Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,811,676 | T→A | 7.1% | T262S (ACG→TCG) | PP_1615 ← | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,811,676 | 0 | T | A | 7.1% | 438.5 / 18.7 | 140 | T262S (ACG→TCG) | PP_1615 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (66/64); new base A (5/5); total (71/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.75e-01 |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
CCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCT > NC_002947/1811529‑1811825 | cccGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAt > 2:938772/1‑150 (MQ=255) gcgAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑Tcg > 2:446589/1‑150 (MQ=255) cgAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑Tcgg < 1:28177/150‑1 (MQ=255) aaGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑Tcggcg < 2:322217/150‑1 (MQ=255) agagGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑Tcggcgg < 2:786270/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTg < 2:728223/150‑1 (MQ=255) gCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGCACCA‑ACCGCCGAAT‑ACGGCGGtatg > 1:2202298/1‑147 (MQ=255) cAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑Tcggcg > 2:557708/1‑143 (MQ=255) cAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑Tcggcg < 1:557708/143‑1 (MQ=255) aGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTgc < 1:1280126/150‑1 (MQ=255) tACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTgcgc < 2:1930061/150‑1 (MQ=255) agcaCATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGAAT‑ACGGCGGtatg < 2:756775/138‑4 (MQ=255) agcaCATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGAAT‑ACGGCGGtatg > 1:756775/1‑135 (MQ=255) acaTCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCagcagc < 1:469776/150‑1 (MQ=255) acaTCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCagcagc < 1:595090/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGacac < 2:2169668/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGacac > 1:684557/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACACCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCCAGCCACGGTTTTGATGCGGATACAGCGC‑CCATCCACCCGTATGTACTCGGTT‑GTGCGCCGCCAGCAGCGACAcc > 1:1224521/1‑150 (MQ=255) gTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATATAGCGC‑CCATACCGCCGAAT‑ACGGCGGtatgg < 1:1768755/129‑5 (MQ=255) gTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATATAGCGC‑CCATACCGCCGAAT‑ACGGCGGtatgg > 2:1768755/1‑125 (MQ=255) aGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑Tcggcg > 2:1492514/1‑120 (MQ=255) aGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑Tcggcg < 1:1492514/120‑1 (MQ=255) aGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAgcg > 1:279079/1‑150 (MQ=255) ccGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGca < 2:2327009/150‑1 (MQ=255) ccGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGca < 1:938772/150‑1 (MQ=255) ccGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGAAT‑ACGGCGGtatgg < 1:2391439/124‑5 (MQ=255) ccGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGAAT‑ACGGCGGtatgg > 2:2391439/1‑120 (MQ=255) aaCGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGcaccac > 2:2030922/1‑150 (MQ=255) aCGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACt > 2:1772284/1‑150 (MQ=255) gATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGt > 2:2066162/1‑150 (MQ=255) aTACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGtt < 1:439832/150‑1 (MQ=255) tACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTc < 2:1704649/150‑1 (MQ=255) aCTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCa < 2:930230/150‑1 (MQ=255) tCCGGCATCCCCTCTTGCCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGTGACACCAGCGCACCACTGTTCAgg < 2:1956035/150‑1 (MQ=255) tCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAgg > 1:1172570/1‑150 (MQ=255) cGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGgtg > 1:1732684/1‑150 (MQ=255) ggCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGgtgt < 1:2258748/150‑1 (MQ=255) aaCCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTcc < 1:1888510/150‑1 (MQ=255) ccccGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAg > 2:569777/1‑150 (MQ=255) ccccGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTCGGTGCGACCCCAGCAGACAAACCATCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAg > 2:2091366/1‑150 (MQ=255) cccGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTc < 2:1185330/146‑1 (MQ=255) cccGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTc > 1:1185330/1‑146 (MQ=255) cccGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGc > 1:1184629/1‑150 (MQ=255) ccGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGca > 2:121030/1‑128 (MQ=255) ccGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCa > 1:1070965/1‑150 (MQ=255) ccGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGAGGGGTGGTGCGCCTCCAGCTACGACACCAACGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCa > 1:1206888/1‑150 (MQ=255) cGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCAc > 1:1957708/1‑150 (MQ=255) cGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCAc > 1:1855345/1‑150 (MQ=255) gCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACg < 1:791392/150‑1 (MQ=255) cAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACgta > 1:2080631/1‑150 (MQ=255) cAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACgta < 2:1008463/150‑1 (MQ=255) aaCCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACgtag < 2:651353/150‑1 (MQ=255) ctcctTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAg > 1:716857/1‑129 (MQ=255) aGGTGATTCACCAGGCGCCGTACCTGCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAAc > 2:1852130/1‑150 (MQ=255) aGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAAc > 1:1734138/1‑150 (MQ=255) gTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTg > 1:934827/1‑150 (MQ=255) tAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTgg < 1:1259928/150‑1 (MQ=255) aTCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAg < 2:1078583/117‑1 (MQ=255) aTCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAg > 1:1078583/1‑117 (MQ=255) tCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGcac > 2:4933/1‑150 (MQ=255) tCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGcac > 1:430287/1‑150 (MQ=255) caccaGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACaa < 2:535133/150‑1 (MQ=255) caccaGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGAGACTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGACGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGGGACACCAGCGCAGTACTGTTCAGGTGTTTGAGCACGTCGTATTTGGTGACCTGGCACaa > 1:1695789/1‑150 (MQ=255) caccaGCCGCCGTAACTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACaa > 2:1799360/1‑150 (MQ=255) accaGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAg > 2:2006228/1‑113 (MQ=255) accaGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAg < 1:2006228/113‑1 (MQ=255) accaGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAAc > 1:1534100/1‑150 (MQ=255) accaGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAAc < 2:2080631/150‑1 (MQ=255) caGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAAccc > 1:909504/1‑150 (MQ=255) gccgccGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGa > 1:1539214/1‑150 (MQ=255) gccgTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTc > 1:254657/1‑150 (MQ=255) cTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATc > 1:178678/1‑120 (MQ=255) ttCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACATCAGCGCACCACTGTTCAGGTGtt < 2:1184777/103‑1 (MQ=255) cGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAgcgc < 2:1539214/150‑1 (MQ=255) gCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTcc > 2:834892/1‑101 (MQ=255) gCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTcc < 1:834892/101‑1 (MQ=255) ggTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCa < 2:684557/150‑1 (MQ=255) gTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCCCACCACTGTTCAg < 2:938309/87‑1 (MQ=255) tGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGc > 2:1441001/1‑150 (MQ=255) ctgctgCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGc < 1:2091366/150‑1 (MQ=255) tgctgcGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAAcc > 1:621079/1‑118 (MQ=255) tgctgcGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGcc < 2:1172570/150‑1 (MQ=255) ctgcGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCtt < 1:1852130/150‑2 (MQ=255) tgcGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTg < 2:127625/107‑1 (MQ=255) gATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCAc > 1:989764/1‑150 (MQ=255) aTACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCaa > 2:1789597/1‑99 (MQ=255) aTACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCaa < 1:1789597/99‑1 (MQ=255) cAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGtt < 2:279079/150‑1 (MQ=255) aGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTg > 1:1707313/1‑150 (MQ=255) aGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTg > 2:904619/1‑150 (MQ=255) cgc‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCa > 1:2282993/1‑150 (MQ=255) gc‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCCCGTGGTAATCAGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAg > 1:541868/1‑150 (MQ=255) gc‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAg < 2:168338/150‑1 (MQ=255) gc‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAAAGACACCGGCGCACCACAGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAg > 2:868100/1‑150 (MQ=255) c‑ccATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAgc < 1:1441001/150‑1 (MQ=255) ccATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAgcg > 1:1019800/1‑150 (MQ=255) tACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGACTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAGCGCCa < 2:2135692/150‑1 (MQ=255) cgccgTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGtt > 2:288084/1‑150 (MQ=255) tAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCATCTCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCt < 1:1195736/150‑1 (MQ=255) tAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCt > 2:1548495/1‑150 (MQ=255) | CCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTTCAGGTAATCCACCAGCCGCCGTACCTTCGGCGACAGGTGCCTCTGCTGCGGATACAGCGC‑CCATACCGCCGTAT‑TCGGCGGTTGGTGCGCCTCCAGCAGCGACACCAGCGCACCACTGTTCAGGTGTTCCAGCACGTAGTAATCCGGCAACTGGCACAACCCGATTCCTTGCAGCGCCGCATCCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCT > NC_002947/1811529‑1811825 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |