| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,267,254 | G→C | 6.7% | A247G (GCC→GGC) | quiP ← | acyl‑homoserine lactone acylase QuiP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,267,254 | 0 | G | C | 6.7% | 277.5 / 10.1 | 90 | A247G (GCC→GGC) | quiP | acyl‑homoserine lactone acylase QuiP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/36); new base C (3/3); total (50/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
GTATTGATTTGTACCGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAGGGTCAGG > NC_002947/1267107‑1267403 | gTATTGATTTGTACCGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGGGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGACACGTGCCAGCTTCTGGCTGGCa > 1:1304846/1‑150 (MQ=255)gTATTGATTTGTACCGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCa > 2:90659/1‑150 (MQ=255) aTTGATTTGTACCGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAgc > 2:934755/1‑150 (MQ=255) aTTGATTTGTACCGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAgc > 2:114592/1‑150 (MQ=255) ttGATTTGTACCGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAgcc > 1:568880/1‑150 (MQ=255) aTTTGTACCGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAgccgcc > 2:1470598/1‑150 (MQ=255) ttGTACCGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAg > 1:1744981/1‑150 (MQ=255) cGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCGGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTgg > 2:1327931/1‑150 (MQ=255) cGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTgg < 2:1863526/150‑1 (MQ=255) gggCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGc < 2:2155634/150‑1 (MQ=255) tCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGGCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCGCGGGCTCCCGAGCAGGTCGAGGTGAGCCAGCTACTGGGTGGCAGCCGCCAGGGCTGGcggtc > 1:501028/1‑146 (MQ=255) aGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCGGGGCTGCCAGccctg < 1:2189707/150‑3 (MQ=255) ccAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCCGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCaa > 2:271136/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCCGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCaa > 2:1028558/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGCGCGGCTGTCGCGGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCaa < 2:1022204/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAAc > 1:1269338/1‑150 (MQ=255) gcggcgcggcTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAActgg > 1:1266859/1‑150 (MQ=255) gcggcgcggcTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAActgg < 2:2021952/150‑1 (MQ=255) ggcgcggcTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCCGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAActggct > 1:716909/1‑150 (MQ=255) gcggcTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACtggctggc > 2:2249014/1‑150 (MQ=255) cTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGCCAGCCGCCa < 2:2204728/118‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGCCAGCCGCCa < 2:2204899/118‑1 (MQ=255) cTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGCCAGCCGCCa > 1:2204899/1‑118 (MQ=255) cTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGCCAGCCGCCa > 1:2204728/1‑118 (MQ=255) cTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGCCAGCCGCCa > 1:2202947/1‑118 (MQ=255) cTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGCCAGCCGCCa < 2:2202947/118‑1 (MQ=255) tGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGt < 1:1327931/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGc < 1:472947/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCAGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGc > 2:1952567/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGTGGGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCt > 1:1946642/1‑150 (MQ=255) gcagGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGa < 1:1470598/150‑1 (MQ=255) cagGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAg > 2:1570470/1‑150 (MQ=255) cagGCTCTTGCCGCCGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAg < 2:716909/150‑1 (MQ=255) ctctTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGAAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTg > 1:509514/1‑150 (MQ=255) tctTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTctggctgg > 1:1868440/1‑90 (MQ=255) tctTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTctggctgg < 2:1868440/90‑1 (MQ=255) tcgtGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCTAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGt < 2:518287/147‑1 (MQ=255) ctTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTc < 2:568880/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGTGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACtt < 1:2386223/150‑1 (MQ=255) ctgcggctgcgCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTcc < 1:94150/150‑1 (MQ=255) tgcggctgcgCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCGGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCa < 1:853402/150‑1 (MQ=255) ctgcgctgcgGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCg < 1:119557/150‑1 (MQ=255) tgcgctgcgGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCgg > 1:1809609/1‑150 (MQ=255) gcgctgcgGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGc < 1:90659/150‑1 (MQ=255) tgcgGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGTCACTCGTCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAAc < 1:1000905/150‑1 (MQ=255) tgcgGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAAc > 2:1953699/1‑150 (MQ=255) tgcgGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAAc > 1:1757175/1‑150 (MQ=255) gACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCt < 2:1744981/150‑1 (MQ=255) aCCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTc < 1:519244/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGt > 1:2401154/1‑150 (MQ=255) aGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGGGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCGGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTcc > 1:2133853/1‑150 (MQ=255) aGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTcc < 1:282819/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAActggct > 2:2027493/1‑93 (MQ=255) ggCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAActggct < 1:2027493/93‑1 (MQ=255) gTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGcccc > 2:1324676/1‑150 (MQ=255) tttgCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCaa < 1:280657/77‑1 (MQ=255) ttGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCaa > 2:280657/1‑80 (MQ=255) ccGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGgca < 1:819223/150‑1 (MQ=255) 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cccGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAAc > 1:161451/1‑150 (MQ=255) cGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCa < 2:1809609/150‑1 (MQ=255) cGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCa < 1:271136/150‑1 (MQ=255) gggCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAg < 2:1004608/150‑1 (MQ=255) ggCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGgcag < 2:36540/142‑1 (MQ=255) ggCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGgcag > 1:36540/1‑142 (MQ=255) cTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGcc < 1:2249014/150‑1 (MQ=255) tACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGc > 2:1480865/1‑53 (MQ=255) tACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGc < 1:1480865/53‑1 (MQ=255) tACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCa < 1:114592/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGc > 2:2276204/1‑90 (MQ=255) ccGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACGGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGc < 1:2276204/90‑1 (MQ=255) cGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCt > 1:495551/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGGTCGAGGTCGGCAAGCTTCTGGCTGGAAGCCGCCCGAGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCt > 2:1466004/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCtt > 1:703679/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCtt > 1:967884/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTc < 1:465573/150‑1 (MQ=255) aggtcgaggtggGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCGGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCg > 2:33098/1‑150 (MQ=255) aggtcgaggtcgGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCa > 2:502309/1‑73 (MQ=255) aggtcgaggtcgGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCa < 1:502309/73‑1 (MQ=255) aggtcgaggtcgGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCg > 2:2324362/1‑150 (MQ=255) aggtcgaggtcgGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCg > 1:1141063/1‑150 (MQ=255) gtcgaggtcgGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTc > 2:402033/1‑87 (MQ=255) gtcgaggtcgGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTc < 1:402033/87‑1 (MQ=255) aggtcgGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCg > 1:1569858/1‑150 (MQ=255) cgaGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCt < 1:1078980/148‑1 (MQ=255) cAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCATGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTg < 1:893951/150‑1 (MQ=255) aGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCACGGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCGATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTgc > 1:2016943/1‑150 (MQ=255) aGCNTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTgc > 2:1509925/1‑150 (MQ=255) tggctggcAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAgg < 2:1269338/150‑1 (MQ=255) gggctggcAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAgg < 2:1560368/149‑1 (MQ=255) ggctggcAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAggg > 1:156160/1‑150 (MQ=255) gctggcAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAGGGt > 1:1650861/1‑150 (MQ=255) ctggcAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCTGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAGGGTc > 2:54829/1‑150 (MQ=255) tggcAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAGGGTc < 1:828060/149‑1 (MQ=255) tggcAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAGGGTc > 2:828060/1‑149 (MQ=255) gcAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAGGGTCAgg < 2:156160/150‑1 (MQ=255) | GTATTGATTTGTACCGGGCTCAAGGCCCAGGCGGCGCGGCTGTCGCTGGCCAGCAGGCTCTTGCCGCTGCGGCTGCGCTGCGGACCCAGGGCCAGGTTGGCCGACCCCGGGCTACCGAGCAGGTCGAGGTCGGCCAGCTTCTGGCTGGCAGCCGCCAGGGCTGGCAGCCCCGGCAACTGGCTGGCCAGGTTCAGGCCCTTGAGCTTGTCCACTTCCATTTCGGCCAACGGCTCGTCCGGGGCCCCGGGCAGCAACCAGGCCAGCTTGTCGCTACCGGCTTTCTGCGCCAGGGTCAGG > NC_002947/1267107‑1267403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |