| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,964,700 | C→T | 17.0% | E235K (GAA→AAA) | fleQ ← | transcriptional regulator FleQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,964,700 | 0 | C | T | 17.0% | 180.5 / 26.4 | 81 | E235K (GAA→AAA) | fleQ | transcriptional regulator FleQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/33); new base T (7/7); total (41/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGTT > NC_002947/4964554‑4964847 | gatgatGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGACCAGGACGaa > 2:1995730/1‑150 (MQ=255) atgatgCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGaaa < 1:1080294/150‑1 (MQ=255) gcgcACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGccc > 2:1544885/1‑150 (MQ=255) aTGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTg > 1:140969/1‑150 (MQ=255) aTGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCAACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACCCGAAGAAGCTTGACATTACCCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCTTTTTACATGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCTg < 2:865874/150‑1 (MQ=255) tGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCATGGCTgg < 2:1332265/150‑1 (MQ=255) tGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTgg < 1:2146065/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGt < 1:467228/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGt < 2:426703/150‑1 (MQ=255) tttNGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGa > 2:1501342/1‑150 (MQ=255) tttGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGa < 1:1516878/150‑1 (MQ=255) tCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGccc < 2:1569329/150‑1 (MQ=255) cTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGc > 2:2057210/1‑127 (MQ=255) cTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGc < 1:2057210/127‑1 (MQ=255) ttgttgCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTc < 2:2420813/119‑1 (MQ=255) ttgttgCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTc > 1:2420813/1‑119 (MQ=255) ttgttgCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCg > 1:842521/1‑150 (MQ=255) gttgCTACCCACGCGCGCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGt > 2:692334/1‑150 (MQ=255) gCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGACACGGCGGTCACGGCTGGTGATTGCCCCGGTaaa < 1:1242224/150‑1 (MQ=37) ccACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGgcgc < 1:2149272/150‑1 (MQ=255) ccACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGgcgc < 2:2400062/150‑1 (MQ=255) cACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGcc > 2:1113401/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCtt > 1:719022/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCg > 1:2215717/1‑150 (MQ=255) gAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTg > 1:100819/1‑150 (MQ=255) ggTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGgc < 2:431948/135‑1 (MQ=255) ggTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGgc > 1:431948/1‑135 (MQ=255) aCGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGaa > 2:2065791/1‑150 (MQ=255) gCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACa > 1:1467581/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGtt < 1:1544885/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTc < 2:1366917/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTc > 2:1750361/1‑150 (MQ=255) cTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTc < 1:12909/150‑1 (MQ=255) acacGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTcc < 1:692334/150‑1 (MQ=255) acGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCcag > 2:571673/1‑150 (MQ=255) tCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGTCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCgcgc > 2:916043/1‑150 (MQ=255) cAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTg > 1:762102/1‑105 (MQ=255) cAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTg < 2:762102/105‑1 (MQ=255) aaaCGGCACGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCGGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCcaca < 2:1933376/149‑1 (MQ=255) aaCGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAg > 1:1392386/1‑150 (MQ=255) aCGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTACAGCAGGTCGGCCGAGATCTCCCcacact < 2:1731036/150‑3 (MQ=39) ggCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTg > 2:1122254/1‑150 (MQ=255) gCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGa < 2:140969/150‑1 (MQ=255) aTGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCTCCACAGTTGAcc > 2:928379/1‑150 (MQ=255) aTGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGAcc < 2:842521/150‑1 (MQ=255) tCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGc > 1:2000922/1‑150 (MQ=255) gCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGAc < 1:541158/144‑1 (MQ=255) gCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGAc > 2:541158/1‑144 (MQ=255) ccGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGaa < 2:970008/98‑1 (MQ=255) ccGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGaa > 1:970008/1‑98 (MQ=255) gATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCAGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGaa > 1:1585344/1‑150 (MQ=255) gtcgAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGgcgc > 1:381550/1‑150 (MQ=255) gtcgAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACTGGTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGgcgc > 1:1844903/1‑150 (MQ=255) gAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGGTGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGa < 2:887277/116‑1 (MQ=255) gAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGGTGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGa > 1:887277/1‑116 (MQ=255) gAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTc > 2:935643/1‑150 (MQ=255) gAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTTGAAACGTCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTcgcg < 1:916043/150‑1 (MQ=255) gAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTcgcg > 1:320692/1‑150 (MQ=255) 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ccgccgTTGGCCAGTTCGAGACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGaa < 1:732031/150‑1 (MQ=255) gccgTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATg < 2:320692/150‑1 (MQ=255) gCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGc < 1:1449739/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGaa > 2:703362/1‑140 (MQ=255) ccAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGaa < 1:703362/140‑1 (MQ=255) ccAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCa < 1:935643/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGtt < 1:1620332/105‑1 (MQ=255) cAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGtt > 2:1620332/1‑105 (MQ=255) cAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAg < 1:1113401/150‑1 (MQ=255) aGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAgg > 2:713454/1‑150 (MQ=255) aGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAgg < 1:1122254/150‑1 (MQ=255) aGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATAGCGTCTCTGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAgg < 1:1995730/150‑1 (MQ=255) aGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCGGTTCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAgg > 1:1991837/1‑150 (MQ=255) gTTTGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGt > 1:2342108/1‑150 (MQ=255) gTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGt < 2:1467581/150‑1 (MQ=255) ttCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGtt > 1:2424801/1‑150 (MQ=255) ttCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGtt > 2:2318440/1‑150 (MQ=255) ttCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGtt > 2:2126076/1‑150 (MQ=255) | GATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGGTGATGGCCCCGGTAAAGGCGCCCTTCTCGTGGCCGAACAGTTCGCTTTCCAGCAGCTCGGCCGGGATCGCGCCACAGTTGACCGGCACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGTT > NC_002947/4964554‑4964847 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |