| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 198,367 | G→C | 12.1% | V1291V (GTG→GTC) | PP_0168 → | putative surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 198,367 | 0 | G | C | 12.1% | 280.6 / 27.0 | 99 | V1291V (GTG→GTC) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/44); new base C (5/7); total (48/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.67e-01 | |||||||||||
TTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCGGCCACTGT > NC_002947/198219‑198513 | ttGATGCAGGCTCCCTCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCCCCTTCGAGTAGCTGGTCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCCGACACTGTCAGTGAAGTGGTGGCCAACGTGACTGCCACC‑ACTTCGGTGa < 2:113200/150‑1 (MQ=255) gCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACCGCCTTCGGTCACCGAAggg < 2:1419838/150‑2 (MQ=255) gCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCg < 1:2271879/150‑1 (MQ=255) gCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCg > 2:751020/1‑150 (MQ=255) cTCCATCACGCTCAGTGTGACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCgg < 2:409330/150‑1 (MQ=255) tCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGt < 2:562273/150‑1 (MQ=255) tCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTCACCGAAggggtg < 2:2027133/150‑5 (MQ=255) tCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGATGACCGAAGGCGGt > 1:79139/1‑150 (MQ=255) cATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTga > 1:2222605/1‑150 (MQ=255) cATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTga < 2:309026/150‑1 (MQ=255) aTCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTgag < 1:963443/150‑1 (MQ=255) aTCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTCACCGAAggggtggca < 1:1632146/150‑8 (MQ=255) tCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTgaga > 1:2324501/1‑150 (MQ=255) gCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc > 2:27332/1‑150 (MQ=255) cTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAcc < 2:2324501/150‑1 (MQ=255) aGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTac < 1:751020/150‑1 (MQ=255) gtgtTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTaca > 2:643156/1‑150 (MQ=255) aCCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTg > 2:1926654/1‑133 (MQ=255) aCCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTg < 1:1926654/133‑1 (MQ=255) gACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCAcc > 1:2294746/1‑150 (MQ=255) gACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCAcc < 1:2025159/150‑1 (MQ=255) tACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGAc < 2:292527/150‑1 (MQ=255) tACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTCACCGAAgggg > 2:1204141/1‑120 (MQ=255) tACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTCACCGAAgggg < 1:1204141/122‑3 (MQ=255) cAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTg > 2:2188360/1‑123 (MQ=255) cAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTg < 1:2188360/123‑1 (MQ=255) aGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACcaa < 2:276938/150‑1 (MQ=255) ttCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACcaaca > 1:2043331/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTCACCGAAgggg < 2:1951954/117‑3 (MQ=255) ttCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTCACCGAAgggg > 1:1951954/1‑115 (MQ=255) ttCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTAGGGCGGCACGGCTACCGTTGAGAGCTCGGACCCTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAGCTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACcaaca > 2:450281/1‑150 (MQ=21) tCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACcaacaa < 1:2046373/150‑1 (MQ=255) gggTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGa < 1:204751/150‑1 (MQ=255) ggTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGAc < 2:2222605/150‑1 (MQ=255) ggagaAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCCCCCTGCCCAACCAAGACGGTCTGCCGAt < 2:487576/149‑1 (MQ=255) 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gCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGa < 1:1710571/122‑1 (MQ=255) gCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATaa < 2:1525652/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACCATCAGTGAAGAGGTGGCCAAACTGACTGGCACC‑CCTTCGGAGACCGAAGGCGGAGCGAGCACCTACACCATCACCCTGACCGACAAAGACGGTGTGCCGATCAATAAc > 2:569898/1‑150 (MQ=21) tGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAAcc > 2:1782976/1‑150 (MQ=255) ttGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCg > 2:2136842/1‑150 (MQ=255) gTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGc < 1:1217253/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGt > 1:1781850/1‑150 (MQ=255) cccGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTa > 1:970859/1‑150 (MQ=255) ccGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACCGCCTTCGGTCACCGAAgggg > 1:1296421/1‑78 (MQ=37) ccGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACCGCCTTCGGTCACCGAAgggg < 2:1296421/80‑3 (MQ=37) ccGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATaa > 1:18485/1‑134 (MQ=255) ccGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATaa < 2:18485/134‑1 (MQ=255) ccGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTAc < 2:711960/150‑1 (MQ=255) cGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGa < 2:703676/98‑1 (MQ=255) cGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGa > 1:703676/1‑98 (MQ=255) cGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGCCGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCt < 1:557050/150‑1 (MQ=255) cGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCt > 1:215841/1‑150 (MQ=255) gTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTg > 1:1276361/1‑150 (MQ=255) gTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTg > 2:1749077/1‑150 (MQ=255) ttGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTAc < 1:1556967/140‑1 (MQ=255) ttGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTAc > 2:1557056/1‑140 (MQ=255) ttGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTAc > 2:1556967/1‑140 (MQ=255) ttGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTAc < 1:1557056/140‑1 (MQ=255) ttGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGGTGTGGCCAAACTGCCTGCGACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCCCCCTGACCAACCAAGCCGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGa < 2:227496/150‑1 (MQ=17) gagaTCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGAcc > 2:1865523/1‑150 (MQ=255) agaTCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCg > 1:871644/1‑150 (MQ=255) gaTCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGa < 2:970859/150‑1 (MQ=255) 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acTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCactact < 2:1272242/150‑1 (MQ=255) tGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTTTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTcgtcgt < 1:2019065/150‑1 (MQ=255) aaGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTgg > 2:244393/1‑150 (MQ=38) gtggtgGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCa < 2:2294746/150‑1 (MQ=39) tggtggCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAg < 1:450281/150‑1 (MQ=37) ggCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCt > 2:2091032/1‑105 (MQ=33) ggCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCt < 1:2091032/105‑1 (MQ=33) gCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGACGGCGGTTAGCTCACCTACACCATCACCCTAACCAACAAAGAAGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCacc > 1:460169/1‑148 (MQ=11) ccAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGA‑CTAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACTGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTcgtcgt > 2:1793651/1‑138 (MQ=255) ccAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGA‑CTAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACTGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTcgtcgt < 1:1793651/138‑1 (MQ=255) cAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAg > 1:1560114/1‑150 (MQ=38) actgactgCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGcac > 1:138349/1‑150 (MQ=37) tgactgCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTg > 2:36126/1‑134 (MQ=37) tgactgCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTg < 1:36126/134‑1 (MQ=37) ccACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCCGCCAACAGCACCACCGGtt > 2:766898/1‑150 (MQ=25) cACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGcacca < 2:1105110/143‑1 (MQ=35) cACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGcacca > 1:1105110/1‑143 (MQ=35) cACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTc < 2:138349/150‑1 (MQ=37) accgccTTCGGTCACCGAAGG‑GGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCg > 2:533215/5‑150 (MQ=255) accgccTTCGGTCACCGAAGG‑GGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCg > 1:1596672/5‑150 (MQ=255) aCC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCg > 2:476298/1‑150 (MQ=35) aCC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCg < 1:470527/150‑1 (MQ=35) cgccTTCGGTCACCGAAGG‑GGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCGGc < 2:1596672/148‑1 (MQ=255) ttCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCANCAAAGACGGTCTGCCGATAAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGAACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCGGCCAc > 1:133359/1‑150 (MQ=25) ttCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCGGCCAc > 1:1007826/1‑150 (MQ=35) ggTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCGGCCACTGt > 2:425909/1‑150 (MQ=35) | TTGATGCAGGCTCCATCACGCTCAGTGTTACCGACGCTACAGTTCCGGGTGCCACCTTCGAGAAGCTGGCCTTGGGTGGCCCGGCTACCGTTGAGATCTCGGACACTATCAGTGAAGTGGTGGCCAAACTGACTGCCACC‑CCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATCAATAACCACTCGGAGCTGTACTTCAAGCTGACCGATGGCACTACTGTCGTCGTGGCAGCCAACAGCACCACCGGTTCGGCCACTGT > NC_002947/198219‑198513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |