Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,112,033 | T→A | 7.1% | H118Q (CAT→CAA) | PP_5362 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,112,033 | 0 | T | A | 7.1% | 257.8 / 8.3 | 85 | H118Q (CAT→CAA) | PP_5362 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/42); new base A (3/3); total (40/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.65e-01 |
GGCACAAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAAC > NC_002947/6111886‑6112180 | ggCACAAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTg < 2:2116678/150‑1 (MQ=255) ggCACAAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTg < 2:26131/150‑1 (MQ=255) gCACAAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGc > 1:316174/1‑150 (MQ=255) gCACAAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGc < 2:312688/150‑1 (MQ=255) cacaAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCa < 2:1446881/150‑1 (MQ=255) cacaAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCa < 2:2001887/150‑1 (MQ=255) cacaAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCa < 1:196608/150‑1 (MQ=255) acaAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAg > 2:2151843/1‑150 (MQ=255) caAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGc < 1:889647/150‑1 (MQ=255) aaCCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCAATGCAGCtt < 2:2256864/150‑1 (MQ=255) aaCAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCAATGCAGCTTGaag < 1:1848402/150‑3 (MQ=255) ccGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAggg < 2:1413479/150‑1 (MQ=255) ccGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAggg < 2:1414117/150‑1 (MQ=255) ccGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATCATAGCTTGATCGAggg < 1:1901468/150‑1 (MQ=255) gCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCATCTTGAACAGCGTATCCAGTTTCAGCGGGGCGCGCTTCAAGCTGCATTGCCGCTTGATCGCGGGGTGCCGtt < 2:1331014/150‑1 (MQ=255) gCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGAGTATCCAGTTCCAGCGGTGTGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGtt > 1:512151/1‑150 (MQ=255) caTTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGGCCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGAc < 2:2209458/150‑1 (MQ=255) aCTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGcctc < 1:244896/150‑1 (MQ=255) cTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGcctcc > 1:1456468/1‑150 (MQ=255) tttttttACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGa > 2:1004983/1‑142 (MQ=255) tttttttACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGa < 1:1004983/142‑1 (MQ=255) tttttttACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGcctcct > 1:1560669/1‑150 (MQ=255) ttAACGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCAt < 2:1459584/150‑1 (MQ=255) tACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCAtt < 1:236398/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCAtttt < 2:1560669/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCttt > 1:915091/1‑141 (MQ=255) gCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCttt < 2:915091/141‑1 (MQ=255) gCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGaa > 2:1360606/1‑150 (MQ=255) cTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGTTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACg > 2:1038894/1‑150 (MQ=255) cTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAg > 2:1258202/1‑117 (MQ=255) cTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAg < 1:1258202/117‑1 (MQ=255) cAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGttttt > 1:2325910/1‑150 (MQ=255) gAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCtgctgc < 1:1360606/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGGGTGGGCTACAACCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAGTCGTCTTTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGcc > 2:191269/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCa < 1:2391888/88‑1 (MQ=255) gCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCa > 2:2391888/1‑88 (MQ=255) gCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGTCGTTGACGCCTCCATTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTa > 2:1621983/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTtctc > 1:39381/1‑141 (MQ=255) gCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTtctc < 2:39381/141‑1 (MQ=255) gCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCATCATTTCATTTTGAACGTTGTTACGCTgccgccca > 2:1719006/1‑148 (MQ=255) cTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTAtt > 2:1175780/1‑150 (MQ=255) gggtgggCTACAACCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGAATGTTCTCTGCTGCCTAtttt < 1:191269/150‑1 (MQ=255) tgggCTCCAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTGCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTa > 2:1910182/1‑150 (MQ=255) tgggCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTa > 2:159629/1‑150 (MQ=255) gggCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTCTGTTGTaa < 2:224110/150‑1 (MQ=255) aGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCTGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGGCTCCTTTCATCTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGTCTTTTTTGTAAGTCAGCt > 1:2058780/1‑150 (MQ=255) gccgcGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGTCGTTGACGCCTCCATTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGa < 1:1621983/150‑1 (MQ=255) gccgcGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGa < 1:1851331/150‑1 (MQ=255) gcgTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCa < 2:1815498/150‑1 (MQ=255) gACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTACGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGaaa > 2:415477/1‑150 (MQ=255) gACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTGAGCTTCGAGCACGCGCTGaaa > 1:1025758/1‑150 (MQ=255) accaccTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGAAGCCTCCTTTCATTTTGAATCTCCATGCTCTTCGACCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGaaaa < 1:415477/150‑1 (MQ=255) accacaCTGACCCACGTATCCAGTTCCAGCGGAGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCGCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCGCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGaaaa < 2:512151/150‑1 (MQ=255) cTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGAc > 2:2430765/1‑74 (MQ=255) cTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGAc < 1:2430765/74‑1 (MQ=255) aCCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCtt > 1:1378051/1‑150 (MQ=255) 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cGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGAc < 1:662543/150‑1 (MQ=255) ggAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGa > 1:725645/1‑150 (MQ=255) ggAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGa > 1:1303520/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGaa > 1:2027757/1‑145 (MQ=255) cTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGaa < 2:2027757/145‑1 (MQ=255) cTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCt > 1:1274764/1‑150 (MQ=255) atCAAGCTGCAATGAAACGTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTa > 1:1901585/2‑150 (MQ=255) tCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTAt < 1:2165406/150‑1 (MQ=255) tCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTAt < 1:879514/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATg < 2:1378051/150‑1 (MQ=255) aGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGcc > 1:968422/1‑150 (MQ=255) gCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTAGTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGTCCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCg > 1:969546/1‑150 (MQ=255) tGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCAc > 1:316405/1‑94 (MQ=255) tGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCAc < 2:316405/94‑1 (MQ=255) tGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTa > 1:2372220/1‑150 (MQ=255) gCAATGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTaa > 2:1989380/1‑150 (MQ=255) cATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAAc > 2:1562343/1‑150 (MQ=255) | GGCACAAACCAACAGCCGCTATGGCACATTGACTTTTTTTACCGGCCTGGCCAGCGATGGTGAGGCCTGGGTGGGCTACAGCCGCCGCGTAGGCTGGACCACCTTGAACCGCGTATCCAGTTCCAGCGGGGAGCGCTTCAAGCTGCATTGCAGCTTGATCGAGGGGTGCCGTTGACGCCTCCTTTCATTTTGAACGTTTTTTCTCTGCTGCCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAAC > NC_002947/6111886‑6112180 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |