| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,165,334 | A→G | 11.8% | I26T (ATC→ACC) | hexR ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,165,334 | 0 | A | G | 11.8% | 191.7 / 14.8 | 76 | I26T (ATC→ACC) | hexR | DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/36); new base G (2/7); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.81e-01 | |||||||||||
CCAGGCTCTGCGCCAGTTGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGT > NC_002947/1165185‑1165482 | ccAGGCTCTGCGCCAGTTGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGa > 1:1336166/1‑150 (MQ=255) cAGGCTCTGCGCCAGTTGCAGCGTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGAt > 2:1919537/1‑150 (MQ=255) tctGCGCCAGTTGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACtt > 2:363939/1‑150 (MQ=255) ctGCGCCAGTTGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGGTGACTTc < 1:2060292/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGTTGCAGCCTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCgg < 2:1067403/150‑1 (MQ=255) cctccATTTGCAGCTTGAGTTAGGGGTAGAGGGTGGCTCCGCACGCACGGCAGAGGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCgg < 2:23565/147‑1 (MQ=255) cAGTTGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGAc > 1:1334740/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACttt > 2:904657/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACttt < 1:619778/150‑1 (MQ=255) gCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGc > 1:1500767/1‑150 (MQ=255) ttGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGGTGACTTCGGCGACTTTGCGTTCg < 1:2026591/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCg < 2:2386819/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCg < 2:1221126/150‑1 (MQ=255) gAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGc > 1:709138/1‑150 (MQ=255) aGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGGTGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGcc < 2:2050124/150‑1 (MQ=255) gTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGGTGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCt > 1:186032/1‑150 (MQ=255) ttCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCtt > 2:382505/1‑150 (MQ=255) ggggTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGtt < 1:113793/150‑1 (MQ=255) gTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGc < 2:2020652/141‑1 (MQ=255) gTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGc > 1:2020652/1‑141 (MQ=255) tAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGc < 1:2441309/150‑1 (MQ=255) ccGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGGTGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCtcg < 2:186032/150‑1 (MQ=255) tGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑Ga > 1:2033152/1‑150 (MQ=255) aCGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAgg < 1:382505/150‑1 (MQ=255) gCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAggcg > 2:1669779/1‑150 (MQ=255) gAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGtt < 1:2150798/122‑1 (MQ=255) gAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGtt > 2:2150798/1‑122 (MQ=255) aGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGGTGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGa < 1:540145/150‑1 (MQ=255) gCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGAt < 1:843593/150‑1 (MQ=255) cGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATc > 2:6537/1‑150 (MQ=255) aaGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGt < 1:1914326/149‑1 (MQ=255) gAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTc < 1:904657/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCag > 2:646384/1‑150 (MQ=255) ggTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGGTGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCagga < 2:860052/150‑1 (MQ=255) ggTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCngga < 2:1500767/150‑1 (MQ=255) ggTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCagga > 2:1029625/1‑150 (MQ=255) ggTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCagga < 2:1334740/150‑1 (MQ=255) gTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCaggag < 1:1919537/150‑1 (MQ=255) ttGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCaggagg > 2:2401412/1‑150 (MQ=255) ttGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCag < 1:2065461/146‑1 (MQ=255) ttGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCag > 2:2065461/1‑146 (MQ=255) cggtTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGACAGCTGCGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCAc < 1:664532/150‑1 (MQ=255) gtTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCAcgc < 1:1073648/150‑1 (MQ=255) gtTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCAcgc < 2:1222150/150‑1 (MQ=255) gACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCAt > 2:1446550/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGGTGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATggg > 2:1057584/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTGCGGCCTTGTGCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGAGCTGTTCGAGGAGGTGTCGCACGCGGTCCATggg > 2:2344006/1‑150 (MQ=255) ttGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGgt < 1:363939/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTATCAGTTCGGCCTGGGTCTACAGGTCTGACTC‑CCCCTTGTTCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGgtgt < 1:646384/150‑1 (MQ=255) cgccTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGc > 2:1522914/1‑74 (MQ=255) cgccTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGc < 1:1522914/74‑1 (MQ=255) tGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTg < 2:709138/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTgg < 2:2033152/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTc > 2:2388841/1‑150 (MQ=255) gcgcagcgATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTgg > 1:434628/1‑144 (MQ=255) gcgcagcgATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTgg < 2:434628/144‑1 (MQ=255) gcgcagcgATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCggg < 2:1336166/150‑1 (MQ=255) gcagcgATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGaa < 2:2338865/150‑1 (MQ=255) agcgATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCAcgcg > 1:2429346/1‑120 (MQ=255) agcgATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCAcgcg < 2:2429346/120‑1 (MQ=255) cTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCgg > 1:377498/1‑150 (MQ=255) tGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGa > 2:1412087/1‑142 (MQ=255) tGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGa < 1:1412087/142‑1 (MQ=255) gAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCt > 2:2128303/1‑150 (MQ=255) aaaCGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATgg > 2:389412/1‑118 (MQ=255) aaaCGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATgg < 1:389412/118‑1 (MQ=255) aCGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGGTGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCtgtg < 1:1057584/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGAGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCtgtg < 1:1729871/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCtgtgt < 1:6537/150‑1 (MQ=255) ttgttgCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAgcagca > 1:2264429/1‑150 (MQ=255) ggTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCttttt < 1:2344006/150‑1 (MQ=255) cAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGgt > 1:2151197/1‑150 (MQ=255) aGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGgtc > 1:632049/1‑150 (MQ=255) aGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGgtc < 1:200214/150‑1 (MQ=255) gATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCTGTCCATGGgt > 1:2010085/1‑91 (MQ=255) gATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCTGTCCATGGgt < 2:2010085/91‑1 (MQ=255) gATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGgtcgt > 2:1443671/1‑150 (MQ=255) | CCAGGCTCTGCGCCAGTTGCAGCTTGAGTTCGGGGTAGCCGCTGACGCCGAACGAGCGGCAGAAGCGGTTGACGGTCGGTTCGCTGACCTTGGCCGCCTGGGCCAGCGCAGCGATGCTGAAACGGGTGGCTTGTTGCGGGTTGAGCAGGATGACTTCGGCGACTTTGCGTTCGGCCTTGTTCAGCTCGTC‑GAGGCGGCCCTGGATCTGTTCCAGGAGGTTTCGCACGCGGTCCATGGGTGTGTCCTTGGGTCGGGAAGACAGCCGGCTGTGTGAGCAGCAGGCTTTTTGCACGGTCGT > NC_002947/1165185‑1165482 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |