| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 906,835 | A→T | 7.2% | K92* (AAG→TAG) ‡ | PP_0790 → | inner membrane protein AmpE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 906,835 | 0 | A | T | 7.2% | 418.7 / 16.3 | 138 | K92* (AAG→TAG) ‡ | PP_0790 | inner membrane protein AmpE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (71/56); new base T (6/4); total (78/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
ACCCATGGTGGACGTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAGGTTTAC > NC_002947/906686‑906984 | aCCCATGGTGGACGTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCa > 2:643794/1‑150 (MQ=255) cccATGGTGGACGTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCCTGTGTTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCaa < 2:1002024/150‑1 (MQ=255) gtggACGTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATc > 2:331988/1‑150 (MQ=255) ggACGTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGc > 1:183168/1‑150 (MQ=255) cGTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCTTGGCATCGccgc < 2:2045583/150‑4 (MQ=255) cGTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGATGATCCACAGTCTAGCCCGCGGCGAGGCCTAGGCATCGCTTg > 2:856981/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTgg < 1:2310494/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTgg > 2:1811481/1‑150 (MQ=255) ttGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGTTTggg < 1:1015207/150‑1 (MQ=255) ttGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCGGCTGGCGTTAGCGCTTCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTggg < 2:918922/150‑1 (MQ=255) ttGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCCGCCACATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTggg > 1:552575/1‑150 (MQ=255) gtTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGc > 2:1833761/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGTAGCGCAGCTGGTGTTACTGCTGCAGGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGCTGCCtca > 2:1181357/1‑148 (MQ=255) ccGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTggcgg > 1:962260/1‑150 (MQ=255) aGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCgggg < 1:1041086/150‑1 (MQ=255) ctgGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGAt > 1:108219/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGATCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCa > 1:1030005/1‑150 (MQ=255) gtgtTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGGTCACCTGCTGGTGCGGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGTGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAg > 1:45854/1‑150 (MQ=255) tgtTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAgg > 1:809860/1‑150 (MQ=255) gtTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAggc < 2:2132575/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGGTGTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAggcg > 1:541287/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAggcg > 2:1056813/1‑150 (MQ=255) tgctgcATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGgcgc > 1:2441171/1‑150 (MQ=255) tgctgcATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGgcgc > 2:642856/1‑150 (MQ=255) ctgcATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGCCGATCAGGCGGCGCTg > 2:568172/1‑150 (MQ=255) tgcATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGc > 1:894823/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCAcgc > 2:2327790/1‑150 (MQ=255) tgCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCgg < 1:1737984/150‑1 (MQ=255) cTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGcc > 2:1393347/1‑150 (MQ=255) cTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTCTCGTGGTGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGcc > 1:856033/1‑150 (MQ=255) tGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCg > 1:2290044/1‑150 (MQ=255) ggAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGa > 2:69786/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAgc > 2:2176210/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAgc < 2:2441171/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCggg < 2:192383/112‑1 (MQ=255) gTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCggg > 1:192383/1‑112 (MQ=255) cTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCgggg > 2:74799/1‑108 (MQ=255) cTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGACGGCGCTACCAGCGCCCgacctggacctgtg > 2:1719775/1‑148 (MQ=255) gTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCTATACTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCtgg < 1:643794/150‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCtgg > 2:741295/1‑150 (MQ=255) tattgGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGAGGATCGGGGGGGGTTGCACGCGGCCGATGGCGCCCTGGGCGtggggg > 1:1542487/4‑150 (MQ=255) ctgGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGcc < 1:2176210/150‑1 (MQ=255) tgGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGTACTCCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCg < 1:1181357/150‑1 (MQ=255) tgGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCg > 2:2095620/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGTGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGCCCTGGGCCTGGTGGCCGa < 2:1271676/150‑1 (MQ=255) gCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGTCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTgg < 1:1613107/136‑1 (MQ=255) gCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTgg > 2:1613107/1‑136 (MQ=255) gTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAg < 1:754046/55‑1 (MQ=255) gTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATg < 1:166171/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATg > 2:166171/1‑149 (MQ=255) cGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGc > 1:930800/1‑150 (MQ=255) ggTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGca < 1:1994547/150‑1 (MQ=255) ggTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGACCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGca > 1:901954/1‑150 (MQ=255) gTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGAc < 1:857537/90‑1 (MQ=255) gTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGcac > 2:463288/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGaa > 1:285415/1‑138 (MQ=255) ctgctgGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGaa < 2:285415/138‑1 (MQ=255) ctgctgGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTg < 1:331988/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTg < 1:1811481/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTg > 2:427255/1‑150 (MQ=255) ctgGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTg < 1:2095620/150‑1 (MQ=255) ctgGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTg > 2:2238127/1‑150 (MQ=255) ctgGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTg < 1:741295/150‑1 (MQ=255) tgGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCCGATATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTgg > 1:1244786/1‑150 (MQ=255) tGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAAc < 2:953815/132‑1 (MQ=255) tGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGc > 2:243769/1‑150 (MQ=255) tGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGc < 2:2290044/150‑1 (MQ=255) cTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCgg < 1:1409178/150‑1 (MQ=255) tGATCTACAGCCTGGGCCTGGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCggg > 1:1774976/1‑150 (MQ=255) tGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCATGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCggg > 2:1047008/1‑150 (MQ=255) gATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTg < 2:1341821/145‑1 (MQ=255) gATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTg > 1:1341821/1‑145 (MQ=255) tACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCgg < 2:944665/144‑1 (MQ=255) tACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCgg > 1:944665/1‑144 (MQ=255) tACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAg < 1:2238127/150‑1 (MQ=255) aCAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAgg < 1:1393347/150‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGNCGTTTCGTGNTGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCCggg > 1:597368/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGGGGCCGATGAACCGCGCAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAgtg > 2:141893/1‑148 (MQ=255) ggCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGCGCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTg < 2:809860/150‑1 (MQ=255) ggCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGGGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTg > 2:2180590/1‑150 (MQ=255) cccaagcgATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCt > 1:1138731/6‑150 (MQ=255) ccGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAg < 1:931162/64‑1 (MQ=255) cgcgGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCtg < 1:2421890/150‑1 (MQ=255) ccaagcgATGCCTTGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCtg > 2:1471862/5‑150 (MQ=255) gcggcgATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGTCTATGTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCtgt > 1:378801/1‑150 (MQ=255) aagcgATGCCTTGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAggcg > 1:2349967/3‑64 (MQ=38) aagcgATGCCTTGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAggcg < 2:2349967/62‑1 (MQ=38) gcgATGCCTTGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGc > 1:865625/1‑150 (MQ=255) gATGCCTTGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAg < 2:865625/150‑1 (MQ=255) gATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGGCCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAg < 2:841788/150‑1 (MQ=255) gATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGt > 2:1429753/1‑135 (MQ=255) gATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGt < 1:1429753/135‑1 (MQ=255) aTGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAgg < 1:2117590/150‑1 (MQ=255) tGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAGGt < 2:1138731/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAGGttt > 2:2102863/1‑150 (MQ=255) cAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCgg > 1:2313156/1‑121 (MQ=255) cAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAGGttt < 1:1798941/149‑1 (MQ=255) cAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAGGttt > 2:1798941/1‑149 (MQ=255) cAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAGGTTTa > 1:1371344/1‑150 (MQ=255) aaGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAGGTTTAc < 1:2096177/150‑1 (MQ=255) | ACCCATGGTGGACGTTGGCCATCCTGGTGTTGGCGCCGGTAGCGCTGCTGGTGTTGCTGCTGCATGTGCTGGAGCCGGTGGCCTATGGTCTGCTGGCGTTGCCGGTGCACCTGCTGGTGCTGATCTACAGCCTGGGCCGCGGCGATGCCAAGGCATCGCTTGGGGCGTTTCGTGATGCCTGGCGGCGGGGGGACGATCAGGCGGCGCTGCACGCGGCCGAGCGCGACCTGGGCCTGGTGGCCGATGAACCGCACAGCTTGCTGGTGCGGGTGCAGGGTAACTTGCTGTGGCAGGTTTAC > NC_002947/906686‑906984 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |