| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,041,942 | A→C | 9.3% | E141A (GAG→GCG) | colR → | two‑component system response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,041,942 | 0 | A | C | 9.3% | 260.4 / 18.2 | 104 | E141A (GAG→GCG) | colR | two‑component system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (50/44); new base C (5/5); total (55/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CTTCCGCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACAGCC > NC_002947/1041793‑1042088 | cTTCCGCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGa > 1:203583/1‑150 (MQ=255) ttCCGCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCCTCGGGCCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAg < 1:1333893/150‑1 (MQ=255) ttCCGCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAg < 2:1694856/150‑1 (MQ=255) ttCCGCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAg > 2:1118419/1‑150 (MQ=255) gCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTa > 1:2049271/1‑150 (MQ=255) gCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTa < 2:2179645/150‑1 (MQ=255) gCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTACTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTa > 1:1465408/1‑150 (MQ=255) tCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTAcc > 1:2014996/1‑150 (MQ=255) tCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTAcc > 2:340010/1‑150 (MQ=255) ggCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCa < 2:2080520/150‑1 (MQ=255) gCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAg < 2:471185/150‑1 (MQ=255) gCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAg < 2:1907613/150‑1 (MQ=255) cTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGCGGGTAACCTCCAgg < 1:601189/150‑1 (MQ=255) tggcgacTACCTGCGCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTACGCCGTGCCCAGGGCGGTGTGCGGCGCACGCAGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAggg > 2:605348/4‑150 (MQ=255) tGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGa > 2:86204/1‑135 (MQ=255) tGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAggg > 1:1680095/1‑150 (MQ=255) tGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAggg > 1:2346316/1‑150 (MQ=255) gacgacTACCTGCTCAAGCCATTTGCCATGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGt < 2:1270693/150‑1 (MQ=255) gacTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGTCTTACATGAGCTACTACGTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGgcgc > 2:2410610/1‑150 (MQ=255) tACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGCGGGTAACCTCCAGGGtatcga > 1:1447868/1‑144 (MQ=255) aCCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTACTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGTCGGTTACCCGCCAGTGGCGccggg > 1:499974/1‑147 (MQ=255) cctcctCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGtt < 1:231533/150‑1 (MQ=255) cTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGcc < 2:461361/145‑1 (MQ=255) cTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGcc > 1:461361/1‑145 (MQ=255) cTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGt < 2:1399196/148‑1 (MQ=255) cTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGt > 1:1399196/1‑148 (MQ=255) gCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGGGCGACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGaa < 1:1023719/150‑1 (MQ=255) tCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTg < 1:1373407/143‑1 (MQ=255) tCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGt > 1:1197292/1‑144 (MQ=255) tCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGt < 2:1197292/144‑1 (MQ=255) tCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTAGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTg > 2:1373407/1‑143 (MQ=255) aaGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGCGGGTAACCTCCAGGGtatcgagg > 2:1805507/1‑135 (MQ=255) aaGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGCGGGTAACCTCCAGGGtatcgagg < 1:1805507/142‑8 (MQ=255) aaGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTc > 2:1751985/1‑150 (MQ=255) aaGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTc > 2:451625/1‑150 (MQ=255) gCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATCCCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCaa < 2:1552117/150‑1 (MQ=255) gCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCaa < 2:203583/150‑1 (MQ=255) gCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTc < 1:1118419/150‑1 (MQ=255) gCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTAGCCTGTTGAAGCTCAACCCgggg > 2:2396999/1‑148 (MQ=255) cTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGc > 1:489820/1‑150 (MQ=255) tGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAg < 2:1397104/107‑1 (MQ=255) tGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAg > 1:1397104/1‑107 (MQ=255) ggAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCaa > 2:2005536/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAgctgc < 1:2383420/150‑1 (MQ=255) 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tCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGa > 1:2062900/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATg > 2:2418361/1‑150 (MQ=255) aaGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGCGGGTAACCTCCAggg < 1:2420811/97‑1 (MQ=255) aaGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGCGGGTAACCTCCAggg > 2:2420811/1‑97 (MQ=255) aGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCa < 1:758709/150‑1 (MQ=255) ctgcGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGtt < 1:2210645/98‑1 (MQ=255) ctgcGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGtt > 2:2210645/1‑98 (MQ=255) ctgcGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGc < 2:2049271/150‑1 (MQ=255) tgcGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGc < 1:1039958/92‑1 (MQ=255) tgcGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGc > 2:1039958/1‑92 (MQ=255) gcgcCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTc > 2:2014452/1‑112 (MQ=255) gcgcCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTc < 1:2014452/112‑1 (MQ=255) cAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCGCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTg < 1:2396999/150‑1 (MQ=255) 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cTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGcgac > 2:1364256/1‑150 (MQ=255) cTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCATTGTGGGGCGACGACTg > 1:1606042/1‑150 (MQ=255) aCGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGAGGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGcc < 2:459040/150‑1 (MQ=255) cGACCTCGGTACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGccc > 1:1888188/1‑150 (MQ=255) cGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAAcc > 2:1484719/1‑53 (MQ=255) cGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAAcc < 1:1484719/53‑1 (MQ=255) gACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCt > 1:2042258/1‑150 (MQ=255) gACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCt < 2:286835/150‑1 (MQ=255) cTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGAt > 2:231968/1‑150 (MQ=255) cTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGAt > 2:231998/1‑150 (MQ=255) tCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATa < 1:1364256/150‑1 (MQ=255) tCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATa > 2:1534880/1‑150 (MQ=255) gcgaCCCTGGCGGGTAACCTCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGc > 1:2068693/4‑150 (MQ=255) gATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGc > 2:2278715/1‑150 (MQ=255) gATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGc < 2:2062900/150‑1 (MQ=255) gATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCACGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGc > 2:1831099/1‑150 (MQ=255) cccTGGCGGGTAACCTCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACa < 2:2068693/150‑1 (MQ=255) cccTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGACGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACa < 2:1772665/150‑1 (MQ=255) cccTGGAGGTTACCCGACAGGGTAGCCTGTTGAAGATCATCTAGGTCGAACCCTAGCGGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACa < 2:1104834/150‑1 (MQ=255) cTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACAGc > 2:1257800/1‑150 (MQ=255) cTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACAGc > 1:872302/1‑150 (MQ=255) tGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACAGcc > 1:885033/1‑150 (MQ=255) | CTTCCGCTCGGGGGCTGACGACTACCTGCTCAAGCCATTTGCCCTGTCGGAGCTGGCGGCGCGCATCGAAGCGGTGCTGCGCCGTGCCCAGGGCGGTGGGCGGCGCACCCTGCAGGTGGCTGACCTGAGCTACGACCTCGATACCCTGGAGGTTACCCGCCAGGGTCGCCTGTTGAAGCTCAACCCGGTCGGCCTCAAGCTGCTGGCGGTACTGATGCAGAAAAGCCCGCACGTACTGCGCCGCGAGGTGCTGGAAGAAGCCTTGTGGGGCGACGACTGCCCTGATAGCGACAGCC > NC_002947/1041793‑1042088 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |