| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,544,052 | G→T | 5.9% | G272W (GGG→TGG) | mdfA → | multidrug MFS transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,544,052 | 0 | G | T | 5.9% | 269.5 / 4.2 | 85 | G272W (GGG→TGG) | mdfA | multidrug MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/44); new base T (3/2); total (39/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.37e-01 | |||||||||||
GCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTG > NC_002947/1543903‑1544201 | gCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCg < 1:846101/150‑1 (MQ=255)gCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCATTTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCg < 1:157002/150‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCggg < 2:1524450/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGc < 1:1293319/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGc < 1:1876490/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGc < 2:255198/150‑1 (MQ=255) ccgccgCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCt > 2:1342445/1‑150 (MQ=255) cgccgcTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTg > 2:1832866/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTc < 2:1289587/150‑1 (MQ=255) cagCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGat < 1:837470/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTGTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGatca > 2:1280221/1‑150 (MQ=255) cgccCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑Caa < 1:1040668/150‑1 (MQ=255) cccTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTAGTTGTGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAAcc < 1:1145392/150‑1 (MQ=255) ttGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAAcc < 1:2293663/147‑1 (MQ=255) ttGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAAcc > 2:2293663/1‑147 (MQ=255) ggTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGa < 1:1342445/150‑1 (MQ=255) gTCGGATTGTCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCg < 2:1944756/121‑1 (MQ=255) gTCGGATTGTCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCg > 1:1944756/1‑121 (MQ=255) gATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCATGTCGCCGGTGCTGCTGATACACGATGAGGGGTTGAGTACCCTTGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTTCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCt > 2:272436/1‑150 (MQ=255) ccGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCg > 1:521975/1‑150 (MQ=255) cGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGc < 1:2426183/150‑1 (MQ=255) gCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGccc > 1:286276/1‑150 (MQ=255) cTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCACt > 2:1707555/1‑150 (MQ=255) aTTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGACTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTg > 2:331928/1‑150 (MQ=255) 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gCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTg < 2:381432/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGTTGCGTgg > 1:1923225/1‑150 (MQ=255) cTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCg > 2:1090681/1‑79 (MQ=255) cTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCg < 1:1090681/79‑1 (MQ=255) gTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCTCTGGTGCGTGgcgc < 2:521975/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGat < 1:26780/96‑1 (MQ=255) gCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGat > 2:26780/1‑96 (MQ=255) 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gATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTgg > 2:1136938/1‑142 (MQ=255) tCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACctggc < 2:1459294/150‑1 (MQ=255) tCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACctggc > 1:86352/1‑150 (MQ=255) aTGNGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGcc > 2:1509470/1‑150 (MQ=255) aTGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGcc < 1:1923804/150‑1 (MQ=255) aGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCtgt > 1:2262721/1‑150 (MQ=255) gggTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTg < 2:976703/118‑1 (MQ=255) gggTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTg > 1:976703/1‑118 (MQ=255) gggTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGc > 1:667388/1‑150 (MQ=255) gTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCt < 2:286276/150‑1 (MQ=255) aGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATg < 1:1707555/150‑1 (MQ=255) aGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCACTTGCCGGCTTTTCGCGGGCTGACGCTCGGTAACCTGATCAT‑CACCCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATg < 1:757664/150‑1 (MQ=255) gTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCTCTCTGGGCGGCTTGCCCTGGTGCGCGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCtggtgg > 2:565217/1‑150 (MQ=255) gTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATgg < 1:1832866/150‑1 (MQ=255) gTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATgg > 2:1944661/1‑150 (MQ=255) aaccTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTg > 1:2033682/3‑150 (MQ=255) 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tGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTgg < 1:208470/150‑1 (MQ=255) tGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTg < 1:331928/150‑1 (MQ=255) tGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTg < 2:667388/150‑1 (MQ=255) gCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTgg > 1:557587/1‑150 (MQ=255) ttGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTg > 1:848724/1‑94 (MQ=255) ttGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTg < 2:848724/94‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTg > 2:1021328/1‑81 (MQ=255) cGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGGGCTGTCGACCGCGTACTGGCACAGCgagg > 2:2343373/1‑147 (MQ=255) cGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGAAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGAACGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTTGCGCGCTCTCGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGa > 2:1148283/1‑150 (MQ=255) ggTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGAc > 2:2031141/1‑150 (MQ=255) ttttttGCTGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCa < 2:1459766/150‑1 (MQ=255) ttttttGCTGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCa < 2:1460149/150‑1 (MQ=255) ttttttGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCa < 1:1726177/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGtgtg < 2:1003118/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTgtggt < 1:1199497/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCAGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTgtggt < 1:1841648/150‑1 (MQ=255) gggCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAACCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTgtggtg > 2:2432835/1‑150 (MQ=255) | GCAACCGCCGCTTCGTTGCAGGCAGCGCCGCCCTTGGGTTGGTCGGATTGCCGCTGATTGGCTGGATTGGCCTGTCGCCGGTGCTGCTGATTCACGATGAGGGGTTGAGTACCCTGGAGTATGCCTTGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCAT‑CAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTG > NC_002947/1543903‑1544201 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |