Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,075,803 | T→G | 5.7% | A172A (GCT→GCG) | mreB → | cell wall structural actin‑like protein MreB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,075,803 | 0 | T | G | 5.7% | 230.2 / 4.0 | 86 | A172A (GCT→GCG) | mreB | cell wall structural actin‑like protein MreB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/39); new base G (2/4); total (43/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
TTCACGAGAACAGCTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCCGCGTTGGCGGTGACCGCTTCGACGAA > NC_002947/1075655‑1075950 | ttCACGAGAACAGCTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTg > 1:2350083/1‑150 (MQ=255) ttCACGAGAACAGCTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTg < 1:1592287/150‑1 (MQ=255) aCGAGAACAGCTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCGGCCa > 2:326911/1‑150 (MQ=255) gagaACAGCTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCACCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATc > 1:1559095/1‑150 (MQ=255) gagaACAGCTTCCTGCAGACGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCAGCGGCCATc < 1:1059586/150‑1 (MQ=255) gaACAGCTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCAGCGGCCATCgg < 1:1942320/150‑1 (MQ=255) aGCTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGcc > 2:2334453/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCgg > 2:802111/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCgg > 1:2399611/1‑150 (MQ=255) cTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTg > 2:1019446/1‑150 (MQ=255) tGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGc > 1:344982/1‑150 (MQ=255) tGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGc > 1:1392268/1‑150 (MQ=255) aGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCg > 2:692000/1‑149 (MQ=255) aGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCg < 1:692000/149‑1 (MQ=255) gCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGt > 1:1726139/1‑150 (MQ=255) ccGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGtt < 2:961102/150‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGa > 2:2165817/1‑150 (MQ=255) cgCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCCACAGAACCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGaa < 1:146091/149‑1 (MQ=255) cccGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAaga < 2:344982/150‑1 (MQ=255) ccGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAagag < 2:159602/150‑1 (MQ=255) gcgcgTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGaa < 2:743923/145‑1 (MQ=255) gcgcgTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGaa > 1:743923/1‑145 (MQ=255) aTCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCg > 1:2083163/1‑150 (MQ=255) tCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGa < 1:2334453/150‑1 (MQ=255) tGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGGGCCGAGGGCCGCTGCCATCGTTGCCGGCATGGCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGAtt > 1:1084676/1‑149 (MQ=255) tGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATg < 2:1111348/150‑1 (MQ=255) gccgtgcAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGgtcgt < 2:1874050/150‑1 (MQ=255) ccgtgcAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGgtcgtc < 1:1939219/150‑1 (MQ=255) gcAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTAGTCGata < 2:1934949/150‑1 (MQ=255) aGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCg < 2:1376203/150‑1 (MQ=255) aGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCg < 1:628917/150‑1 (MQ=255) gTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCCTCCGGCAGTTGTCCCACGTCTCGGGTTCCGGTGCGGTGTTCCTGATGGATATCGGTGAAGG‑TGGTTCTGGTGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCCAGGATTGTCTGTATCgg > 1:544478/1‑150 (MQ=255) gTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCgg > 2:2001071/1‑150 (MQ=255) gTCGACCAAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCgg > 2:393460/1‑150 (MQ=255) tCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCa > 1:2134347/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGTCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTg > 2:799876/1‑139 (MQ=255) gAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGTCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTg < 1:799876/139‑1 (MQ=255) gAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACt < 2:1392268/150‑1 (MQ=255) gccATCGGCGAGTCGGCCCTCGGCGAGGGTGCCCGTGAAGGGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGCGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGcc < 2:555195/150‑1 (MQ=255) gccATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGcc < 2:2083163/150‑1 (MQ=255) gccATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGcc < 2:2219919/150‑1 (MQ=255) ccATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGccc > 2:310656/1‑150 (MQ=255) cATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCt < 1:1019446/150‑1 (MQ=255) gcgAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGAtct > 1:855346/1‑150 (MQ=255) gcgAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGAtct > 2:148699/1‑150 (MQ=255) cgAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGAtctc < 2:1559095/150‑1 (MQ=255) ggCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCg > 2:673146/1‑62 (MQ=255) ggCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCg < 1:673146/62‑1 (MQ=255) cccTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACg > 1:1886817/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACgg > 1:963884/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGACCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACgg > 2:1892489/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGCGGCTGCCCGTGAAGCGTCCCTGGTCGA‑AGAGCTGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGGGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGc < 1:1192458/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTg < 2:2134347/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTg > 2:2161480/1‑150 (MQ=255) cgcgGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGGGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGt < 1:1952097/150‑1 (MQ=255) gggTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTa > 1:1287506/1‑150 (MQ=255) gggTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTGCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTa > 1:1333720/1‑150 (MQ=255) gTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCAc < 2:1353309/112‑1 (MQ=255) gTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCAc > 1:1353309/1‑112 (MQ=255) tGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCATGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGc < 2:1818662/150‑1 (MQ=255) 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tGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCt < 2:4090/51‑1 (MQ=255) aGTGTTCCTCGTCGA‑AGAGTCGATGGCCGCGGCCATCGGTGCCGGGCGGCCGGTTGAAGAGGCCCGTGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAgtccgt < 2:947340/150‑1 (MQ=255) ttCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCcgc > 1:1404077/1‑150 (MQ=255) ttCCTGAGCGA‑AGGGCCGATGGCCGCTGCCATGGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTTGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCcgc < 1:348322/150‑1 (MQ=255) tGATCGA‑CGAGCCGATGGCCGCTCCCCCCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGCCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCCGCGTTg < 2:1084676/150‑1 (MQ=255) aTCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCCGCGTTGGc < 1:1538376/150‑1 (MQ=255) 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ccGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTATCACTGAAATc < 2:566129/90‑1 (MQ=255) ccGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTATCACTGAAATc > 1:566129/1‑90 (MQ=255) ggtGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCCGCGTTGGCGGTGACCGCtt > 1:1132746/3‑150 (MQ=255) aTGGCCGCTGCCATCGGTGCGGGCCGGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCCGCGTTGGCGGTGACCGCTTc < 2:1132746/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCCGCGTTGGCGGTGACCGCTTcg > 1:1517091/1‑150 (MQ=255) cGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCCGCGTTGGCGGTGACCGCTTcgacga > 1:2196414/1‑150 (MQ=255) gCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGATGCCGTCCGCGTTGGCGGTGCTCGCTTCGACGaa > 1:489301/1‑150 (MQ=255) gCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCCGCGTTGGCGGTGACCGCTTCGACGaa < 2:1437408/150‑1 (MQ=255) | TTCACGAGAACAGCTTCCTGCAGCCGAGCCCGCGCGTGCTGATCTGCGTGCCGTGCAAGTCGACCCAGGTCGAGCGCCGCGCCATCCGCGAGTCGGCCCTCGGCGCGGGTGCCCGTGAAGTGTTCCTGATCGA‑AGAGCCGATGGCCGCTGCCATCGGTGCCGGCCTGCCGGTTGAAGAGGCCCGCGGTTCGATGGTCGTCGATATCGGTGGCGGTACCACTGAAATCGCCCTGATCTCGCTGAACGGCGTGGTCTATGCCGAGTCCGTCCGCGTTGGCGGTGACCGCTTCGACGAA > NC_002947/1075655‑1075950 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |