccccgt > 1:486939‑M2/1‑144 (MQ=255) cGAAGAATAAACATCAGGGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGc < 2:1320084/150‑1 (MQ=255) gAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggg > 1:1435954‑M2/1‑141 (MQ=255) cTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTgcgc < 1:2214298/150‑1 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 1:2096000/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:379182/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:1827326/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:1493075/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 2:126132/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGcc > 1:267444/1‑150 (MQ=255) aaCGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCtt < 1:107759/150‑1 (MQ=255) gTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTc > 2:2241515/1‑150 (MQ=255) gTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggtggatca < 1:2219249‑M2/150‑21 (MQ=255) cAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGa < 1:1674951/150‑1 (MQ=255) aGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGAt > 1:1929404/1‑150 (MQ=255) aGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggtggatcagca > 1:774961‑M2/1‑127 (MQ=255) aGTGGAGTCACAGCTCAGAGAATTTACGGGGACGATCAGACTGTGAAAGGCACCGGGATGGGCGATGATCAGCGCATCATTGCTGATCTACCACTCCACGTGGTAGGCGCGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGAt > 2:628795/1‑150 (MQ=255) gTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggtggatcagcaa > 2:2219249‑M2/1‑126 (MQ=255) tGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTTCCTGCGCCTTGTCGATGc < 1:2267753/150‑1 (MQ=255) gAGTCACTGCCCAGCGACTCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg < 1:2031828/150‑1 (MQ=255) gAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg < 1:1493075/150‑1 (MQ=255) tCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTc > 1:1046006/1‑150 (MQ=255) tCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTc < 2:1046006/150‑1 (MQ=255) gcTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCaa < 2:503383/149‑1 (MQ=255) aCTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGTCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCaa > 1:301089/1‑150 (MQ=255) cTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg < 1:1903366/144‑1 (MQ=255) cTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg > 2:1903366/1‑144 (MQ=255) gCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACga > 2:872516/1‑150 (MQ=255) cccAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGcc < 2:291400/123‑1 (MQ=255) cccAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGcc > 1:291400/1‑123 (MQ=255) cccAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGCCGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtggggtggt < 1:2449355‑M2/128‑15 (MQ=255) cccAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGACCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGcc < 2:2096178/123‑1 (MQ=255) cAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGaa > 2:348279/1‑150 (MQ=255) aGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGaaa > 1:475371/1‑150 (MQ=255) aGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGaaa > 2:203141/1‑150 (MQ=255) aGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGaaa > 2:562308/1‑150 (MQ=255) aGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCCAGCGCAGGCGCTCGCCTAccccgtgg < 2:86921‑M2/119‑9 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catcatTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGa < 1:399004/150‑1 (MQ=255) catcatTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGAGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGa > 1:1379104/1‑150 (MQ=255) atcatTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg > 2:564633/1‑79 (MQ=255) atcatTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCgg < 1:564633/79‑1 (MQ=255) atTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGt > 2:917027/1‑78 (MQ=255) atTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGt < 1:917027/78‑1 (MQ=255) ttGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTAc > 1:2314229/1‑150 (MQ=255) cTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCTACTAGAAACTTTGATCCGTGCACTCACTAATTCATCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCAc > 1:2377561/1‑150 (MQ=255) tGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACg < 1:1129138/150‑1 (MQ=255) tGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACg < 2:485790/150‑1 (MQ=255) tGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACg > 2:1630442/1‑150 (MQ=255) tGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGCCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACg > 2:71678/1‑150 (MQ=255) tcaaccaccCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCa > 1:1816648/4‑150 (MQ=255) tCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAAc < 1:748704/81‑1 (MQ=255) tCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAAc > 2:748704/1‑81 (MQ=255) caccacCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAAt < 1:126132/150‑1 (MQ=255) accCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGt > 2:1044397/1‑150 (MQ=255) accCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGt > 1:1502988/1‑150 (MQ=255) ccccACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTa < 1:1630442/150‑1 (MQ=255) ccccACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGAGCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTa > 2:482979/1‑150 (MQ=255) cccACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTAc > 2:262209/1‑150 (MQ=255) ggTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAgcgcgc > 1:1364135/1‑150 (MQ=255) gcCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCg < 1:28118/150‑1 (MQ=255) gcTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCAtt < 1:225404/149‑1 (MQ=255) gcTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCAtt > 2:225404/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGTCCAACGGCATTGTc > 2:2037451/1‑150 (MQ=255) | TTCCAGACGGTACCGAAGACTCAACGTCAGTGGAGTCACTGCCCAGCGAATCTGCGGGGCCGTTCTGGCTGATAAAGGCACCGGGCGGGTCGATGATCACCGCATCATTGCTGATCCACCACCCCACGGGGTAGGCGAGCGCCTGCGCTGGCCGGCCCCGTGCCTGCGCCTTGTCGATGCGGGTCAACGAGAAACTTTGATCGGTGCAGTCAATAAAGCTGCTCTTGCCGGCCTGCCTGGCGCCCAGCACGAGGTACCACGGCAATCGGTACAGCGCGCGACGCCCACCGGCATTGTC > NC_002947/4599200‑4599497 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |