| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,622,230 | G→A | 5.6% | E368K (GAG→AAG) ‡ | PP_1421 → | sensor histidine kinase TctE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,622,230 | 0 | G | A | 5.6% | 436.5 / 10.1 | 142 | E368K (GAG→AAG) ‡ | PP_1421 | sensor histidine kinase TctE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (64/70); new base A (4/4); total (68/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CCGAAGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCG > NC_002947/1622081‑1622378 | cGAAGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGTGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGGGCCGACATTGCTCAACGa > 1:1085270/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGa < 2:1359353/150‑1 (MQ=255) cGAAGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGATGAAATGTAGAGCCGACATTGCTCAACGa > 2:553183/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATAGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGa > 2:709134/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAg < 2:2280627/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttgtt > 2:1526128/1‑150 (MQ=255) gTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 2:2162103/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 2:1158254/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAg > 2:2393490/1‑150 (MQ=255) gcAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAG‑Caa < 2:2082688/150‑1 (MQ=255) gTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGCGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCt‑gg < 1:482682/150‑1 (MQ=255) tCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGa < 1:568732/132‑1 (MQ=255) tCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCATTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCt‑ggt > 1:2184156/1‑150 (MQ=255) cTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCt‑ggtg < 1:311939/150‑1 (MQ=255) tGGACTTGGGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGTCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCt‑ggtgg > 2:1276611/1‑150 (MQ=255) ggACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGa < 1:345682/150‑1 (MQ=255) ggACTTGAGTAAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGa < 2:1723937/150‑1 (MQ=255) gACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGAc > 1:2249600/1‑150 (MQ=255) cTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACaa > 1:1294698/1‑150 (MQ=255) gAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑c < 1:1602544/133‑1 (MQ=255) tCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCtt > 2:1371408/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGgc > 1:1100661/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa > 1:616718/1‑119 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 2:616718/119‑1 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACGATGCCTTGGCGCATAc > 1:2063980/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATAc > 1:489608/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGACGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATAc > 2:419651/1‑150 (MQ=255) cgcgAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACg > 2:548996/1‑150 (MQ=255) gcgAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGc < 2:925943/150‑1 (MQ=255) ggCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGTATGCGCCaaggcat < 2:1100661/150‑7 (MQ=255) ggCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGt > 2:1569060/1‑150 (MQ=255) ggCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGATGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGt < 1:1967478/150‑1 (MQ=255) ggCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCAGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttgtt > 1:1175683/1‑107 (MQ=255) ggCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCAGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttgtt < 2:1175683/107‑1 (MQ=255) gCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTg > 1:1723543/1‑150 (MQ=255) catggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTgg < 2:2414034/131‑1 (MQ=255) catggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTgg > 1:2414034/1‑131 (MQ=255) catggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTgg > 2:2347038/1‑150 (MQ=255) gccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGc > 1:638509/1‑140 (MQ=255) gccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAt > 1:201508/1‑150 (MQ=255) ggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGAt < 2:2360237/150‑1 (MQ=255) ccTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGgc > 2:285272/1‑119 (MQ=255) ccTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTg > 1:2234685/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGc > 2:784021/1‑150 (MQ=255) tttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGACGGGCACCGTG‑‑TAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg > 2:663873/1‑150 (MQ=255) tttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg < 2:603880/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCgg < 2:1411349/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCgg < 1:1632156/150‑1 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATg < 1:1371408/150‑1 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATg < 1:1274024/150‑1 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATg < 2:1131933/150‑1 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATg < 2:1946716/150‑1 (MQ=255) caAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGgc < 2:1963287/150‑1 (MQ=255) caAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGgc < 1:1181175/150‑1 (MQ=255) gcgctggcgctgGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtg < 1:1545203/150‑1 (MQ=255) gcgctggcgctgGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtg < 1:300832/150‑1 (MQ=255) gctggcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtgga < 1:1827226/150‑1 (MQ=255) gctggcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCcgga > 1:279039/1‑150 (MQ=255) ctggcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaa < 1:125323/150‑1 (MQ=255) ctggcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaa < 1:2347038/150‑1 (MQ=255) cgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtgg < 2:1294698/150‑1 (MQ=255) ctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtggaa < 1:34660/150‑1 (MQ=255) ggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAga < 2:2215225/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATATCTGGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacga > 1:1309342/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacgac < 1:452761/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacgac > 1:1939692/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTNGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgaagac > 1:223251/1‑150 (MQ=255) cGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACgg < 1:1531664/150‑1 (MQ=255) gAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACgg < 2:1850096/149‑1 (MQ=255) cgcCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCAGTTAATCCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAg < 1:663873/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGt > 1:1892942/1‑150 (MQ=255) gtgtGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTAtt < 1:1652982/150‑1 (MQ=255) tGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTgg < 1:548996/150‑1 (MQ=255) gAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGCCAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtg > 2:1230095/1‑115 (MQ=255) gggggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGa < 1:2432034/150‑1 (MQ=255) ggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgcg > 2:2141034/1‑150 (MQ=255) gAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgcgc < 2:1892942/150‑1 (MQ=255) gCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGa > 2:1601018/1‑150 (MQ=255) gCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGa > 1:1997812/1‑150 (MQ=255) ccGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGaa > 2:1368869/1‑150 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGa < 1:2450672/36‑1 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGa > 2:2450672/1‑36 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGa < 1:713709/141‑1 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACg > 1:2383349/1‑150 (MQ=255) gACATTGCTAAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACg < 1:709134/150‑1 (MQ=255) caggttGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaag > 2:1258130/5‑107 (MQ=38) caggttGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaag < 1:1258130/103‑1 (MQ=38) aCATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgg < 2:1723543/150‑1 (MQ=255) ggttGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg > 2:555371/3‑79 (MQ=37) ggttGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg < 1:555371/77‑1 (MQ=37) gggtGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATGTTGAGGGAACTGGCGCAAGCGTTTGCGGATGGGGGAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACggg > 1:281679/4‑150 (MQ=255) gttGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGgt > 1:1845533/2‑150 (MQ=255) gCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgc > 1:531181/1‑137 (MQ=255) cTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTc < 2:1755340/150‑1 (MQ=255) cAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGa > 2:2431787/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgg < 1:1039270/141‑1 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgg > 2:1039270/1‑141 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAg > 1:174510/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGGGGGGGTGTTCGAGCg < 2:344438/150‑1 (MQ=255) cGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCg < 1:1368869/150‑1 (MQ=255) | CCGAAGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCG > NC_002947/1622081‑1622378 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |