| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 463,680 | T→C | 6.0% | K474E (AAA→GAA) | davB ← | lysine 2‑monooxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 463,680 | 0 | T | C | 6.0% | 407.4 / 9.0 | 133 | K474E (AAA→GAA) | davB | lysine 2‑monooxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/68); new base C (3/5); total (60/73) | |||||||||||
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Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GTCTGCACCGCGCCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGCCCGGCGATATCGGTCTTCGGGTAGATCTTCTTCAGCGCATCCAGGGCCAGTTGTACGCGCTTTTCCACCGGGTGCGGCAGCATC > NC_002947/463532‑463828 | cTGCACCGCGCCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGaa < 1:1850023/150‑1 (MQ=255) ctccGCGCCCTGAACCCAGGCGGGGGTGCATGACACGTCGTAACAGGAAAAGAAGATACAGCGCTGATCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTCCATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGgc < 2:1086561/148‑1 (MQ=255) cACCGCGCCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGgc < 1:2439184/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGgcgc > 2:1544915/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACANGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTCAAAGgcgc < 1:454459/150‑1 (MQ=255) cgcgCCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGcc > 2:598096/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTCAAAGgcgcgc < 2:1998515/150‑3 (MQ=255) cgcCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGa < 2:1686935/150‑1 (MQ=255) cgcCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTCAAAGgcgcgct < 1:1221223/150‑4 (MQ=255) gcCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAg > 1:1110960/1‑150 (MQ=255) ttCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTAAACTGCAATTAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGaa < 2:190634/150‑1 (MQ=255) aaCCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGAGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGgcgc > 1:1114242/1‑140 (MQ=255) ttgaaGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGTAAGTGCCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTAc < 1:1241172/146‑1 (MQ=255) aCCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTAc < 1:1059072/150‑1 (MQ=255) cccAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGaa > 1:1456486/1‑133 (MQ=255) ccAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCTGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACgg < 1:2304945/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACgg > 1:2026784/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGGCCACCCTGCCCCGTCGTCACCGGCAATGAAAATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACgg > 2:585828/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCGGGGGGAAGTGCGCGTACATACGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGt > 1:1354023/1‑150 (MQ=255) gCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCg < 1:429966/150‑1 (MQ=255) gggggTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGc < 2:1630024/150‑1 (MQ=255) gcccATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATCAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAATTACGGGTCGGCCTcc < 2:306329/148‑1 (MQ=255) cATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTg > 2:1987195/1‑117 (MQ=255) cATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAg < 2:770135/150‑1 (MQ=255) aTGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGaa > 2:2127685/1‑130 (MQ=255) aTGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGaa < 1:2127685/130‑1 (MQ=255) acacGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGaaa < 1:1301306/150‑1 (MQ=255) acacGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGaaa < 1:2001866/150‑1 (MQ=255) acGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAAcc < 2:1606288/150‑1 (MQ=255) gtcgtcACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGt < 2:1110960/150‑1 (MQ=255) gtcgtcACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGAGCGCTAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGt > 1:625881/1‑150 (MQ=255) gtcACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGAt < 1:2279039/150‑1 (MQ=255) tcACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATc > 1:1720508/1‑150 (MQ=255) aCCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCgg > 2:1441304/1‑150 (MQ=255) 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gAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGa < 2:1271967/137‑1 (MQ=255) gAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGa > 1:1271967/1‑137 (MQ=255) cgcgCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATTGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGcc < 1:1986242/150‑1 (MQ=255) cgcgCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGaa < 1:144631/88‑1 (MQ=255) cgcgCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGaa > 2:144631/1‑88 (MQ=255) cgcgCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGcc > 2:1824635/1‑150 (MQ=255) 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cccGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGCCCGGCGATATCGGTc > 1:2313502/1‑96 (MQ=255) cccGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGCCCGGCGATATCGGTc < 2:2313502/96‑1 (MQ=255) ccGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGCCCGGCGATATCGGTCTTc > 1:2228802/1‑98 (MQ=255) ccGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGCCCGGCGATATCGGTCTTc < 2:2228802/98‑1 (MQ=255) tcggcgcCTTCAAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGCTCGGGTCGCCGGTGATGTGCCCGGCGATATCGGTCTTCGGGTAGATCTTCTTCAGCGCATCCAGGGCCAGTTGTACGCGCTTTTCCACCGGGTGc > 1:1407364/4‑150 (MQ=255) tcggcgcCTTCAAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGCCCGGCGATATCGGTCTTCGGGTAGAtcttc < 1:1647195/102‑1 (MQ=255) cgcCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGCCCGGCGATATCGGTCTTCGGGTAGATCTTCTTCAGCGCATCCAGGGCCAGTTGTACGCGCTTTTCCACCGGGTGCGgca < 1:1824635/150‑1 (MQ=255) 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GTCTGCACCGCGCCTTCAACCCAGGCGGGGGTCCATGACACGTCGTCACCGGCAATGAAGATACCGCGCTGCTCCGCCGGCATGTCCTGCTGCATGAAGTGCGCGTACATGCGCTGGTTGTAGCGGTAATGGCCCGGAAGCGCGCCTTTGAAGGCGCCGAGGAAGTACGGGTCGGCCTCCCAGGAAACCGTGATCGGGTCGCCGATGATGTGCCCGGCGATATCGGTCTTCGGGTAGATCTTCTTCAGCGCATCCAGGGCCAGTTGTACGCGCTTTTCCACCGGGTGCGGCAGCATC > NC_002947/463532‑463828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |