| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 614,609 | A→T | 6.2% | I214N (ATT→AAT) | ispA ← | farnesyl diphosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 614,609 | 0 | A | T | 6.2% | 398.2 / 13.4 | 129 | I214N (ATT→AAT) | ispA | farnesyl diphosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (56/65); new base T (5/3); total (61/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCTTCTGGCC > NC_002947/614461‑614757 | gATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTTTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAAt < 2:585165/150‑1 (MQ=255)gATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAAt < 2:84/150‑1 (MQ=255) tGCATAGGCTCAGGTGACTACCAAGTACAGCAGGGCCGTGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGc < 2:2358060/150‑1 (MQ=255) cATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCt > 1:2409386/1‑150 (MQ=255) cATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCt < 1:795709/150‑1 (MQ=255) aTAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtg < 2:2417457/150‑1 (MQ=255) tAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCAGCTCGATGCCCGGTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtgt < 1:1741973/150‑1 (MQ=255) ggCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCCTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCATTGGCCtggca < 1:2330676/150‑4 (MQ=255) ttGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATaa < 2:2323721/150‑1 (MQ=255) gcggcTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGtt < 2:1598212/150‑1 (MQ=255) gcTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGc > 1:2138707/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa < 2:1625929/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa < 1:246596/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa < 1:2266141/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa < 1:939062/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa < 1:215239/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAg > 1:318858/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTATTTGGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAg > 1:2017687/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAgg < 2:465228/150‑1 (MQ=255) ccggCCCTGCTGGGCCTGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtgtg > 2:810185/3‑134 (MQ=255) ccggCCCTGCTGGGCCTGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtgtg < 1:810185/132‑1 (MQ=255) cAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtgt > 2:2162537/1‑133 (MQ=255) cAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtgt < 1:2162537/133‑1 (MQ=255) aGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGTCCTGTGCATAAGTTTGCAGAGCa < 2:90548/150‑1 (MQ=255) aGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCa > 2:808369/1‑150 (MQ=255) ggCCCTGCTGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa > 2:1294228/1‑144 (MQ=255) ggCCCTGCTGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa < 1:1294228/144‑1 (MQ=255) ccAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCa > 2:741721/1‑150 (MQ=255) cagcagGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCAACCGCGCCGACATGCCAAGGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAg > 1:1739885/1‑150 (MQ=255) cagGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTg < 2:2117207/150‑1 (MQ=255) ccGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCtgtg > 2:92835/1‑120 (MQ=255) gTAGGTGGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGT‑GCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCTCACCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCg < 1:1637296/150‑1 (MQ=255) gTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGTAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGtta < 1:2302701/150‑2 (MQ=255) aGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGTGCTTTCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGGACCGGTTCgg < 2:2017687/150‑1 (MQ=255) gTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCa > 1:702971/1‑150 (MQ=255) tCGGTTTCTCACCAGCTATATCTGCACAATGCCGTGTGCCCAAGGTAGCACTTTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAGTGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCAc > 2:26099/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACgg < 1:1273352/150‑1 (MQ=255) tGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCAc < 1:2399723/150‑1 (MQ=255) tCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGTATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACtt < 1:1185340/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGc > 2:148666/1‑150 (MQ=255) gcgcTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCa > 1:1530364/1‑150 (MQ=255) cTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCCAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAggg < 1:2342037/150‑1 (MQ=255) tATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGgc < 1:673606/150‑1 (MQ=255) aTGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGgcg > 2:2298282/1‑150 (MQ=255) tCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCg > 1:1041149/1‑150 (MQ=255) tGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAg < 2:2049102/150‑1 (MQ=255) tGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGAACCTGGAATGCCAGGACAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCATTGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAg > 2:268748/1‑150 (MQ=255) cggttGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTg > 2:1810319/4‑150 (MQ=255) cGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTg < 1:1580088/150‑1 (MQ=255) gCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGAATAAGTTTCAAAAGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGTGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTc > 1:1750295/1‑150 (MQ=255) cccAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAg < 2:697568/86‑1 (MQ=255) cAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGc > 1:614711/1‑120 (MQ=255) cAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGc < 2:614711/120‑1 (MQ=255) cAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGAt > 2:2395518/1‑150 (MQ=255) aaGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTg < 1:890054/118‑1 (MQ=255) 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tCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGc < 1:1389954/150‑1 (MQ=255) gAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCAt < 2:1160596/150‑1 (MQ=255) gAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCAt < 1:618061/150‑1 (MQ=255) gATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGaa > 2:1058175/1‑150 (MQ=255) gATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGaa > 2:1245544/1‑150 (MQ=255) gtcgtcCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTc > 2:1673349/1‑150 (MQ=255) tcCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAgc > 1:945554/1‑150 (MQ=255) cTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCTGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAgcgc < 2:2311612/150‑1 (MQ=255) cTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCctgctg < 1:1673349/150‑1 (MQ=255) ggAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGTGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATAAACTCCAGCGCCTGCTGGt < 2:1750295/150‑1 (MQ=255) tgccatgccaATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAg > 2:434753/1‑150 (MQ=255) gcacAGGCCATTGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAg > 1:1345082/4‑150 (MQ=255) cacAGGCCATTGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGt < 1:955583/119‑1 (MQ=255) ccAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCgg < 2:592675/108‑1 (MQ=255) ccAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCgg > 1:592675/1‑108 (MQ=255) ccAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCt > 2:2085131/1‑150 (MQ=255) aGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCTTc < 2:702971/150‑1 (MQ=255) aGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCTTc > 1:1277537/1‑150 (MQ=255) gCCATTGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCa > 1:1688376/1‑95 (MQ=255) ccAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCTTCTgg > 1:1467716/1‑150 (MQ=255) ccAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCTTCTgg < 1:2298282/150‑1 (MQ=255) cAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCTTCTGGc > 1:2043827/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCtt > 2:2029644/1‑105 (MQ=255) aaTGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCtt < 1:2029644/105‑1 (MQ=255) aaTGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAGCTCCAGCGCCTGCTGGTGCCCCTTCTGGcc > 1:702183/1‑150 (MQ=255) | GATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCCAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCTTCTGGCC > NC_002947/614461‑614757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |