Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 868,518 | 0 | T | C | 5.9% | 406.6 / 9.0 | 135 | K358R (AAG→AGG) | mqo‑I | malate:quinone oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/65); new base C (3/5); total (65/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.20e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CGCCGCCTTTTTTCGGGTCTTTCTTGATGATCTGCACGCGCTGACCCGCCACTTCCAGGCGCCAGTCCTCGGCCTTGGCCTGCGGATAGAAACGACGCAGGGCTTCCAGACGCTGCTCCATCGACTGCATCACTTCGCTGACCAGGTACTTGGTCAGGTCCATGTTGTCGCGGGCCACGGCCAGCATCGGGCCGATGTTGCCCATGCGCACCGACAGCGGCAGGTCCATCAGCGAGCCGTGCTTGAGGAACTTGGTAGTGAAACCGGCATACGGACCGAACAGCAGCGAAGTCTTGCCG > NC_002947/868369‑868667 | cgccgcCTTTTTTCGGGTCTTTCTTGATGATCTGCACGCGCTGACCCGCCACTTCCAGGCGCCAGTCCTCGGCCTTGGCCTGCGGATAGAAACGACGCAGGGCTTCCAGACGCTGCTCCATCGACTGCATCACTTCGCTGACCAGGTACt < 2:1391255/150‑1 (MQ=255) gccgccTTTTTTCGGGTCTTTCTTGATGATCTGCACGCGCTGACCCGCCACTTCCAGGCGCCAGTCCTCGGCCTTGGCCTGCGGATAGAAACGACGCAGGGCTTCCAGACGCTGCTCCATCGACTGCATCACTTCTCTGACCAGGTACtt > 2:575112/1‑150 (MQ=255) gccgccTTTTTTCGGGTCTTTCTTGATGATCTGCACGCGCTGACCCGCCACTTCCAGGCGCCAGTCCTCGGCCTTGGCCTGCGGATAGAAACGACGCAGGGCTTCCAGACGCTGCTCCATCGACTGCATCACTTCGCTGACCAGGTACtt > 1:369459/1‑150 (MQ=255) 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CGCCGCCTTTTTTCGGGTCTTTCTTGATGATCTGCACGCGCTGACCCGCCACTTCCAGGCGCCAGTCCTCGGCCTTGGCCTGCGGATAGAAACGACGCAGGGCTTCCAGACGCTGCTCCATCGACTGCATCACTTCGCTGACCAGGTACTTGGTCAGGTCCATGTTGTCGCGGGCCACGGCCAGCATCGGGCCGATGTTGCCCATGCGCACCGACAGCGGCAGGTCCATCAGCGAGCCGTGCTTGAGGAACTTGGTAGTGAAACCGGCATACGGACCGAACAGCAGCGAAGTCTTGCCG > NC_002947/868369‑868667 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |