| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,425,662 | 0 | C | T | 9.0% | 373.3 / 19.8 | 133 | intergenic (+57/‑448) | PP_1249/PP_1250 | DUF4223 domain‑containing protein/group II intron‑encoding maturase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (67/54); new base T (6/6); total (73/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.68e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
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cccccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAg < 1:1080709/150‑1 (MQ=255) cccccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAg > 1:317971/1‑150 (MQ=255) cccccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAg < 2:317971/150‑1 (MQ=255) cccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt > 1:2296103/1‑96 (MQ=14) cccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt < 2:2296103/96‑1 (MQ=14) ccccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGGGGGCCGGAgg > 1:118288/1‑150 (MQ=255) ccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTtgtg < 1:1907343/81‑1 (MQ=14) ccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTtgtg > 2:2063086/1‑81 (MQ=14) ccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTtgtg < 1:2063086/81‑1 (MQ=14) ccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTtgtg > 2:1907343/1‑81 (MQ=14) ccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAgg > 1:1435225/1‑150 (MQ=11) cccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGa < 1:1339134/102‑1 (MQ=255) cccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGa > 2:1339134/1‑102 (MQ=255) cccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGc > 1:2400270/1‑150 (MQ=255) cGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCaa > 2:2258340/1‑150 (MQ=255) aTGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGgtg > 2:531006/1‑150 (MQ=255) | ACCTACGACTACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTG > NC_002947/1425516‑1425808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |