Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,928,771 | G→A | 8.3% | R112C (CGC→TGC) | fbpA ← | iron ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,928,771 | 0 | G | A | 8.3% | 308.3 / 12.6 | 108 | R112C (CGC→TGC) | fbpA | iron ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/49); new base A (4/5); total (54/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCGGCCTTGATGCGCTGCAT > NC_002947/5928622‑5928918 | cttGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGcgcg > 2:835886/1‑150 (MQ=255) ttGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGAcgcggcgcgg > 2:887628/1‑150 (MQ=255) ccGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACt < 2:841565/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACGGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGGCCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTgc < 2:1163008/150‑1 (MQ=255) gcAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCg < 1:835886/150‑1 (MQ=255) cAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTACAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCgg < 2:1348714/150‑1 (MQ=255) aGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTc < 2:1922418/150‑1 (MQ=255) cTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGCGGCGGTACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCGGGTCGa > 1:625711/1‑150 (MQ=255) cTTCCCACTCTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGCCCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGa < 1:1075552/150‑1 (MQ=255) ttCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGAAGATGATGGTGAACGCGCGCAGGCTCAGGCCGCTACAGTCATGGGTCGAGGCGGGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGAt < 1:1994184/150‑1 (MQ=255) cACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACg > 2:721099/1‑150 (MQ=255) cTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTc < 2:2064385/150‑1 (MQ=255) cTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTc < 1:516325/150‑1 (MQ=255) tGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCg < 2:71842/150‑1 (MQ=255) gTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCgg < 2:1832207/150‑1 (MQ=255) tttGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAGCGCGTCGGTTTTGCCCCGCTCGGCGGAGTAGAGGACACGCCCGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGa < 1:644163/150‑1 (MQ=255) tttGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGa > 1:1791434/1‑150 (MQ=255) tCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTgg < 1:1050807/132‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTgg > 2:1050807/1‑132 (MQ=255) tCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTTGTCGATGACGTCGGACTCg > 2:2315711/1‑150 (MQ=255) aaccATGGCTTCGTAGGTGGTAAACTACTAGCGTTTGCAGCGCGCGGGGGATGATATGATAGTGCGTGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGAt < 2:625711/148‑1 (MQ=255) gCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATc > 2:1000567/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGt < 2:1097329/108‑1 (MQ=255) ccAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGt > 1:1097329/1‑108 (MQ=255) cAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCgg < 1:1411267/150‑1 (MQ=255) gggCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCt > 1:2282112/1‑150 (MQ=255) ggCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTg > 2:520302/1‑150 (MQ=255) cTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCa < 1:1826554/150‑1 (MQ=255) ttCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCa > 1:1931937/1‑149 (MQ=255) ttCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCa < 2:1931937/149‑1 (MQ=255) ttCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAg > 2:733150/1‑150 (MQ=255) gTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAAt < 1:1000567/150‑1 (MQ=255) aGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGc < 1:733150/150‑1 (MQ=255) aGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGc < 1:51958/150‑1 (MQ=255) cTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATc > 1:405603/1‑150 (MQ=255) cTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGGCCAGTCATGGGACGAGGAGAGGTACTGAGAAGGGATTAACATCACGATTGCTGCCGACCCGATCGGCGGCAGAATGCCCATc > 2:146297/1‑150 (MQ=255) tCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGAt < 1:1456495/130‑1 (MQ=255) tCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGAt > 2:1456495/1‑130 (MQ=255) tCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCt > 1:1677490/1‑150 (MQ=255) tCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCAGTAccgc > 2:480449/1‑92 (MQ=255) tCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCAGTACCgc < 1:480449/95‑1 (MQ=255) aaCTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGc > 2:1948913/1‑150 (MQ=255) aCTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCt > 1:1582789/1‑150 (MQ=255) ctcctcGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTc > 2:1616636/1‑150 (MQ=255) ctcGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGc < 2:1582789/150‑1 (MQ=255) tcGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGcc > 1:2109531/1‑150 (MQ=255) tcGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGcc > 2:921292/1‑150 (MQ=255) tcGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAAGCCGGTACAGACATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGGTGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATAGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGcc > 1:361595/1‑150 (MQ=255) gggTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCgg > 2:1504521/1‑90 (MQ=255) gggTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCgg < 1:1504521/90‑1 (MQ=255) gggTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTg > 2:2174694/1‑150 (MQ=255) gACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAg < 1:940926/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAgg > 2:2138209/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAgg > 2:2425884/1‑150 (MQ=255) cccGCTCGGCGGTGTAGATGATGGTGCGTGCGCGCATGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGCCGTCGGACTCGATGACGGGTAGAATGCCCGTCTGGTCGGGCTGCCACCGGt > 2:940272/1‑150 (MQ=255) ccGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGtt > 1:1162520/1‑150 (MQ=255) gCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGc < 2:1677490/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGc > 2:1926697/1‑150 (MQ=255) gTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCa > 2:617576/1‑150 (MQ=255) ggAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATc < 2:1791434/150‑1 (MQ=255) gTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGAc > 1:455518/1‑150 (MQ=255) gTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGAc > 1:2320734/1‑150 (MQ=255) gTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGAc < 1:764514/150‑1 (MQ=255) gTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGCGACTGGGCTCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGAc < 1:146297/150‑1 (MQ=255) gatgatGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGTTTGCCTGCATCTACGGt < 2:2332714/150‑1 (MQ=255) gatgatGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCAt > 2:1298817/1‑143 (MQ=255) gatgatGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCAt < 1:1298817/143‑1 (MQ=255) atgatgGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAAt < 2:1151423/107‑1 (MQ=255) atgatgGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAAt > 1:1151423/1‑107 (MQ=255) gatgGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTcag > 1:820601/1‑150 (MQ=255) gatgGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTcag > 2:2232592/1‑150 (MQ=255) atgGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGcc < 1:1911467/120‑1 (MQ=255) atgGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGcc > 2:1911467/1‑120 (MQ=255) tGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTc < 1:1228294/112‑1 (MQ=255) tGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTcagcagca < 1:1059699/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTAGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTc > 2:1228294/1‑112 (MQ=255) gggCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGt < 2:405603/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTcag < 2:121508/138‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGc > 1:832703/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACAGTcag > 1:121508/1‑138 (MQ=255) cAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCt > 1:650998/1‑121 (MQ=255) cAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCt < 2:650998/121‑1 (MQ=255) gCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTc < 2:1573787/72‑1 (MQ=255) gCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTc > 1:1573787/1‑72 (MQ=255) tCAGGCCGGTGCAGTCATGGGGGGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGt < 2:1863761/150‑1 (MQ=255) aGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTa < 2:2282112/150‑1 (MQ=255) gCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTcagc < 2:208274/127‑1 (MQ=255) gCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTcagc > 1:208274/1‑127 (MQ=255) cGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCCGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGc > 2:1374690/1‑150 (MQ=255) aGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCgg > 2:2291788/1‑150 (MQ=255) aTGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCGGCCtt > 1:868354/1‑150 (MQ=255) tGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGc < 1:205217/130‑1 (MQ=255) aCGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTc > 2:403318/1‑139 (MQ=255) aCGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTc < 1:403318/139‑1 (MQ=255) gAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCGGCCTTGATgcgc < 1:2425884/150‑1 (MQ=255) ccggCGCAGTACCGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCGGCCTTGa > 2:555714/3‑145 (MQ=255) ccggCGCAGTACCGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCGGCCTTGa < 1:555714/143‑1 (MQ=255) ccggCGCAGTACCGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCGGCCTTGATgcgc > 2:1664162/3‑150 (MQ=255) ggCGCAGTACCGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCGGCCTTGATGCGCtc < 1:1664162/150‑2 (MQ=255) gcgGTACTGCTCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCGGCCTTGCTGCGCTGCAt > 2:243765/1‑150 (MQ=255) | CTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGCGCAGGCTCAGGCCGGTCCAGTCATGGGACGAGGCGCGGTACTGCGCCGGGATGTTCTGGTCGATGACGTCGGACTCGATCGGCTGCAGAATGCCCATCTGCTCGGCCTGCCACAGGTTGCCTGCATCGACGGTCAGCAGCAGGTCGGCCACGCCGTTATCGCCCTCGGCCTTGATGCGCTGCAT > NC_002947/5928622‑5928918 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |