Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 492,234 | G→A | 5.1% | H64Y (CAC→TAC) | lptD ← | LPS‑assembly protein LptD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 492,234 | 0 | G | A | 5.1% | 288.1 / 2.3 | 96 | H64Y (CAC→TAC) | lptD | LPS‑assembly protein LptD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/54); new base A (3/2); total (40/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
ACGCGGCACCCAGTCCAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGACCGCCGGTTACCAG > NC_002947/492091‑492381 | aCGCGGCACCCAGTCCAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCgg > 2:590534/1‑150 (MQ=255) gcgGCACCCAGTCCAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGgc > 2:412849/1‑150 (MQ=255) gCACCCAGTCCAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGcgcg > 2:884763/1‑150 (MQ=255) aCCCAGTCCAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGt > 1:705595/1‑150 (MQ=255) cccAGTCCAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTg < 1:1526869/150‑1 (MQ=255) ccAGTCCAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTgg > 1:1448061/1‑150 (MQ=255) aGTNCAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCa > 2:1496755/1‑150 (MQ=255) gTCCCGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCaa < 1:1920802/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAgtt < 1:590534/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAgtt < 1:675469/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAgtt < 2:1820232/150‑1 (MQ=255) ggTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAgttgt > 2:1076314/1‑150 (MQ=255) ggTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAgttgt < 2:1397758/150‑1 (MQ=255) ggCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGa < 1:1193072/150‑1 (MQ=255) tGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGAGTGCCTCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTg > 1:1242835/1‑150 (MQ=255) tAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTggg < 2:933931/150‑1 (MQ=255) ttCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGtttt < 2:372733/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCTGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTgg < 2:575739/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTgg < 1:1687031/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCATGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTgg < 2:2291170/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACAGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTggg < 1:2092261/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGAAAGCTGGGGTCACAGTCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTggg > 1:1741952/1‑150 (MQ=255) gcgcGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCtt < 2:1680023/150‑1 (MQ=255) cgcgACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCtt < 1:991153/149‑1 (MQ=255) cgcgACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCtt > 2:991153/1‑149 (MQ=255) cgcgACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTg < 2:553125/150‑1 (MQ=255) cgcgACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTg > 2:1819479/1‑150 (MQ=255) aCTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGt < 1:1819479/150‑1 (MQ=255) aCTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGt < 1:1129042/150‑1 (MQ=255) ttCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTg < 1:1921250/101‑1 (MQ=255) ttCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTg > 2:1921250/1‑101 (MQ=255) ttCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGtt < 2:2449243/135‑1 (MQ=255) ttCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGtt > 1:2449243/1‑135 (MQ=255) ttCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTcc < 1:2190249/150‑1 (MQ=255) gtCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTcc > 1:2004217/2‑150 (MQ=255) cAGATCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGCAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCa < 2:1185860/150‑1 (MQ=255) aGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCaa > 2:1461387/1‑150 (MQ=255) aGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCaa > 2:2066958/1‑150 (MQ=255) aGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCaa > 1:697935/1‑150 (MQ=255) aGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCaa < 2:659610/150‑1 (MQ=255) gACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAac < 1:525925/150‑1 (MQ=255) aCGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAaccacc > 1:629911/1‑150 (MQ=255) cccTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACcggcg < 1:1100753/150‑1 (MQ=255) cTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACcggcggc > 1:250469/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACcggcggc < 1:1720360/150‑1 (MQ=255) cTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACcggcggc > 2:671389/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGGTTGGCCCGGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGa < 2:1900985/150‑1 (MQ=255) cTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGacac < 2:697935/150‑1 (MQ=255) cGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACtt < 2:115537/150‑1 (MQ=255) gTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTcc > 1:726221/1‑126 (MQ=255) gTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTcc < 2:726221/126‑1 (MQ=255) gTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACcggcggc > 2:630582/1‑140 (MQ=255) gTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACcggcggc < 1:630582/140‑1 (MQ=255) gTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTgg > 2:870521/1‑150 (MQ=255) gTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTgg < 1:1461387/150‑1 (MQ=255) 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cAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTc < 2:250469/150‑1 (MQ=255) cACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGaa < 1:1289312/150‑1 (MQ=255) aCGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTACACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAAc > 2:1744090/1‑150 (MQ=255) aCGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTACACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAAc > 2:1737913/1‑150 (MQ=255) tCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCt < 1:1425547/150‑1 (MQ=255) 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tCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCACCCCCCCGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGGCACTACGGATGAg < 2:929346/150‑1 (MQ=255) cccgccGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTg < 2:1448061/150‑1 (MQ=255) cccgccGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTg < 1:870521/150‑1 (MQ=255) ccgccgCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAaccac < 2:1755311/96‑1 (MQ=255) ccgccgCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAaccac > 1:1755311/1‑96 (MQ=255) gcTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCaga > 2:705039/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGtt < 1:2066958/150‑1 (MQ=255) cGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAggg > 2:163416/1‑150 (MQ=255) ggAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGc > 2:1856079/1‑150 (MQ=255) gAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCGACTACGTATGGTTTGGCCAGAGGTTGCAGGGcc > 2:2227698/1‑150 (MQ=255) gCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCcag < 2:2232215/150‑1 (MQ=255) tGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCcagca < 1:1496755/150‑1 (MQ=255) cGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGAc < 1:671389/150‑1 (MQ=255) gCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGTccgccg < 2:1740089/150‑1 (MQ=255) aCCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGACCGCCGGt > 2:1305939/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGACCGCCGGt > 2:1167683/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGACCGCCGGtt < 2:407899/150‑1 (MQ=255) cGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGACCGCCGGTTACCa < 1:261658/150‑1 (MQ=255) cGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGACCGCCGGTTACCa < 1:2227698/150‑1 (MQ=255) gTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGACCGCCGGTTACCAg > 1:1057392/1‑150 (MQ=255) | ACGCGGCACCCAGTCCAGGTGGCTGTAGTCTTCGCTGCGCGACTTCAGACCACGGCCCTTGGCCTCGGTAACCAGCACGGGCCGGTCCGCAGTTTCGGCTTCGCCCGCCGCTTCGGTGCCGGAGCTGACGGCTGCACCTTCGTGCACCGGGCGCGGTGGCAAGTTGTTGACTGGGGTTTTGGGCTTGCAGTCCCAACCACCGGCGGCGGACACTTGGCAGTCGAACTGTTCGGCTGCCACTACGTATGAGGTGGCCAGAGGTTGCAGGGCCAGCAGACCGCCGGTTACCAG > NC_002947/492091‑492381 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |