| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 815,449 | G→A | 5.5% | A312T (GCC→ACC) | fsr‑I → | fosmidomycin efflux system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 815,449 | 0 | G | A | 5.5% | 321.2 / 6.0 | 109 | A312T (GCC→ACC) | fsr‑I | fosmidomycin efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/51); new base A (3/3); total (55/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CAGCTCGCAGCTGCACCTGTTCCTGTTCCTCGGCGCGGTGGCGGCGGGCACCTTCTTTGGCGGGCCGATCGGTGACCGTATCGGGCGCAAGGCTGTGATCTGGTTTTCGATACTGGGTGTGGCGCCGTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGATCTTCTTTGGCCTGATGTTCGGTTT > NC_002947/815301‑815597 | cAGCTCGCAGCTGCACCTGTTCCTGTTCCTCGGCGCGGTGGCGGCGGGCACCTTCTTTGGCGGGCCGATCGGTGACCGTATCGGGCGCAAGGCTGTGATCTGGTTTTCGATACTGGGTGTGGCGCCGTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGc > 2:2393847/1‑150 (MQ=255)cAGCTCGCAGCTGCACCTGTTCCTGTTCCTCGGCGCGGTGGCGGCGGGCACCTTCTTTGGCGGGCCGATCGGTGACCGTATCGGGCGCAAGGCTGTGATCTGGTTTTCGATACTGGGTGTGGCGCCGTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGc > 1:2272230/1‑150 (MQ=255)cAGCTCGCAGCTGCACCTGTTCCTGTTCCTCGGCGCGGTGGCGGCGGGCACCTTCTTTGGCGGGCCGATCGGTGACCGTATCGGGCGCAAGGCTGTGATCTGGTTTTCGATACTGGGTGTGGCGCCGTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGc > 1:1682911/1‑150 (MQ=255) 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ggCGCCGTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTAGCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCgg < 2:723365/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCggg > 1:2324659/1‑150 (MQ=255) gcgcCGTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCggg > 1:1119012/1‑150 (MQ=255) cGTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGAtct > 2:1834339/1‑150 (MQ=255) gTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGGtctt > 1:926103/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGCGCTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGATCTTCttt > 2:534327/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGATCTTCTTTGGCCt < 2:1888258/150‑1 (MQ=255) gcTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGATCTTCTTTGGCCTGAt < 1:1267097/150‑1 (MQ=255) ccGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGATCTTCTTTGGCCTGATGTTc > 1:1734438/1‑150 (MQ=255) ccGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGGGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGATCTTCTTTGGCCTGATGTTc > 1:1772945/1‑150 (MQ=255) cGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGATCTTCTTTGGCCTGATGTTCg < 2:884027/150‑1 (MQ=255) tGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGATCTTCTTTGGCCTGATGTTCGGttt > 2:1985757/1‑150 (MQ=255) | CAGCTCGCAGCTGCACCTGTTCCTGTTCCTCGGCGCGGTGGCGGCGGGCACCTTCTTTGGCGGGCCGATCGGTGACCGTATCGGGCGCAAGGCTGTGATCTGGTTTTCGATACTGGGTGTGGCGCCGTTCACGCTGGCGCTGCCGTATGCCGACTTGTTCTGGACCACGGTGCTGAGCGTGGTGATCGGCTTTATCCTGGCTTCGGCGTTTTCCGCGATCGTGGTGTATGCGCAGGAGCTGGTGCCGGGCAGCGTGGGCATGATTGCCGGGATCTTCTTTGGCCTGATGTTCGGTTT > NC_002947/815301‑815597 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |