| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,131,512 | A→T | 8.4% | A22A (GCT→GCA) | copB‑II ← | copper resistance protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,131,512 | 0 | A | T | 8.4% | 323.8 / 15.7 | 106 | A22A (GCT→GCA) | copB‑II | copper resistance protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/52); new base T (3/6); total (48/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATAC > NC_002947/6131367‑6131661 | cgGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCAc > 2:1646888/1‑150 (MQ=255) gTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCa > 1:582485/1‑150 (MQ=255) ttcttcTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGTGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGc < 1:643012/150‑1 (MQ=255) ttcttcTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGc < 1:936225/150‑1 (MQ=255) ttctGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATg > 1:2052374/1‑150 (MQ=255) tctGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGc < 2:225318/150‑1 (MQ=255) ctgctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGATCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaa > 2:122218/1‑150 (MQ=255) tgctTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaat < 2:2105912/150‑1 (MQ=255) tACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGaaa < 1:246862/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGGTGAATGAAACgg > 1:662421/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACgg > 2:186811/1‑150 (MQ=255) cgcgCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGt < 2:441507/150‑1 (MQ=255) gcgcCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTc < 2:549088/150‑1 (MQ=255) ccATCTGAGCGTGGTCGATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATg < 2:890615/150‑1 (MQ=255) ccATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCgcagcagca > 1:1687851/1‑122 (MQ=255) ccATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCgcagcagca < 2:1687851/122‑1 (MQ=255) ccATCTGAGCGTGGTCAATGCCTGGCATATGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATg > 1:482080/1‑150 (MQ=255) aTCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGcc > 2:1848907/1‑150 (MQ=255) tGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCcagc > 1:2026656/1‑150 (MQ=255) aGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaa < 2:2347350/129‑1 (MQ=255) aGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaa > 1:2347350/1‑129 (MQ=255) ggTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATg > 1:1804623/1‑150 (MQ=255) ggTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATg > 2:2136499/1‑150 (MQ=255) ccATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTc > 1:1164455/1‑150 (MQ=255) cATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaa > 1:2073568/1‑120 (MQ=255) cATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCtgaa < 2:2073568/120‑1 (MQ=255) catggcagcgataaagctaaggcagggaaagatgaccaatagcctggcacgaccatcgctgctggcattgaccgtttcattcagcatGCTGGGCGCAGCAGCACCCa > 1:2044529‑M1/88‑107 (MQ=255) catggcagcgataaagctaaggcagggaaagatgaccaatagcctggcacgaccatcgctgctggcattgaccgtttcattcagcatGCTGGGCGCAGCAGCACCCa < 2:2044529‑M1/20‑1 (MQ=255) tGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAg > 2:900350/1‑150 (MQ=255) tGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAg > 2:2043900/1‑150 (MQ=255) tGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCACATTGCCGAATGGTCCATCTACTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAg > 2:2100834/1‑150 (MQ=255) ggCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAgg < 1:900350/150‑1 (MQ=255) ggCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAgg > 2:2201844/1‑150 (MQ=255) tGGTCTGCCGACTGATTGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTg < 2:662421/150‑1 (MQ=255) ggTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTgg < 2:482080/150‑1 (MQ=255) ggTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTgg < 2:2052374/150‑1 (MQ=255) tGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCAt > 2:2057914/1‑150 (MQ=255) gCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGct < 1:607284/94‑2 (MQ=255) gCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGct > 2:607284/1‑93 (MQ=255) cGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCtt > 1:1732734/1‑150 (MQ=255) gAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATTCTATCATCTATGGTTGTGCCTGGCTATTGGTCGTATTTACCt > 2:1592968/1‑150 (MQ=255) aaTCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTa < 2:851028/150‑1 (MQ=255) aaTCCATTTCCAGGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAAGGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTa < 2:83750/150‑1 (MQ=255) aTCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAg < 2:1804623/150‑1 (MQ=255) tCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAg > 1:1382301/1‑122 (MQ=255) tCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAg < 2:1382301/122‑1 (MQ=255) tCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGc > 2:970585/1‑150 (MQ=255) atatCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGAAGAGAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCttt > 1:1880032/4‑150 (MQ=255) aTTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTAtt > 1:779855/1‑125 (MQ=255) aTTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTAtt < 2:779855/125‑1 (MQ=255) aTTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCttt > 1:2073295/1‑150 (MQ=255) tttCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATgg < 1:2196972/109‑1 (MQ=255) tttCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATgg > 2:2196972/1‑109 (MQ=255) ttCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTAt < 2:582485/150‑1 (MQ=255) cATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATATCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGc > 1:2409482/1‑150 (MQ=255) ggCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGc < 2:2073295/150‑1 (MQ=255) tGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGa < 1:1855548/150‑1 (MQ=255) cccATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTACTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTc < 2:236582/150‑1 (MQ=255) atcgctgctggcattgaccgtttcattcagcaaaGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACgg < 1:962660‑M1/38‑1 (MQ=255) atcgctgctggcattgaccgtttcattcagcaaaGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACgg > 2:962660‑M1/35‑72 (MQ=255) cATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATACTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCca < 1:1998857/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATg > 2:816730/1‑141 (MQ=255) aTTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATg < 1:816730/141‑1 (MQ=255) ttGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCcatc < 1:2136499/150‑1 (MQ=255) tGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCcatca < 2:1732734/150‑1 (MQ=255) tGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCcatca < 1:186811/150‑1 (MQ=255) ccGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATg > 2:1952537/1‑84 (MQ=255) ccGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATg < 1:1952537/84‑1 (MQ=255) ccGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTcc < 1:120993/112‑1 (MQ=255) ccGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTcc > 2:120993/1‑112 (MQ=255) ccGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCcatc > 2:558900/1‑147 (MQ=255) ccGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCcatc < 1:558900/147‑1 (MQ=255) aaTGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTg < 2:2182605/150‑1 (MQ=255) tGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCt > 1:1801267/1‑150 (MQ=255) tGGTCCAGCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGGCCATGCTGCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCt < 2:190720/150‑1 (MQ=255) ggTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCtg < 1:1646888/150‑1 (MQ=255) tCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCtgtg < 2:1801267/150‑1 (MQ=255) ccATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGc > 1:2296371/1‑145 (MQ=255) ccATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGc < 2:2296371/145‑1 (MQ=255) tctcCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATcc < 2:2026656/150‑1 (MQ=255) cctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTc < 1:1725907/89‑1 (MQ=255) ctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATAc < 2:2375717/150‑1 (MQ=255) ctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATAc < 1:2100834/150‑1 (MQ=255) ctcAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATAc < 1:2043900/150‑1 (MQ=255) ttcagcatGCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTcc < 2:979432‑M1/84‑1 (MQ=255) ttcagcatGCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTcc > 1:979432‑M1/9‑92 (MQ=255) ttcagcatGCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGc > 2:353858‑M1/9‑113 (MQ=255) ttcagcatGCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGc < 1:353858‑M1/105‑1 (MQ=255) agcaAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGAtt < 2:1253970/120‑1 (MQ=255) agcaAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGAtt > 1:1253970/1‑120 (MQ=255) gcaAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCAt > 2:198858/1‑150 (MQ=255) caAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATc > 2:1606600/1‑150 (MQ=255) aaGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGCCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGa < 1:895574/150‑1 (MQ=255) GCTGGGTGCTGCTGCGCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGc < 1:632590‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGt < 2:612058‑M1/60‑1 (MQ=255) CTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGt > 1:612058‑M1/1‑60 (MQ=255) GCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATgg < 1:779089‑M1/150‑1 (MQ=255) cagcaCCCAGCATGCTGAATGAATCGGTCAATGCCAGCAGCGGTGGTCGTGCCGGGCTATTGGTCATCTTCCCCTGCCTTACCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATa < 2:145621/150‑1 (MQ=255) cagcaCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATa > 2:1857971/1‑150 (MQ=255) agcaCCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATAc < 1:970585/150‑1 (MQ=255) | CGGGTTTCTTCTGCTGCTTACTCGCGCCCATCTGAGCGTGGTCCATGCCTGGCATCTGGTCTGCCGACGGAGCGGAATCCATTTCCATGGCTCCGTGCCCCATTGCCGAATGGTCCATCTCCTCAGCAGCAAAGCTGGGCGCAGCAGCACCCAGCATGCTGAATGAAACGGTCAATGCCAGCAGCGATGGTCGTGCCAGGCTATTGGTCATCTTTCCCTGCCTTAGCTTTATCGCTGCCATGCGATTCCATCATTTTGCTGTGATCCATACCTTCCATCGAGCCATGGTCCATAC > NC_002947/6131367‑6131661 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |