| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,038,755 | G→A | 5.5% | V256V (GTC→GTT) | rffE ← | UDP‑N‑acetylglucosamine‑2‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,038,755 | 0 | G | A | 5.5% | 270.5 / 4.4 | 91 | V256V (GTC→GTT) | rffE | UDP‑N‑acetylglucosamine‑2‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/35); new base A (2/3); total (53/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
GCACCGGTTTGCCCAGGGCCGGCGCTTCCTCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAGCAACAG > NC_002947/2038607‑2038901 | gCACCGGTTTGCCCAGGGCCGGCGCTTCCTCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGa > 2:2337182/1‑150 (MQ=255) tGCCCAGGGCCGGCGCTTCCTCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTCAACCGGCtgtt < 1:1712450/150‑4 (MQ=255) cccAGGGCCGGCGCTTCCTCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTCAACCGGCtgttgg < 2:2193103/150‑6 (MQ=255) ccAGGGCCGGCGCTTCCTCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCa > 2:265056/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCGGCGCTTCCTCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAACGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGCCTCGCGCa > 1:88410/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGCTTCCGCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTg < 1:864349/150‑1 (MQ=255) cTTCCTCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGa < 1:1260795/150‑1 (MQ=255) ttCCTCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAg < 2:305349/150‑1 (MQ=255) cgcctGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACAGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACCTCCCCCGACAGCCTCGTGACCGGCTCTGGCACGGTTGGGGTGAGGTg > 2:1946883/3‑150 (MQ=255) ctGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGAc > 1:946701/1‑150 (MQ=255) aaTGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCgg > 2:446962/1‑150 (MQ=255) tGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCgg > 2:1507451/1‑148 (MQ=255) tGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCgg < 1:1507451/148‑1 (MQ=255) cACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTaca > 1:172040/1‑150 (MQ=255) aCCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCAc < 1:1641501/123‑1 (MQ=255) aCCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCAc > 2:1641501/1‑123 (MQ=255) aCCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTg > 2:460540/1‑138 (MQ=255) aCCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTg < 1:460540/138‑1 (MQ=255) aCCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTacac > 2:239291/1‑150 (MQ=255) ccGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTg > 1:2138703/1‑125 (MQ=255) ccGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTg < 2:2138703/125‑1 (MQ=255) ccGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTAcaccc > 2:248292/1‑149 (MQ=255) cGAGTCGGTCAGAATCACATAGCCCCGGGTTATGAGGTAAACGAACTGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTAcaccac < 2:414542/150‑1 (MQ=255) gTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGTACCCGGTCcacctcaac < 2:2216926/150‑6 (MQ=255) gTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTc < 2:172040/150‑1 (MQ=255) tCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCTACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTcc < 2:1417900/150‑1 (MQ=255) tCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTAcacc > 2:2048405/1‑144 (MQ=255) tCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTAcacc < 1:2048405/144‑1 (MQ=255) gTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGa > 2:1322983/1‑130 (MQ=255) gTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGa < 1:1322983/130‑1 (MQ=255) gTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAAc > 1:1103606/1‑150 (MQ=255) gTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAAc > 1:686401/1‑150 (MQ=255) tCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACt > 1:1859602/1‑150 (MQ=255) cAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTc < 2:1103606/150‑1 (MQ=255) aaTCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCggg < 1:851541/150‑1 (MQ=255) tCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGTGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGa > 1:1310001/1‑150 (MQ=255) tCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGa > 1:1779511/1‑150 (MQ=255) ggCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCg < 1:48084/150‑1 (MQ=255) gCCNGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGAACGGATACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGt > 2:1498203/1‑150 (MQ=255) gCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGt < 1:2332884/150‑1 (MQ=255) ccGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTg < 2:1748756/82‑1 (MQ=255) ccGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTg > 1:1748756/1‑82 (MQ=255) gggTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCaa > 1:1130972/1‑150 (MQ=255) gggTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCaa > 1:2088080/1‑150 (MQ=255) gTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATc > 1:246762/1‑150 (MQ=255) tCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCt > 1:1521058/1‑150 (MQ=255) aTGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCAAGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGc > 2:302120/1‑150 (MQ=255) tGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCa > 2:2371351/1‑150 (MQ=255) gggaaaCGAACGGGAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCa < 2:88410/147‑1 (MQ=255) ggTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCa > 2:2246454/1‑150 (MQ=255) gTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAg > 1:1890257/1‑150 (MQ=255) gCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCtatgtga < 2:1779511/150‑7 (MQ=255) gCAGGTAATCCAGCGGCTCGACGAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGa < 2:178983/150‑1 (MQ=255) cAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACNCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGAt < 1:1885087/150‑1 (MQ=255) tAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGTATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATgcgc < 1:1942067/150‑1 (MQ=255) cAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGaa > 1:1849173/1‑150 (MQ=255) cAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGaa < 1:780131/150‑1 (MQ=255) cAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGaa < 2:2142577/150‑1 (MQ=255) cAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGaa > 1:1699350/1‑150 (MQ=255) gCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGACGTGGACCTGGTACACCACGTCACACTCAGGGAATAGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAgc > 1:756960/1‑150 (MQ=255) cGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGccac < 1:2337182/150‑1 (MQ=255) gACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCCCGCGGAGGTCGAGCGGGTCCGGATACAGCACATCCACCTCGGGAAATTACCGTGCAATCCGCACCAGGACCACGCAGAGCCGCTCGAACCCGccacc > 2:192345/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCaaa < 2:946701/150‑1 (MQ=255) aGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAg > 1:160508/1‑150 (MQ=255) gATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTtctc < 2:1890257/150‑1 (MQ=255) gATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTtctc > 1:1852113/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTcg > 2:1749196/1‑150 (MQ=255) 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tCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggt > 2:1833053/1‑150 (MQ=255) caTCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggt < 1:548838/147‑1 (MQ=255) caTCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggt > 2:548838/1‑147 (MQ=255) aTCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggtggcc > 2:470908/1‑150 (MQ=255) aTCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggtggcc > 2:462097/1‑150 (MQ=255) aTCCCCCAACAGCCGGTTGACCGCCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggtggcc > 1:2226370/1‑150 (MQ=255) tCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggtggccg < 2:246762/150‑1 (MQ=255) cccccAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggtggccgg < 2:1130972/150‑1 (MQ=255) tgcgcgaGCCGGTCAACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCTGGTACACCACGTCCAACTCGGGGCATTGAAGTGCAATCTGCAAAAAAGTAGGCCAGAATCGCGCTAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggtggccggtg < 1:646677/144‑1 (MQ=255) cccAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggtggccggtg < 1:114049/150‑1 (MQ=255) cccAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggtggccggtg > 1:1417773/1‑150 (MQ=255) cccAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGAAGCTCGATAACGCCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCCATCGGACCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCgccggtggccggtg > 1:1637627/1‑150 (MQ=255) cgcgaGCCGGTCAACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCTGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGaa > 2:646677/5‑149 (MQ=255) gaGCCGGTCAACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAg > 1:228914/2‑150 (MQ=255) cAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAg > 1:1476227/1‑150 (MQ=255) cAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAg < 1:950208/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAg < 1:2371351/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAGc < 2:1417773/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAGCaa < 2:1849173/150‑1 (MQ=255) ggTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAGCAACa > 2:1625414/1‑150 (MQ=255) gTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAGCAACAg > 1:1303182/1‑150 (MQ=255) | GCACCGGTTTGCCCAGGGCCGGCGCTTCCTCCTGAATGCCACCCGAGTCGGTCAGAATCACATAGGCCCGGGTCATGAGGTAAACGAACGGCAGGTAATCCAGCGGTTCGACAAGGTGGATGTTGCTCACATCCCCCAACAGCCGGTTGACCGGCTCGCGCACGTTGGGGTTGAGGTGGACCGGGTACACCACGTCCAACTCGGGGAATTGCCGTGCAATCTGCACCAGGGCCTGGCAGATGCGCTCGAAGCCGCCACCAAAGTTCTCGCGCCGGTGGCCGGTGACCAGCAACAG > NC_002947/2038607‑2038901 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |