Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,734,098 | A→G | 9.4% | intergenic (‑68/+89) | proY ← / ← hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,734,098 | 0 | A | G | 9.4% | 253.7 / 13.4 | 96 | intergenic (‑68/+89) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/48); new base G (2/7); total (41/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.44e-01 |
GTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACA > NC_002947/5733951‑5734245 | gTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACG > 1:527695‑M1/1‑150 (MQ=255) tGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGC < 2:459710‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGAGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGC < 1:1131040‑M1/150‑1 (MQ=255) aTGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCT > 2:1169951‑M1/1‑150 (MQ=255) ggCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTTTGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaa < 1:259278‑M1/150‑4 (MQ=255) cGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaagg > 1:1057427‑M1/1‑145 (MQ=255) cGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaagg < 2:1057427‑M1/150‑6 (MQ=255) ggAGCCGAGGGCCATGAAACGGTTGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGTGCCCGCgaaggg < 2:1201677‑M1/150‑7 (MQ=255) ccGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTCGCACAAGCTAT‑TGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTCCTCCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAggg > 1:413657/1‑150 (MQ=255) ccATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGgtg < 2:476316/150‑1 (MQ=255) aTGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgca > 2:437704‑M1/1‑139 (MQ=255) aTGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGa > 1:1646659/1‑143 (MQ=255) aTGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGa < 2:1646659/143‑1 (MQ=255) tGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGttt < 1:2370872/150‑1 (MQ=255) gAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGtttt < 1:991314/150‑1 (MQ=255) gAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGtttt < 2:518540/150‑1 (MQ=255) gAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGtttt < 2:80748/150‑1 (MQ=255) aaaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTg < 1:162577/150‑1 (MQ=255) aaaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTg < 2:1058897/150‑1 (MQ=255) aCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCCTGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCa < 1:185563/150‑1 (MQ=255) ggATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGgagtaggtgcaaaacacc > 1:1769272‑M1/1‑132 (MQ=255) aTGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGgagtaggtgcaaaacaccat < 2:1769272‑M1/150‑21 (MQ=255) tgtgGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTAc > 1:927398/1‑150 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGGTGGTTGCATGTCACGTCATT‑GAATTGAATTGGGTGGAAAAATAGTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgt < 1:1862253/150‑1 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 2:150591/1‑124 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 1:150591/124‑1 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgt > 1:1480525‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGATCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtg > 1:2017062‑M2/1‑145 (MQ=255) gCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCTGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgg > 2:813420‑M2/1‑144 (MQ=255) gCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgg < 1:1087639‑M1/150‑30 (MQ=255) gCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgg > 2:1552751‑M2/1‑144 (MQ=255) aCTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAt < 1:1967527/124‑1 (MQ=255) aCTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAt > 2:1967527/1‑124 (MQ=255) aCTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtggga < 2:859528‑M2/150‑9 (MQ=255) ttggCCCGCGCTTGAGACCTGGGGCTTGTTGCATGTGACGTCCTT‑GAATTGTGTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCGGCGCAGCGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGc < 2:450238/147‑1 (MQ=255) ttAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagc < 2:747604‑M1/150‑34 (MQ=255) ttAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgggagc > 2:2005052‑M2/1‑140 (MQ=255) ttAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGAACCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgggagc < 1:623755‑M2/150‑11 (MQ=255) aGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagcgg < 2:1833260‑M1/150‑36 (MQ=255) aGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagcgg < 1:437704‑M1/150‑36 (MQ=255) aGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgggagcgg > 1:382489‑M2/1‑138 (MQ=255) cccGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagcgggc < 2:449850‑M1/150‑38 (MQ=255) cccGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgggcgcgggc > 2:1675353‑M2/1‑136 (MQ=255) ccGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtg > 1:263317‑M1/1‑112 (MQ=255) ccGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtg < 2:263317‑M1/140‑29 (MQ=255) cgcTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgggagcgggcgtgc > 1:376907‑M2/1‑132 (MQ=255) cTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGccc < 1:2432896/150‑1 (MQ=255) aggccTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGc < 2:2227796/115‑1 (MQ=255) agaCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGc > 1:2227796/1‑118 (MQ=255) gaCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaa < 2:1733784/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGCTTGTTGCCTGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGCGCTTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAgg < 2:1085382/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGCGGCTGCTGCGCCGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAgg < 2:2120526/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgg > 2:1957015‑M2/1‑122 (MQ=255) cTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgg < 1:1957015‑M2/128‑7 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCa < 2:1553670/114‑1 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCa > 1:1553670/1‑114 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgt < 2:1802927‑M2/125‑5 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgt > 1:1802927‑M2/1‑121 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGgc < 1:1845025/150‑1 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGgc > 1:1126802/1‑150 (MQ=255) cTTGTTGCATGTAACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGccc > 2:1797832/1‑150 (MQ=255) ttgCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggg > 1:2201992‑M1/1‑89 (MQ=255) ttgCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggg < 2:2201992‑M1/141‑53 (MQ=255) ttgCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGgc < 2:1522837/141‑1 (MQ=255) ttgCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGgc > 1:1522837/1‑141 (MQ=255) ttgCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCg > 1:2040215/1‑150 (MQ=255) gCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGc > 1:129825/1‑150 (MQ=255) cACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGTCCTAgg < 2:431623/150‑1 (MQ=255) cACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAgg < 1:409105/150‑1 (MQ=255) gTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGccc > 1:77504/1‑143 (MQ=255) gTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGccc < 2:77504/143‑1 (MQ=255) gTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGAGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGc > 2:173480/1‑150 (MQ=255) tt‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTa > 2:2142532/1‑150 (MQ=255) gAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgt > 2:151331‑M2/1‑95 (MQ=255) gAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgt < 1:151331‑M2/99‑5 (MQ=255) aaTTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAg < 1:1169951/150‑1 (MQ=255) tttGTTTTTGTGGGCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCGCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAgg < 2:413657/149‑1 (MQ=255) tGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCt < 1:859528/150‑1 (MQ=255) gTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCtt < 2:527695/150‑1 (MQ=255) tttttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGTGCCCGTGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACATGCTTg < 1:1357867/150‑1 (MQ=255) ttttGTGGTCGTGAGCTTCCGGGGGCTGCTGCGCAGCCGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTgg < 2:623755/150‑1 (MQ=255) tgtgGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAg < 2:2372882/150‑1 (MQ=255) tCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTacac > 2:2030830/1‑150 (MQ=255) gTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACAccc < 2:1126802/150‑1 (MQ=255) tGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAgg < 1:703292/104‑1 (MQ=255) tGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAgg > 2:703292/1‑104 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTGTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCgg > 2:2170734/1‑150 (MQ=255) gcAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGAc < 1:2030830/150‑1 (MQ=255) ccccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaaggacgtgacatgcaa > 1:2201992‑M2/1‑52 (MQ=255) ccccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaaggacgtgacatgcaa < 2:2201992‑M2/141‑90 (MQ=255) ccccTTCGCGGGCACGCCCACTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTAcc > 1:2244255/1‑150 (MQ=255) ccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGa < 1:2222414/143‑1 (MQ=255) ccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGa > 2:2222414/1‑143 (MQ=255) ggagcgGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTg < 2:1649104/147‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCGCCCACAGGGGATGGAGTTTTGCACCTGCTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGGAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTAGCAGTACACCCGCCGGCGGCAACCCGGTCAGACTACCCTTGGCCaa > 2:680404/1‑150 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaaggacgtgacatgcaacaagctcaaggtctcaagcg > 1:376907‑M1/1‑18 (MQ=255) | GTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTT‑GAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACA > NC_002947/5733951‑5734245 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |