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gACCAGTGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGc < 1:1103051/150‑1 (MQ=255) gACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGc < 2:1361096/150‑1 (MQ=255) gACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGc < 2:367760/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGcc > 2:2086860/1‑150 (MQ=255) gggccGACGGATTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCGGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGCCagcagc > 2:1274181/4‑150 (MQ=255) cACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGCCAGCAGcc > 1:629211/1‑150 (MQ=255) aCCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGCCAGCAGCCa < 2:1620385/150‑1 (MQ=255) ccGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGCCAGCAGCCAg < 1:1038820/150‑1 (MQ=255) gACGTTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCa < 1:2377800/98‑1 (MQ=255) gACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCa > 2:2377800/1‑98 (MQ=255) tgtCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGCCAGCAGCCAGTGCTTGc > 1:668118/1‑150 (MQ=255) | CCATGCCATAGGTGAGGCCGTGGTAGATCTCGTCCACCACCAGATGGCCATGCCGCTCGTGGGTGGTTCTGGCCAGGCAGGCCAACGCCTCGCGCCCCAGCACGGTACCGGTCGGGTTGGCCGGCGAAGCGACCAGGGCACCGACGGTGTCCTTGTCCCAGTAGCGCTCAACCAGGTCGGCAGTCAGCTGATAGTTCACATCCGGGCCCACCGGTACCAATTGGGCCCCGCCCTCGACCAGGCGCAGGAAGTGGCGATTGCACGGGTAACCCGGATCGGCCAGCAGCCAGTGCTTGC > NC_002947/5330966‑5331262 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |