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ccccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGGGGGCCGGAgg > 1:118288/1‑150 (MQ=255) ccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTtgtg > 2:1907343/1‑81 (MQ=14) ccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTtgtg > 2:2063086/1‑81 (MQ=14) ccccGGCCATGTGCATGACCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTtgtg < 1:1907343/81‑1 (MQ=14) cccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGa < 1:1339134/102‑1 (MQ=255) cccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGa > 2:1339134/1‑102 (MQ=255) cccGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGc > 1:2400270/1‑150 (MQ=255) cGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCaa > 2:2258340/1‑150 (MQ=255) aTGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGgtg > 2:531006/1‑150 (MQ=255) acaTGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGAg > 1:1190112/1‑92 (MQ=255) acaTGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGAg < 2:1190112/92‑1 (MQ=255) acaTGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTcgc > 2:808491/1‑150 (MQ=39) acaTGGCCGGGGG‑TTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGtggtgg < 1:2057635/72‑1 (MQ=255) acaTGGCCGGGGG‑TTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGtggtgg > 2:2057635/1‑72 (MQ=255) | ACCTACGACTACCTGTTCCACCCTTCGGTTTCCATCTCCAAGATCATCGGTGGCTGCGGCCCGATCGATAAACTGCCTCAGCAGCAGTAATCTTGGCGGTACCCTGATCGCGACGCTTGCGGCGTGATCCAAGGCCCCCGGTCATGCACATGGCCGGGGGTTTTTGTGT‑‑GCGC‑‑CAGGC‑ATGGCGCGTTGCGCGTATGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCC‑AAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGC > NC_002947/1425516‑1425812 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |