| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,232,102 | C→G | 11.7% | A214A (GCG→GCC) | PP_4610 ← | PepSY‑associated TM helix domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,232,102 | 0 | C | G | 11.7% | 382.9 / 33.4 | 127 | A214A (GCG→GCC) | PP_4610 | PepSY‑associated TM helix domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/62); new base G (6/9); total (56/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GCCCCCGGCTGCAGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTGAAGAACTCCTTGAAGAT > NC_002947/5231953‑5232251 | gcCCCCGGCTGCAGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCACCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGccc > 1:1146497/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGCAGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCccgccg > 1:1864/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGCAGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGAGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCccgccg > 2:584294/1‑150 (MQ=255) gCTGCAGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCa > 2:1757391/1‑150 (MQ=255) tGCAGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATc > 1:2085896/1‑150 (MQ=255) tGCAGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATc > 1:465169/1‑150 (MQ=255) cAGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCAc < 2:1928050/150‑1 (MQ=255) aGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCGGCGGGCATCatg < 2:328954/150‑3 (MQ=255) aGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCGGCGGGCATCatg < 1:849224/150‑3 (MQ=255) aGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCGGCGGGCATCatg < 2:756818/150‑3 (MQ=255) aGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCATTTCGGGCGTCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCGGCGGGCATCatg < 1:147172/150‑3 (MQ=255) gCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCa > 1:473603/1‑150 (MQ=255) gCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCa > 2:2440868/1‑150 (MQ=255) gCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCa > 1:1848082/1‑150 (MQ=255) gCTCCTGCACCTGGGGGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTCGCCGCCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCa < 2:326663/150‑1 (MQ=255) cTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCAt < 2:2264560/150‑1 (MQ=255) tcttGCACCTTGGCGTACAGGCCCGGCAGCGCTACCCGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTTGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATg < 2:420348/147‑1 (MQ=255) tCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATg < 1:1757391/150‑1 (MQ=255) tCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATg < 2:420268/150‑1 (MQ=255) ccTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCGGCGGGCATCatg > 2:688356/1‑144 (MQ=255) ccTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCGGCGGGCATCatg < 1:688356/146‑3 (MQ=255) tGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCGGCGGGCATCatg < 1:1802571/144‑3 (MQ=255) tGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCGGCGGGCATCatg > 2:1802571/1‑142 (MQ=255) cACCTTGGCGTACGGGCTTGGGCGAGCTTAGAGCGGTTTGCCCGCCTTTGCCGGCCGTGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACAt < 2:624604/150‑1 (MQ=255) cACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGTCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACAt < 1:1329108/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGa > 1:2033809/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCCTGGGCGTATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTAAAGTACTTGTCGGGGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGAGGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGaa < 1:1877529/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAAc < 2:473603/150‑1 (MQ=255) tGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGTGTCGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACa < 2:1246377/150‑1 (MQ=255) tGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACa < 2:465169/150‑1 (MQ=255) cGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCa < 2:2295271/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGgct > 2:1987947/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGgct > 2:1179293/1‑150 (MQ=255) cTCGGCAGCGCTACCAGCGGCCCGGGGGAGGGGCGCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGnctg < 2:1495447/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGCAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCAt < 1:2389490/124‑1 (MQ=255) gCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCAt > 2:2389490/1‑124 (MQ=255) cgcTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCt < 1:1987947/150‑1 (MQ=255) cTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGa < 2:1980492/150‑1 (MQ=255) cTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGa < 2:1864/150‑1 (MQ=255) cTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGa < 2:1848082/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTa < 1:80576/141‑1 (MQ=255) cAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTa > 2:80576/1‑141 (MQ=255) gcggcgTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGTGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCgg > 1:2365379/1‑103 (MQ=255) gcggcgTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGTGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCgg < 2:2365379/103‑1 (MQ=255) gcggcgTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGAtcatca < 2:1415303/150‑1 (MQ=255) tGGCCACCTGGGCCACCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTAATTGCCTTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGaa < 2:1146497/150‑1 (MQ=255) gCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCACGACACCCGCCTGCATCAACATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAAc > 2:72518/1‑150 (MQ=255) aCCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAAc > 2:1384362/1‑111 (MQ=255) aCCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCAc < 2:2271861/116‑1 (MQ=255) aCCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCAc > 1:2271861/1‑116 (MQ=255) cTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGgcag > 1:1701092/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGat > 2:91318/1‑122 (MQ=255) gcgcATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGa > 2:353214/1‑150 (MQ=255) cATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGctgctg > 1:367368/1‑107 (MQ=255) cATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATgg > 2:793829/1‑150 (MQ=255) aTCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAg > 1:633282/1‑120 (MQ=255) ttGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGa > 2:90838/1‑109 (MQ=255) ttGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGa < 1:90838/109‑1 (MQ=255) ttGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAg > 2:2349534/1‑116 (MQ=255) cGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGATACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGc < 2:1345780/150‑1 (MQ=255) aaaCAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTc > 1:443234/1‑150 (MQ=255) tCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTccagccag < 1:2440868/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGatc < 2:482646/93‑1 (MQ=255) ttGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGaa > 1:1813954/1‑150 (MQ=255) tGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAAc < 1:793829/150‑1 (MQ=255) aaGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGc < 2:1701092/150‑1 (MQ=255) aGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCt > 1:134830/1‑150 (MQ=255) gTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTg < 1:812986/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCTGCCTGAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCtt < 1:2273970/150‑1 (MQ=255) ggTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTccagc > 2:2141839/1‑130 (MQ=255) ggTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTccagc < 1:2141839/130‑1 (MQ=255) gtgtCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTAc > 2:563563/1‑48 (MQ=255) gtgtCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTAc < 1:563563/48‑1 (MQ=255) gtgtCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAg < 2:2082056/83‑1 (MQ=255) tgtCATTGCCGTAGCTGGCCATGCCTGCCTCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAg > 1:1519842/1‑150 (MQ=255) tgtCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTccagcca > 1:1977135/1‑130 (MQ=255) cATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGc < 1:741362/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGcagcac < 2:384569/93‑1 (MQ=255) aTTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGcccc < 2:2338538/139‑1 (MQ=255) aTTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGcccc > 1:2338538/1‑139 (MQ=255) aTTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCg > 1:2107018/1‑150 (MQ=255) aTTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCg > 1:1897890/1‑150 (MQ=255) tAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTg > 1:1720834/1‑150 (MQ=255) tAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCAGCAGGTGATGCGGCAGCACCAGAAAGCCGAAAACCGCGTTGCCACCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGCAGGTg > 1:1741995/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTgaa < 1:353214/150‑1 (MQ=255) ggCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTgaagaa > 2:1948328/1‑150 (MQ=255) atggtgatgCCGGCGGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGaa > 2:1692371/5‑140 (MQ=255) atggtgatgCCGGCGGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGaa < 1:1692371/136‑1 (MQ=255) cATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAg > 1:1591267/1‑63 (MQ=255) cATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTGAAGAACTc < 1:1179293/150‑1 (MQ=255) gtgatgCCGGCGGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTGAAGAACTcc < 2:128253/149‑1 (MQ=255) gtgatgCCGGCGGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTGAAGAACTcc > 1:128253/2‑150 (MQ=255) atgatgCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGAAAGGTGAAGAACTcc < 1:1032746/150‑1 (MQ=255) tgatgCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTGAAGAACTCCt < 1:584294/150‑1 (MQ=255) gatgCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTGAAGAACTCCtt < 1:2362758/150‑1 (MQ=255) atgCCGGCGGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTgaa < 2:719351/140‑1 (MQ=255) atgCCGGCGGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTgaa > 1:719351/1‑140 (MQ=255) ccgccgGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGgcag < 1:164756/67‑1 (MQ=255) ccgccgGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGgcag > 2:164756/1‑67 (MQ=255) cgccgGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTGAAGAACTCCTTGAAGAt < 2:134830/150‑1 (MQ=255) | GCCCCCGGCTGCAGCTCCTGCACCTTGGCGTACAGGCTCGGCAGCGCTACCAGCGGCGTGGCCACCTGGGCCGCCTTGGGCGCATCGTTGCGGCCAAACAGGTCGTTGAAGTACTTGTCGGTGTCATTGCCGTAGCTGGCCATGATGCCCGCCGGCATCACCATGTACATGAACAGCACCAGGCTGCTGTAGCTGATCATCAGGTGAAACGGCAGCACCAGCACGCCGATGGCATTGTGCCCGTCCAGCCAGGAACGCTGCCCCTTGCCAGGGCGGAAGGTGAAGAACTCCTTGAAGAT > NC_002947/5231953‑5232251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |