Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,451,668 | C→T | 9.0% | P51S (CCG→TCG) | lnt → | apolipoprotein N‑acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,451,668 | 0 | C | T | 9.0% | 367.2 / 17.6 | 131 | P51S (CCG→TCG) | lnt | apolipoprotein N‑acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (62/57); new base T (6/6); total (68/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTGGCC > NC_002947/5451522‑5451817 | gTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCcgc > 2:950174/1‑150 (MQ=255) gTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCcgc > 1:1189286/1‑150 (MQ=255) gATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCa < 2:2024724/150‑1 (MQ=255) gATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCATGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCgcgca < 1:103020/150‑2 (MQ=255) aTCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAg > 1:1682006/1‑150 (MQ=255) tCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAgg > 1:319484/1‑150 (MQ=255) tCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAgg > 2:1018640/1‑150 (MQ=255) ccGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGTCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCAt > 1:748103/1‑150 (MQ=255) 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cGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtggtg < 1:2329022/150‑1 (MQ=255) cGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtggtg < 2:755551/150‑1 (MQ=255) cGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtg < 2:2172618/147‑1 (MQ=255) cGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCtg > 1:2172618/1‑147 (MQ=255) aaCCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGTCCATGTGGCGTGGCTGGTggttt < 2:1189286/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgg < 2:2325152/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttggg < 2:1682006/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggt > 2:1858333/1‑150 (MQ=255) gctgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGCTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggtt > 1:1712332/1‑150 (MQ=255) ctgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggttt < 2:1310887/150‑1 (MQ=255) ctgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGACCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggttt < 2:1655962/150‑1 (MQ=255) tgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggtttg < 1:1680911/150‑1 (MQ=255) tgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttg < 2:1915893/144‑1 (MQ=255) tgGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGCgggttg > 1:1915893/1‑144 (MQ=255) tagCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTggtttgggtttg < 2:1365319/148‑1 (MQ=255) gCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGc > 2:1549944/1‑150 (MQ=255) cccTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCGGTTCGCGGTGTTGTCCATCGGGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGcc > 1:290602/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCt > 2:1344790/1‑150 (MQ=255) gcggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTAt < 1:953770/150‑1 (MQ=255) cggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATg < 1:156064/150‑1 (MQ=255) ggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTTTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCATGCCATGTGGCGTGGGTGGTGGTTTGGGGTTGGCCTGTATgg > 2:156914/1‑150 (MQ=255) ggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCgcgcagg < 1:2348292/110‑4 (MQ=38) ggcCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCgcgcagg > 2:2348292/1‑107 (MQ=38) cGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGgcgc < 1:1858333/150‑1 (MQ=255) ggTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGgc > 2:1888275/1‑147 (MQ=255) gTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCg > 1:307353/1‑150 (MQ=255) gTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCg > 2:2383342/1‑150 (MQ=255) cTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtggcg > 1:1638704/1‑112 (MQ=255) ttCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCAc > 1:1900376/1‑150 (MQ=255) gaacgttctggccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTAGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCGTGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGCATGGCGCCAGCACCtg > 2:1225055/8‑150 (MQ=255) cACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCATTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtg > 2:2006270/1‑150 (MQ=255) aCCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtgg > 1:378979/1‑150 (MQ=255) cctcctGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtggtg < 1:1018640/150‑1 (MQ=255) cctcctGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTCGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGCGCTCCGCCCGCGCCAGTCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCCGTATGGCGCCGGCCCCtggtg > 1:914420/1‑150 (MQ=255) tcctGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGa < 1:755138/150‑1 (MQ=255) tcctGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGa > 2:755138/1‑150 (MQ=255) gccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTAc > 2:2109701/1‑150 (MQ=255) gccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTAc < 2:307353/150‑1 (MQ=255) gccctcgcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTAc < 2:1954527/150‑1 (MQ=255) ccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtgg < 1:696515/95‑1 (MQ=255) ccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATgtgg > 2:696515/1‑95 (MQ=255) ccctggcGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACg < 2:748103/150‑1 (MQ=255) 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2:1834580/99‑1 (MQ=255) aTCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCtgg > 1:1834580/1‑99 (MQ=255) tCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCg < 1:1056561/90‑1 (MQ=255) tCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCg > 2:1056561/1‑90 (MQ=255) tCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATc > 1:2092335/1‑104 (MQ=255) tCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATc < 2:2092335/104‑1 (MQ=255) tCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCaa > 1:1346428/1‑150 (MQ=255) tGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCgtgt < 2:378979/150‑1 (MQ=255) tGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCgtgt < 2:621439/150‑1 (MQ=255) gCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGtt < 1:204015/150‑1 (MQ=255) gCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGtt < 1:1913028/150‑1 (MQ=255) cacatGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAAt < 2:16450/135‑1 (MQ=38) cacatGGCCTGGCGCGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAAt > 1:16450/5‑139 (MQ=38) ttGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTgg > 2:1585929/1‑150 (MQ=255) gCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGGGGCTGGGGGTTTGGGTGTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGt > 2:632383/1‑150 (MQ=255) cctggcgcGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGtt > 1:350701/5‑150 (MQ=255) ctggcgcGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTGTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGGACACCTACGGCGGCGCCCCGCCTCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGttc > 2:832540/4‑150 (MQ=255) cT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCt < 2:43034/76‑1 (MQ=255) cT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCt > 1:43034/1‑76 (MQ=255) gcgcGGGCTGAGCTCGCG‑CAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGttcttc < 2:2254037/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCCTGAACCCCTACGGCGGCTTCTCGCCGCGTTTGTCAATCGTGTTGCTGCTGGCGttcttc < 2:869163/150‑1 (MQ=255) cTCAGCCCGCGGCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTCCAACAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCa < 1:766719/150‑1 (MQ=255) cTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTCAGGCGTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCa < 1:625678/150‑1 (MQ=255) tCAGCCCGCGCCAGGCAATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCAc > 1:919430/1‑150 (MQ=255) aGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTg > 1:1394975/1‑150 (MQ=255) cccGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCgctgc < 1:1871445/110‑1 (MQ=255) | GTTGGATCACCCGCCCCGGCTGGCCCGGTAACCTGCTGGCCCTGGCGGCCGGTGCTTCCACCCTCCTGGCCCTGGCGCCGTTCGACATCTGGCCGTTGGCGGTGTTGTCCATCGCGGTGCTCTACCTTGGCCT‑GCGCGAGCTCAGCCCGCGCCAGGCCATGTGGCGTGGCTGGTGGTTTGGGTTTGGCCTGTATGGCGCCGGCACCTGGTGGATCTACGTCAGCATGAACACCTACGGCGGCGCCTCGCCGCTGCTGGCAATCGTGTTGCTGCTGGCGTTCTTCGCCGCACTGGCC > NC_002947/5451522‑5451817 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |