| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,418,700 | C→T | 11.2% | G564G (GGC→GGT) | PP_2119 → | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,418,700 | 0 | C | T | 11.2% | 199.0 / 12.8 | 78 | G564G (GGC→GGT) | PP_2119 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/34); new base T (4/5); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
CTTGATGCACAAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGAC > NC_002947/2418551‑2418847 | cTTGATGCACAAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAAGGCCGGCTGGTGGCGGTTGGc > 1:250118/1‑150 (MQ=255) tGATGCACAAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGcac < 2:2395628/150‑1 (MQ=255) gATGCACAAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGcacc > 2:1525497/1‑150 (MQ=255) gCACAAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGcacccac > 1:2384255/1‑150 (MQ=255) gCACAAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCAGCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGcaccctc < 1:1635694/150‑3 (MQ=255) cacaAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCAGATGGCCGGCCGTACCGTGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGcacccacc < 1:1117501/150‑1 (MQ=255) acaAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCg > 2:21860/1‑150 (MQ=255) caAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGTGCCCACCgc < 1:250532/150‑2 (MQ=255) caAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGCCCGTCTGGTGGCGGTGGGTGCCCACCgc < 1:2157952/150‑2 (MQ=255) aGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAg < 1:1402645/150‑1 (MQ=255) gTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGt > 1:1834895/1‑150 (MQ=255) gTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGt < 1:1050195/150‑1 (MQ=255) gTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGt < 2:28077/150‑1 (MQ=255) gAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGttg < 1:21860/150‑1 (MQ=255) aaTACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGttga > 1:430602/1‑150 (MQ=255) tACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGCGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGttgatt < 2:1250084/150‑1 (MQ=255) ttGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAg > 2:1528961/1‑150 (MQ=255) ttGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGGGGCGGTGGGCACCCACCGTCAATTGATTGAg > 1:847690/1‑150 (MQ=255) ttGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCACCTGGCCACGGTACAGCATGCCGCGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAg > 2:1120865/1‑150 (MQ=255) aTCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGTGCCCACCgc < 2:1698888/135‑2 (MQ=255) aTCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGTGCCCACCgc > 1:1698888/1‑134 (MQ=255) ccAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAg > 2:1835261/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGc > 2:993175/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGc < 2:56982/150‑1 (MQ=255) cAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGc > 2:825897/1‑150 (MQ=255) cTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTAt < 1:1982121/150‑1 (MQ=255) cccAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAg < 1:1488946/132‑1 (MQ=255) cccAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAg > 2:1488946/1‑132 (MQ=255) cccAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATgcg > 1:2049290/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATgcgc > 2:37111/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAg < 2:288796/121‑1 (MQ=255) cAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAg > 1:288796/1‑121 (MQ=255) aGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCgg > 1:1511957/1‑150 (MQ=255) tGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTgg < 1:2041318/150‑1 (MQ=255) ccggccgTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGAGGTGGGTACCCACCGTCAGTGGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAgcgc > 1:2379839/1‑150 (MQ=255) tACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAAtt > 2:1704073/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGt < 2:947928/101‑1 (MQ=255) cACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGt > 1:947928/1‑101 (MQ=255) cACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTcac < 2:651916/150‑1 (MQ=255) cACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTcac > 2:2428575/1‑150 (MQ=255) cACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTcac > 2:2114130/1‑150 (MQ=255) tGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAgcg > 2:2085198/1‑131 (MQ=255) tGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAgcg < 1:2085198/131‑1 (MQ=255) tagtgtCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCAGTTGAAAGAGCGGATGACCGCACTGCTGTTCACCACTGGCGAGCgt > 1:82224/6‑150 (MQ=255) ccATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCgtgt > 1:1500235/1‑150 (MQ=255) ccATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCgtgt > 2:970331/1‑150 (MQ=255) cGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTg < 1:1455546/150‑1 (MQ=255) cTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCgt < 1:1809997/141‑1 (MQ=255) cTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCgt > 2:1809997/1‑141 (MQ=255) ccACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGt > 2:946255/1‑150 (MQ=255) aCAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACAttt < 1:1811590/150‑1 (MQ=255) aTGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTgta < 1:1525497/150‑1 (MQ=255) aTGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTgta < 2:430602/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTgtagta > 2:922094/1‑150 (MQ=255) aGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAAtt < 2:1361044/150‑1 (MQ=255) aGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAAtt < 1:1120865/150‑1 (MQ=255) aGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAAtt < 1:468508/150‑1 (MQ=255) cgcATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGc < 2:837826/150‑1 (MQ=255) cgcATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGc < 1:2390474/150‑1 (MQ=255) cATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCt < 1:1704073/150‑1 (MQ=255) cATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCt > 1:2008443/1‑150 (MQ=255) cATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCt > 1:1119956/1‑150 (MQ=255) tCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTc > 2:1668371/1‑98 (MQ=255) tCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTc < 1:1668371/98‑1 (MQ=255) tCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTga < 2:1834895/150‑1 (MQ=255) tCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTga > 1:835354/1‑150 (MQ=255) cGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGc < 1:922094/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCt > 1:1169329/1‑150 (MQ=255) aCCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCt > 1:1299436/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTc > 1:2123236/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCa > 2:2046146/1‑150 (MQ=255) gggCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTNAAc < 2:1511957/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTACCTGAGAAGATTTGCCTCAACt > 2:409346/1‑150 (MQ=255) cGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCCGCGCTGCCATTCACCTCGGGCTTGCGTGTCGAGTCCCTTGAACATTTCTGTAGTAATTGCCTTAGAAGATTTGCCTCAACTGtt < 2:2103304/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGGGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGNCTTGNAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGtt < 1:409346/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGGTTGGCACCCACCGTCAGTTGATTGATGACAGGCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTTCAATTCACCACGTGCGGGCTTGTCGCTGTCTTGTAACGTTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCTTTAACTGTTGcc < 2:1169329/150‑2 (MQ=255) tggtggCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGt > 1:819008/1‑150 (MQ=255) ctgacGGTGGGTGCCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTaa < 2:2395454/146‑1 (MQ=255) ctgacGGTGGGTGCCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTaa > 1:2395454/5‑150 (MQ=255) tgacGGTGGGTGCCCACCGCCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCt > 2:1949101/4‑108 (MQ=255) tgacGGTGGGTGCCCACCGCCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCt < 1:1949101/105‑1 (MQ=255) ggCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGATAAGCTTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGt < 2:847690/150‑1 (MQ=255) gTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTc < 1:669848/150‑1 (MQ=255) ggCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGAc < 2:2123236/150‑1 (MQ=255) | CTTGATGCACAAAGTGAATACTTGATCCAGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGAC > NC_002947/2418551‑2418847 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |