| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,622,234 | T→C | 6.2% | L369S (TTG→TCG) | PP_1421 → | sensor histidine kinase TctE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,622,234 | 0 | T | C | 6.2% | 394.7 / 10.1 | 129 | L369S (TTG→TCG) | PP_1421 | sensor histidine kinase TctE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/64); new base C (4/4); total (61/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTT > NC_002947/1622088‑1622381 | cGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttgtt < 1:612150/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 2:1158254/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 2:2162103/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAg > 2:2393490/1‑150 (MQ=255) gCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAG‑Caatgt < 2:1824751/150‑4 (MQ=255) gTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGCGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCt‑gg < 1:482682/150‑1 (MQ=255) tCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCATTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCt‑ggt > 1:2184156/1‑150 (MQ=255) tGGACTTGGGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGTCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCt‑ggtgg > 2:1276611/1‑150 (MQ=255) ggACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGa < 1:345682/150‑1 (MQ=255) ggACTTGAGTAAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGa < 2:1723937/150‑1 (MQ=255) gACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGAc > 2:1103850/1‑150 (MQ=255) gACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGAc > 1:2249600/1‑150 (MQ=255) cTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACaa > 1:1294698/1‑150 (MQ=255) gAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑c > 2:1602544/1‑133 (MQ=255) tCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCtt > 2:1371408/1‑150 (MQ=255) tCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCtt > 1:2215225/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGgc > 1:1100661/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGgc > 1:1261184/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 2:616718/119‑1 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACGATGCCTTGGCGCATAc > 1:2063980/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATAc > 2:1181175/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATAc > 1:489608/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGACGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATAc > 2:419651/1‑150 (MQ=255) cgcgAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACg > 2:548996/1‑150 (MQ=255) gcgAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGc < 2:925943/150‑1 (MQ=255) ggCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGt > 2:1569060/1‑150 (MQ=255) ggCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGATGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGt < 1:1967478/150‑1 (MQ=255) gCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTg > 1:1723543/1‑150 (MQ=255) catggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTgg < 2:2414034/131‑1 (MQ=255) catggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTgg > 1:2414034/1‑131 (MQ=255) catggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTgg > 2:2347038/1‑150 (MQ=255) atggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGc > 1:2446638/1‑150 (MQ=255) gccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGc > 2:1399748/1‑122 (MQ=255) gccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGc < 1:1399748/122‑1 (MQ=255) gccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGc > 1:638509/1‑140 (MQ=255) gccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGc < 2:638509/140‑1 (MQ=255) gccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAt > 1:201508/1‑150 (MQ=255) ggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGAt < 2:2360237/150‑1 (MQ=255) gcCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGAtttt > 1:2329044/1‑150 (MQ=255) ccTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGgc < 1:285272/119‑1 (MQ=255) ccTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGgc > 2:285272/1‑119 (MQ=255) ccTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTg > 1:2234685/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGc > 2:784021/1‑150 (MQ=255) tttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGACGGGCACCGTG‑‑TAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg > 2:663873/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCgg < 2:2184156/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCgg < 2:1411349/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCgg < 1:1632156/150‑1 (MQ=255) gcgcACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTa > 1:1755340/1‑150 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATg < 2:1946716/150‑1 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATg < 2:1131933/150‑1 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATg < 1:1371408/150‑1 (MQ=255) cacaAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATg < 1:1274024/150‑1 (MQ=255) caAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGgc < 2:1963287/150‑1 (MQ=255) caAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGgc < 1:1181175/150‑1 (MQ=255) ggggTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGTACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCa < 2:200721/150‑1 (MQ=255) gcgctggcgctgGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtg < 1:1103850/150‑1 (MQ=255) gcgctggcgctgGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtg < 1:1545203/150‑1 (MQ=255) gcgctggcgctgGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtg < 1:300832/150‑1 (MQ=255) gctggcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtgga < 1:1827226/150‑1 (MQ=255) gctggcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCcgga > 1:279039/1‑150 (MQ=255) ctggcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaa < 1:125323/150‑1 (MQ=255) gcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtg < 1:922644/150‑1 (MQ=255) cgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtgg < 2:1294698/150‑1 (MQ=255) cgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtgg < 1:2393490/150‑1 (MQ=255) ctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtggaa < 1:34660/150‑1 (MQ=255) tgttggCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGGGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtggaag > 1:344438/5‑150 (MQ=255) gCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacgac > 1:1939692/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacgac < 1:452761/150‑1 (MQ=255) cgcCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCAGTTAATCCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAg < 1:663873/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGt > 1:1892942/1‑150 (MQ=255) gtgtGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTAtt < 1:1652982/150‑1 (MQ=255) tgtgGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTc > 1:685458/1‑150 (MQ=255) tGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTgg < 1:548996/150‑1 (MQ=255) gAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGCCAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtg > 2:1230095/1‑115 (MQ=255) gAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtg < 1:1230095/115‑1 (MQ=255) ggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgcg > 2:2141034/1‑150 (MQ=255) gAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgcgc < 2:1892942/150‑1 (MQ=255) gCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGa > 2:1601018/1‑150 (MQ=255) gCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGa > 1:1997812/1‑150 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGa > 2:2450672/1‑36 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGa < 1:2450672/36‑1 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGa < 1:713709/141‑1 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACg > 1:2383349/1‑150 (MQ=255) caggttGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaag > 2:1258130/5‑107 (MQ=38) aCATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgg < 1:1569060/150‑1 (MQ=255) ggttGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg > 2:555371/3‑79 (MQ=37) ggttGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg < 1:555371/77‑1 (MQ=37) gttGCTCAACAACTCGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGgt > 1:1845533/2‑150 (MQ=255) gCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgc > 1:531181/1‑137 (MQ=255) cTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTc < 2:1755340/150‑1 (MQ=255) tCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCg > 2:2341818/1‑150 (MQ=255) cAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGa > 2:2431787/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgg > 2:1039270/1‑141 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgg < 1:1039270/141‑1 (MQ=255) cGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGGGGGGGTGTTCGAGCg < 2:344438/150‑1 (MQ=255) cGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCg < 1:1368869/150‑1 (MQ=255) ggttgttGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGt < 2:1924432/149‑1 (MQ=255) aGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtggaa < 2:525144/98‑1 (MQ=255) aGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAATGCtggaagtggaa > 1:525144/1‑98 (MQ=255) gttgttGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGtt > 2:569369/1‑150 (MQ=255) | CGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAG‑CAACCT‑GGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTT > NC_002947/1622088‑1622381 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |