| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,606,667 | G→T | 5.9% | intergenic (‑91/+21) | PP_t64 ← / ← PP_1408 | tRNA‑Gly/(R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,606,667 | 0 | G | T | 5.9% | 272.5 / 3.1 | 84 | intergenic (‑91/+21) | PP_t64/PP_1408 | tRNA‑Gly/(R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/40); new base T (2/3); total (41/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
GAATCGAACCCTCAACTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCGCAGGCGGTCTTGTTCTCCATG > NC_002947/1606518‑1606814 | gAATCGAACCCTCAACTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTg > 2:875681/1‑150 (MQ=255) cGAACCCTCAACTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTa < 1:613064/150‑1 (MQ=255) gAACCCTCAACTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTAc < 1:1999318/150‑1 (MQ=255) cTCAACTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGgc > 1:1043246/1‑150 (MQ=255) cTCAACTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGgc > 1:1892995/1‑150 (MQ=255) tCANCTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGgcg > 2:1511607/1‑150 (MQ=255) tCAACTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGgcg > 2:786630/1‑150 (MQ=255) cTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGa < 1:959458/150‑1 (MQ=255) tGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCa < 1:1268465/150‑1 (MQ=255) gggAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAg > 2:977719/1‑150 (MQ=255) ggAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGa < 1:1710860/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGc < 1:639981/150‑1 (MQ=255) ttgcGTTTTGCCAATAAACTATACGCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGACGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGcca > 2:31025/4‑148 (MQ=255) ttCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAATTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCaaa < 1:786630/150‑1 (MQ=255) tCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAat < 1:1109661/150‑1 (MQ=255) ttttGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAatgca > 1:815536/1‑150 (MQ=255) tttGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGCATTACCAGCCCAAGTTCTACCCAAGTTTGTCGGCGTCCCGTGGCCCTCGGTGATGTGCTTCAAGTCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAatgcgt < 2:2103136/150‑3 (MQ=255) cACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCAtgctgc < 2:59304/150‑1 (MQ=255) aCTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGcc > 1:676995/1‑150 (MQ=255) tAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGcccc > 1:316270/1‑150 (MQ=255) aCTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAg > 2:1565130/1‑110 (MQ=255) aCTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAg < 1:1565130/110‑1 (MQ=255) tataCCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCctgctg < 2:69984/150‑1 (MQ=255) ccGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTTGCTACAAGgc < 1:848168/105‑1 (MQ=255) ccGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTTGCTACAAGgc > 2:848168/1‑105 (MQ=255) ccGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTTGCTACAAGgc < 1:848181/105‑1 (MQ=255) ccGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTTGCTACAAGgc > 2:848181/1‑105 (MQ=255) ccGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAatgcatg > 2:76608/1‑133 (MQ=255) ccGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAatgcatg < 1:76608/133‑1 (MQ=255) ccGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACgg > 1:129182/1‑150 (MQ=255) ccGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACgg > 1:1659973/1‑150 (MQ=255) gCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCCTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCTAGCCGCTCAGATGGCAAATGCACGCCTTTCTTGCTGCACGGGt < 1:1263479/150‑1 (MQ=255) aTCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTg < 2:147663/150‑1 (MQ=255) aTCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTg < 1:1718898/150‑1 (MQ=255) tCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGCAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTg > 1:2410803/1‑83 (MQ=255) tCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTg < 2:2410803/83‑1 (MQ=255) gACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTgg > 2:1312806/1‑150 (MQ=255) aCTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGc > 2:101215/1‑150 (MQ=255) cTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCg > 1:207934/1‑150 (MQ=255) cAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCctgc < 1:970090/119‑1 (MQ=255) cAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCctgc > 2:970090/1‑119 (MQ=255) cAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTcac > 1:2226654/1‑150 (MQ=255) cAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTcac > 1:859169/1‑150 (MQ=255) aaCCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTcacgca > 1:1220797/1‑150 (MQ=255) aCCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTcacgcac < 2:1220797/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACgg > 1:2074343/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTAATGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCgggg < 2:2087915/139‑1 (MQ=255) cTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTAATGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCgggg > 1:2087915/1‑139 (MQ=255) cAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCctg < 2:185074/109‑1 (MQ=255) cAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCctg > 1:185074/1‑109 (MQ=255) cAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTg < 2:2074343/150‑1 (MQ=255) gCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGc > 2:877365/1‑150 (MQ=255) gCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGc < 2:129182/150‑1 (MQ=255) ttAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGACTTTGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAg < 1:855174/150‑1 (MQ=255) gAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGaa > 1:2363134/1‑150 (MQ=255) gCCCAAGTTATAGAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTAGAAGGCGCCGAGCCGCTCGGATGGCGAATGGCTGATGCACCCGCTGCAAGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGGTGACGCACTGTTGGCTTGAGGAAGcc > 2:672666/1‑150 (MQ=255) ccAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCa < 2:207934/150‑1 (MQ=255) cAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAatgcatgc < 1:2053920/85‑1 (MQ=255) cAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAatgcatgc > 2:2053920/1‑85 (MQ=255) aGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCa < 1:877365/150‑1 (MQ=255) gTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCctgc < 2:1704509/91‑1 (MQ=255) gTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCctgc > 1:1704509/1‑91 (MQ=255) gTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCAt < 2:1894314/150‑1 (MQ=255) tataAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGa < 2:316270/150‑1 (MQ=255) tataAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGa < 2:815536/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACAtt > 2:1387668/1‑150 (MQ=255) aGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCgg < 1:977719/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCACTGCTCCGGGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGtt < 1:1118700/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCa < 2:654961/78‑1 (MQ=255) cGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCa > 1:654961/1‑78 (MQ=255) gcgcCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCg > 1:1830221/1‑150 (MQ=255) ccccGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCGCAg < 1:1230592/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCGCAGGCg < 2:1830221/150‑1 (MQ=255) tGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCGCAGGCGGt > 1:1282397/1‑150 (MQ=255) cTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGGGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTtc < 1:914574/135‑1 (MQ=255) cTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGgt < 2:1804039/131‑1 (MQ=255) cTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGgt > 1:1804039/1‑131 (MQ=255) cTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTtc > 2:914574/1‑135 (MQ=255) gggTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAat > 2:6696/1‑41 (MQ=255) gggTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAat < 1:6696/41‑1 (MQ=255) tctATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCCGCTGGCAAAGCCAGGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCGCAGGCGGTCTTGTtctc < 2:190820/148‑1 (MQ=255) gTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCGCAGGCGGTCTTGTTCTcc < 2:1659973/150‑1 (MQ=255) gTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCCGGTGTTCTCGCAGGCGGTCGTGCTCTcc > 1:499354/1‑150 (MQ=255) ttGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCgg < 1:1366223/120‑1 (MQ=255) ttGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCgg > 2:1366223/1‑120 (MQ=255) ttGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCGCAGGCGGTCTTGTTCTCCATg > 1:1765070/1‑150 (MQ=255) ttGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGAACAAGCGGGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCGCAGGCGGTCTTGTTCTCCaga > 1:190820/1‑148 (MQ=255) | GAATCGAACCCTCAACTAAAGCTTGGGAAGCTTTCGTTTTGCCACTAAACTATACCCGCATCTGAGCTCGACTTTTTACCAGAACCTTCAGCGAATTAGAAGCCCAAGTTATAAAAAAGCTTGTCGGCGCCCCGTGGCCTGCGGGTATTGGCTACAAGGCGCCGAGCCGCTCAGATGGCAAATGCATGCTGCCCCTGCTGCACGGGTTGGTAACGTTGGCGGGGTTCACGCACGGTTGGCTTGAGGAAGCCCAGCATGACATTGCGGGTGTTCTCGCAGGCGGTCTTGTTCTCCATG > NC_002947/1606518‑1606814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |