| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,690,454 | G→A | 6.2% | T140M (ACG→ATG) ‡ | ydcS ← | polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,690,454 | 0 | G | A | 6.2% | 274.7 / 4.2 | 94 | T140M (ACG→ATG) ‡ | ydcS | polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/46); new base A (2/4); total (44/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
ATCGGCCCGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGTGACC > NC_002947/1690307‑1690603 | aTCGGCCCGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTg > 2:1620983/1‑150 (MQ=255) cccGTTATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCCTGCTGCTTTTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTa > 2:2300225/1‑150 (MQ=255) cccGTTATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCGGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTa > 2:2297091/1‑150 (MQ=255) cccGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTa > 1:616404/1‑150 (MQ=255) gTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTacac > 2:49735/1‑150 (MQ=255) gTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTacac > 2:49653/1‑150 (MQ=255) aTAGGCTTGCACGCGGCCCTTGGTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCGTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTaccagtg < 1:946961/150‑6 (MQ=255) aGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCt < 1:2023834/150‑1 (MQ=255) aGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTaccagtggg < 2:1027447/150‑8 (MQ=255) aGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTaccagtggg < 2:41425/150‑8 (MQ=255) cTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGt < 2:1447728/150‑1 (MQ=255) ttGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTc < 2:1383732/150‑1 (MQ=255) cACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGATAGACCTCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGAc < 1:2133231/150‑1 (MQ=255) cgGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACcaca < 2:616404/150‑1 (MQ=255) cgGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACcaca < 1:1727794/150‑1 (MQ=255) cccTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATAc < 1:1288281/150‑1 (MQ=255) cTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTg > 2:2422530/1‑121 (MQ=255) cTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTg < 1:2422530/121‑1 (MQ=255) cTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCa < 1:1259442/150‑1 (MQ=255) cTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCa > 2:841314/1‑150 (MQ=255) tttGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTa < 2:361707/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGATATCGGTGTTGTACAGCAGCAAGTATGCCCCCCACTCGTAAGGCGCGCAGCACACCGGCCTTTCTACCACATACCAGCTACCGttt > 2:1205145/1‑149 (MQ=255) ttGCCGTCGGAACGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTc > 2:1166693/1‑150 (MQ=255) tGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCt < 1:841314/150‑1 (MQ=255) cGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCa > 1:2229305/1‑150 (MQ=255) tCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAgg < 1:111530/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCgg < 1:383599/150‑1 (MQ=255) aGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGAc > 1:1570622/1‑119 (MQ=255) aGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGAc < 2:1570622/119‑1 (MQ=255) ttCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCg > 1:250222/1‑150 (MQ=255) cTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTATTTGAAGATATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGAt < 1:1205145/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCACGTGTAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGAt < 1:1841585/150‑1 (MQ=255) tGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCCGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCCCTGTGCCGGCGCGGGTCGATg > 1:721916/1‑150 (MQ=255) gCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTacca > 2:739724/1‑98 (MQ=255) gCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTacca < 1:739724/100‑3 (MQ=255) gCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAACACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTAGATGc > 1:2435521/1‑150 (MQ=255) cGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTcc < 1:151196/150‑1 (MQ=255) gAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCa < 1:49653/150‑1 (MQ=255) gAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCa < 1:49735/150‑1 (MQ=255) ccacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg < 1:1166693/150‑1 (MQ=255) ccacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg < 2:1141075/150‑1 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATAc > 1:936952/1‑106 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATAc < 2:936952/106‑1 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATg < 1:1990610/136‑1 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATg > 2:1990610/1‑136 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTggg > 1:963953/1‑150 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTACAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTggg > 2:1974362/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCa > 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gcgcCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGa < 1:1914041/150‑1 (MQ=255) cgcCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGAt < 1:2211068/150‑1 (MQ=255) gcCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGCAGTCCAGGCGCGGGTCGATGCTCGTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATc < 1:300047/150‑1 (MQ=255) tGAAGATATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGGCCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTa < 1:136756/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCa > 1:1251850/1‑109 (MQ=255) cGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCa < 2:1251850/109‑1 (MQ=255) 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< 2:1568066/50‑1 (MQ=255) agcagcACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTc < 2:1568125/50‑1 (MQ=255) agcagcACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTc > 1:1568066/1‑50 (MQ=255) agcagcACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTc > 1:1568125/1‑50 (MQ=255) gcagcaCGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGcc < 1:932168/150‑1 (MQ=255) caCGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAg > 2:1198389/1‑150 (MQ=255) gTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGa > 2:527730/1‑150 (MQ=255) tttGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg > 1:2135402/1‑94 (MQ=255) tttGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg < 2:2135402/94‑1 (MQ=255) tttGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTAGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGAt < 2:2435521/150‑1 (MQ=255) tGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGc < 2:720419/150‑1 (MQ=255) tGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGc < 2:250222/150‑1 (MQ=255) ccccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCg > 1:559198/1‑150 (MQ=255) ccccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCg > 1:1468633/1‑150 (MQ=255) ccccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCg > 1:559450/1‑150 (MQ=255) ccccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGAAGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCg > 1:2303462/1‑150 (MQ=255) cccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg > 1:1768248/1‑87 (MQ=255) cccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg < 2:1768248/87‑1 (MQ=255) cccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTACAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGc > 1:2385203/1‑150 (MQ=255) gtgTACGGCACGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCAGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGCGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCACTAAGCCGAAGCGCTGCATCGCCCGAg > 2:1695802/3‑150 (MQ=255) tACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCaa > 2:1422873/1‑121 (MQ=255) tACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCaa < 1:1422873/121‑1 (MQ=255) tACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCg < 2:1468633/150‑1 (MQ=255) tACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCg < 1:998988/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTTCCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGt < 1:1643864/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCTGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGTg < 2:1371059/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGTg > 1:2074241/1‑150 (MQ=255) gCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCt < 2:2229218/99‑1 (MQ=255) gCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCt > 1:2229218/1‑99 (MQ=255) gTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGTGAcc > 2:877659/1‑150 (MQ=255) | ATCGGCCCGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGTGACC > NC_002947/1690307‑1690603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |