| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 514,015 | A→C | 7.9% | intergenic (+46/+31) | yhfA → / ← PP_0426 | hypothetical protein/membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 514,015 | 0 | A | C | 7.9% | 207.4 / 9.1 | 77 | intergenic (+46/+31) | yhfA/PP_0426 | hypothetical protein/membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/34); new base C (3/3); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
GCGGTGGAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAACCCCCAGCC > NC_002947/513868‑514164 | gcggTGGAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAAc < 2:1831638/150‑1 (MQ=255) gggAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGc < 2:187659/149‑1 (MQ=255) ggAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCt < 2:2387349/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGGAGCGGGTTCACCCGCTTCCa < 1:479422/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCa > 2:885990/1‑150 (MQ=255) ggAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGc > 1:1934546/1‑150 (MQ=255) ggAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGc > 2:797746/1‑150 (MQ=255) gAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGATCGCGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGTGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGcc > 2:374584/1‑150 (MQ=255) aaaGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCAc > 1:566394/1‑140 (MQ=255) aaaGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCAc < 2:566394/140‑1 (MQ=255) aaGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCgg < 2:407140/150‑1 (MQ=255) gTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGc < 2:1283001/150‑1 (MQ=255) aTTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGa < 1:885990/150‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACACGCGGCCCGGGCGAg > 1:668599/1‑150 (MQ=255) cTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGttt > 2:2031583/1‑150 (MQ=255) cTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGAGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCGCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGttt > 2:1210939/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCAAAGGGTATAAAGTAAAAGCTTTGGATAAAAGCGGAAAGGTTGGGGTGGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTc > 1:2123155/2‑150 (MQ=255) cTTCGACCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGtt < 1:116491/150‑1 (MQ=255) 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cGTGCCGGGGTTGAGACTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAggg < 1:1633726/150‑1 (MQ=255) cGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGt > 2:745759/1‑121 (MQ=255) cGGGGTTGAGATTACCCATGGCTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGt < 1:745759/121‑1 (MQ=255) gTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCa > 2:991649/1‑150 (MQ=255) gTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCa > 1:637284/1‑150 (MQ=255) ttGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCaa > 1:1027583/1‑150 (MQ=255) ttACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAAc > 1:1746250/1‑83 (MQ=255) ttACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAAc < 2:1746250/83‑1 (MQ=255) tACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGc < 2:1934546/150‑1 (MQ=255) ccATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGa > 1:401106/1‑150 (MQ=255) ccATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGa > 2:1334258/1‑150 (MQ=255) aTGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAAcc < 1:1382646/140‑1 (MQ=255) aTGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAAcc > 2:1382646/1‑140 (MQ=255) tGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAgg > 2:291507/1‑149 (MQ=255) gTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACgg < 1:803084/150‑1 (MQ=255) aaTCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGG‑AGCGGGTTCACCCGCTTCCAcaa > 1:1824716/1‑76 (MQ=25) aaTCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGG‑AGCGGGTTCACCCGCTTCCAcaa < 2:1824716/78‑3 (MQ=25) aTCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTa > 1:381162/1‑150 (MQ=255) tAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAgcgc > 1:764663/1‑150 (MQ=255) gagCTGCGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCt < 1:991649/150‑1 (MQ=255) gCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCGGGGCGAGTTTCAGTGGCTCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTgg < 1:291507/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGc > 1:1425794/1‑150 (MQ=255) gTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCaa < 1:1466044/150‑1 (MQ=255) ttAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAAc < 1:554365/150‑1 (MQ=255) aaGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCg < 2:637284/150‑1 (MQ=255) gCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAATTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTc > 2:873163/1‑150 (MQ=255) gCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGAGAGGTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTc > 2:697742/1‑150 (MQ=255) tGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTccc > 2:1447265/1‑150 (MQ=255) cGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCttt < 1:869724/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTg < 1:2031583/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTg < 1:544910/150‑1 (MQ=255) ccGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAANCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGa < 1:597087/79‑1 (MQ=255) ccGCTGTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGa > 2:597087/1‑79 (MQ=255) cGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTaa < 2:2373747/150‑1 (MQ=255) cTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTgg > 2:339364/1‑121 (MQ=255) cTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTgg < 1:339364/121‑1 (MQ=255) cTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAAc > 1:1686441/1‑150 (MQ=255) tttGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTg < 1:1049327/143‑1 (MQ=255) tttGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTg > 2:1049327/1‑143 (MQ=255) ttGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTTTACTCGCTTCCACCCGCGGCCGGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTTAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAACCCa < 2:416798/150‑1 (MQ=255) gCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAgg < 2:83427/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGc > 1:1284215/1‑150 (MQ=255) ttGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAgg < 1:904128/143‑1 (MQ=255) ttGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAgg > 2:904128/1‑143 (MQ=255) ttGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGcc < 2:2123155/150‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGGTTCACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGa > 2:236090/1‑150 (MQ=255) ggaGCGGGTTCACCCGCTTCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGctt > 2:122063/3‑93 (MQ=255) ggaGCGGGTTCACCCGCTTCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGctt < 1:122063/91‑1 (MQ=255) gAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATa > 1:1726352/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATa > 2:426938/1‑150 (MQ=255) aaGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTACACCAACCCGAGCCAGATaa > 2:2274798/1‑150 (MQ=255) gCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCGGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCCACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAAcc > 2:122633/1‑150 (MQ=255) gCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAAcc < 2:1686441/150‑1 (MQ=255) cGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAAccc < 2:1027583/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAACCCCCAGcc < 1:2290390/150‑1 (MQ=255) | GCGGTGGAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAACCCCCAGCC > NC_002947/513868‑514164 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |